哈蟆油与蟾蜍油蛋白质组数据分析

发布时间：2022-02-18 00:56

　　旨在筛选哈蟆油和蟾蜍油中特异性的蛋白质,发现这些差异蛋白与生长环境、冬眠及发育的关系。采用i TRAQ结合质谱技术建立哈蟆油和蟾蜍油蛋白质组数据库,通过比较两个蛋白质组数据库,对筛选的差异蛋白进行Gene ontology功能注释和生物信息学分析。结果表明,差异表达蛋白的总数为68个,其中上调蛋白61个,下调蛋白7个。哈蟆油中含量较高的7个差异蛋白主要分为五大类,黏蛋白类（PREDICTED:mucin-5AC-like,PREDICTED:similar to mucin,mCG142254, partial）、胶原蛋白（collagen alpha-1（Ⅲ） chain）、α激酶锚定蛋白13样（PREDICTED:a-kinase anchor protein 13-like）、免疫球蛋白Fc段连接蛋白样（PREDICTED:IgGFc-binding protein-like）、膜联蛋白（annexin A1）,以上蛋白主要参与免疫调节、生长发育等过程;同时发现哈蟆油中抗冻成分主要为黏蛋白类,而蟾蜍油中主要为凝集素。哈蟆油中含量较高的7个差异蛋白质可作为哈蟆油区别于蟾蜍油的重要成... 

【文章来源】：中国农学通报. 2020,36(26)

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 仪器和试剂
    1.3 方法
        1.3.1 蛙油提取
        1.3.2 蛋白质提取
        1.3.3 iTRAQ定量
        1.3.4 差异蛋白筛选
        1.3.5 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 蟾蜍油与哈蟆油差异蛋白筛选结果
        2.1.1 蟾蜍油中含量较高的特异性成分（上调蛋白）
        2.1.2 哈蟆油中含量较高的特异性成分（下调蛋白）
    2.2 WEGO注释分析结果
        2.2.1 细胞组分分析
        2.2.2 分子功能分析
        2.2.3 生物学过程分析
    2.3 KEGG代谢通路分析
3 讨论与结论
    3.1 生活习性的差异
    3.2 抗冻成分差异
    3.3 哈蟆油特异性膨胀度
    3.4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]膜联蛋白A1生理功能研究进展[J]. 郭宇含,张红.  贵州医药. 2019(04)
[2]应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析哈蟆油与伪品蛙油的差异蛋白质组[J]. 魏星华,王铭,张玉尧,潘黛安,苏航,齐滨,张鹤,赵大庆.  辽宁中医杂志. 2019(03)
[3]东北林蛙的陆地生活期和冬眠期生态[J]. 佟庆,王闯,崔立勇.  黑龙江畜牧兽医. 2015(12)
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[5]应用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术分析草菇同核和异核菌丝蛋白质组[J]. 刘靖宇,江玉姬,谢宝贵,陈炳智,廖伟,邓优锦,刘朋虎.  食用菌学报. 2012(01)
[6]粘蛋白研究进展[J]. 彭志红,汪荣泉.  胃肠病学和肝病学杂志. 2010(10)
[7]糖蛋白的研究进展[J]. 郭慧,邓文星,张映.  生物技术通报. 2009(03)
[8]中国林蛙油鉴别方法研究进展及建议[J]. 崔岩,侯晓东,崔春月,刘亚明.  林业实用技术. 2007(10)
[9]糖链-细胞表面蛋白质的信号天线[J]. 纪洪涛,刘国振,李莉云.  中国农学通报. 2006(05)
[10]糖蛋白的结构与功能[J]. 韩益飞,徐世清,朱江,沈卫德,郑必平.  生物学杂志. 2001(02)

硕士论文
[1]牛蛙、中华大蟾蜍及东北林蛙输卵管理化特性的比较研究[D]. 蔡凤坤.吉林农业大学 2007
[2]桑螟越冬幼虫抗寒性及有效积温的研究[D]. 陈永杰.山东农业大学 2004



本文编号：3630333