基于网络药理学和分子对接探讨四妙丸治疗痛风的分子机制
发布时间:2024-03-17 06:36
目的基于网络药理学及分子对接初步探讨四妙丸治疗痛风的作用机制。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学在线分析工具(BATMAN-TCM)数据库筛选四妙丸所含的活性化合物及作用靶点;检索GeneCards数据库获取痛风相关的疾病靶点;将药物和疾病靶点导入Bioinformatics & Evolutionary Genomics取交集,即药物(四妙丸)与疾病(痛风)的共同靶点,并利用Cytoscape 3.7.1软件构建四妙丸-化合物-靶点-痛风网络图;通过STRING数据库和R软件分别绘制PPI网络图和进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;另外选取部分化合物和靶点通过MOE软件进行分子对接验证;最后通过单钠尿酸盐(MSU)结晶诱导人髓系白血病单核细胞(THP-1)复制痛风细胞模型以进一步验证上述结果。结果本研究共筛选出四妙丸相关活性化合物65个,药物相关靶点724个,四妙丸与痛风的共同靶点20个;网络图提示槲皮素和山柰酚,环加氧酶 1(PTGS1)可能分别是四妙丸治疗痛风的有效化合物和靶点;GO富集分析提示四...
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【部分图文】:
本文编号:3930655
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图7不同剂量槲皮素对MAPK8蛋白表达影响的比较
干预24h后,通过Westernbolt检测MAPK8蛋白表达,结果表明:与空白组比较,模型组THP-1细胞MAPK8蛋白表达显著升高(P<0.01);与模型组比较,槲皮素不同浓度组MAPK8蛋白表达水平明显降低(P<0.05)(见图7)。3讨论
图1四妙丸治疗痛风的靶点的Venn图
2.6四妙丸对痛风预测靶点的富集分析图2四妙丸(SM)-化合物-靶点-痛风(gout)网络图
图2四妙丸(SM)-化合物-靶点-痛风(gout)网络图
图1四妙丸治疗痛风的靶点的Venn图通过R3.6.0软件及相关R软件包,以Fisher检验P<0.05,q<0.05为条件,进行GO和KEGG富集分析,q值越小,富集程度越高。GO分析共包括62个条目,将富集程度最高的前20个条目绘制成条形图,主要包括:转录辅因子结合、激活....
图3四妙丸治疗痛风靶点的PPI网络图
2.7分子对接结果图4四妙丸治疗痛风GO富集分析图
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