急性髓系白血病中转录激活因子ATF5的发现及临床意义
发布时间:2022-01-23 22:15
研究目的急性髓系白血病(Acute myeloid leukemia,AML)是一类髓系造血细胞恶性克隆增殖引起的高度异质性疾病,病情发展迅速,自然病程仅几个月。除了特殊类型的急性早幼粒细胞白血病外,大部分AML患者化疗缓解后易复发,长期生存率低,预后差,而AML的靶向药物种类也十分有限。因此,发现AML发生发展中新分子、挖掘新的治疗靶标十分重要。生物信息学方法是寻找白血病致病分子的重要筛选工具,本研究运用生物信息学对基因表达数据库GEO中急性髓系白血病数据深度挖掘,筛查AML发生发展与预后评估的候选分子,探究被发现候选分子ATF5在不同阶段AML患者中表达状况、与其它预后指标间的相关性、在AML细胞中发挥的生物学效应及其可能的机制,从而初步评估其作为AML候选靶向干预分子的价值。研究方法1.GEO数据库中急性髓系白血病差异基因分析在GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中选择同时包含急性髓系白血病组和对照组临床样本的基因表达数据,运用R语言在R Studio进行基因芯片质量的检验,合格后再应用R Studio进行差异表达基因(differentially ex...
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2?GEO数据库不同基因芯片中ATF5在AML中高表达??(A)?GE0数据库中ATF家族分子在AML患者中表现状况,其中ATF3,ATF5,??ATF6表达差异有统计学意义(p<0.?0001),但以ATF5变化差异最明显;??(B,?C)?ATF5在不同队列AML患者中表达水平明显高于正常对照组;(D,E)??
3临床标本验证ATF5在成人AML骨髄细胞中髙表达??A)在正常对照者、AML初诊患者、完全缓解和难治复发患者中qRT-PCR检TF5表达水平,ATF5在初诊者中出现明显高表达,当疾病达CR时ATF5表达,当疾病复发时,ATF5表达再次升高;(B)?Western?blot检测ATF5表达:(C)免疫荧光检测对照者、AML初诊者及复发者中ATF5表达水平。图
图4?AML细胞系诱导分化后ATF5表达下调??(A,?B)?GEO数据库中AML细胞系诱导分化基因芯片分析显示,HL60细胞系经??ATAR、PMA以及DMS0诱导分化后ATF5表达下降(HL60+CTR?:对照组,??HL60+ATRA:全反式维甲酸处理5天的HL60细胞,HL60+PMA:?PMA处理5天的??HL60细胞,HL60+DMSO:?DMS0处理5天的HL60细胞);(C-E)?U937细胞系依??
【参考文献】:
期刊论文
[1]激活转录因子5启动子区甲基化水平的研究(英文)[J]. Xiao-min HUA,Juan WANG,Dong-meng QIAN,Jing-yi SONG,Hao CHEN,Xiu-li ZHU,Rui ZHOU,Yu-dan ZHAO,Xiu-zhi ZHOU,Ling LI,Li ZHANG,Xu-xia SONG,Bin WANG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2015(09)
本文编号:3605251
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2?GEO数据库不同基因芯片中ATF5在AML中高表达??(A)?GE0数据库中ATF家族分子在AML患者中表现状况,其中ATF3,ATF5,??ATF6表达差异有统计学意义(p<0.?0001),但以ATF5变化差异最明显;??(B,?C)?ATF5在不同队列AML患者中表达水平明显高于正常对照组;(D,E)??
3临床标本验证ATF5在成人AML骨髄细胞中髙表达??A)在正常对照者、AML初诊患者、完全缓解和难治复发患者中qRT-PCR检TF5表达水平,ATF5在初诊者中出现明显高表达,当疾病达CR时ATF5表达,当疾病复发时,ATF5表达再次升高;(B)?Western?blot检测ATF5表达:(C)免疫荧光检测对照者、AML初诊者及复发者中ATF5表达水平。图
图4?AML细胞系诱导分化后ATF5表达下调??(A,?B)?GEO数据库中AML细胞系诱导分化基因芯片分析显示,HL60细胞系经??ATAR、PMA以及DMS0诱导分化后ATF5表达下降(HL60+CTR?:对照组,??HL60+ATRA:全反式维甲酸处理5天的HL60细胞,HL60+PMA:?PMA处理5天的??HL60细胞,HL60+DMSO:?DMS0处理5天的HL60细胞);(C-E)?U937细胞系依??
【参考文献】:
期刊论文
[1]激活转录因子5启动子区甲基化水平的研究(英文)[J]. Xiao-min HUA,Juan WANG,Dong-meng QIAN,Jing-yi SONG,Hao CHEN,Xiu-li ZHU,Rui ZHOU,Yu-dan ZHAO,Xiu-zhi ZHOU,Ling LI,Li ZHANG,Xu-xia SONG,Bin WANG. Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology). 2015(09)
本文编号:3605251
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