基于网络药理学的金花葵抗心肌缺血的作用机制研究

发布时间：2025-03-18 06:12

　　 目的:基于网络药理学的方法研究金花葵抗心肌缺血的作用机制。方法:通过查找文献挖掘金花葵中有效成分,利用数据库(PubChem、Swiss Target Prediction)搜集整理化合物并根据口服生物利用度(OB)、类药性(DL)值进行筛选,用Gene Cards、Drug Bank筛选心肌缺血的靶点,利用Venn diagram做出"化合物-靶点-疾病"间的韦恩图,进一步利用Cytoscape 3.2.1构建"活性成分-靶点"之间的网络关系图。构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,进行基因本体论(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的富集分析,进行分子对接验证。结果:金花葵中化合物共72个,有效成分18个,共预测出83个金花葵抗心肌缺血的共同作用靶点,GO功能富集分析显示金花葵有效成分潜在作用靶点多分布于膜筏和膜微区中,KEGG富集通路共66条,其中神经信号传递通路、糖尿病并发症中晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、Rap1信号通路、钙信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等通路对抗心肌缺血有明显作用,分子对接中表明发挥抗心...

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

图1 化合物有效成分靶点与疾病靶点交集

检索现有有关金花葵成分的文献[15～20]得到金花葵化合物共72个(表1)，在此基础上根据OB(≥10%)、DL(≥0.1)值筛选出有良好生物活性的金花葵有效成分18个(表2)，包括柏木脑、槲皮素、杨梅素、葛根素等。经TCMSP数据库及PubChem数据库共同检索到与上述成分有关....

图2 金花葵化合物与共同靶点网络图

由图3可知，构建的蛋白相互作用的PPI网络中包含81个节点及249条边。该网络平均度值为6.15，平均局部聚类系数为0.521，根据网络拓扑学参数，共筛选出20个核心关键靶蛋白，其中白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶(CASP....

图3 STRING靶蛋白互作PPI网络

图2金花葵化合物与共同靶点网络图图4PPI网络核心靶点

图4 PPI网络核心靶点

图3STRING靶蛋白互作PPI网络2.4GO和KEGG通路富集结果与分析

本文编号：4036129