BRCA1基因功能性遗传突变与中国人群食管鳞癌患病风险的相关性研究

发布时间：2017-08-12 06:02

  本文关键词：BRCA1基因功能性遗传突变与中国人群食管鳞癌患病风险的相关性研究

  更多相关文章： BRCA1 rs799917 单核苷酸多态性 食管鳞癌 患病风险

【摘要】：作为一种抑癌基因,BRCA1基因在维持基因稳定性方面发挥着重要作用。近年来,越来越多的研究表明BRCA1基因与食管癌的发生发展以及预后相关。在食管鳞癌细胞系中,位于BRCA1基因编码区的SNP位点rs799917 TC能够影响miR-638介导的BRCA1表达。因此,我们想要在中国人群中验证位于BRCA1基因编码区的SNP位点rs799917 TC与食管鳞癌患病风险之间的关系以及与BRCA1表达量之间的关系。采用病例-对照的方法,在济南人群和淮安人群两个独立的研究组中(共包含1128例食管鳞癌和1150例对照)进行基因分型,研究了BRCA1rs799917 TC与中国人群食管鳞癌患病风险之间的关系。运用逻辑回归模型计算出相应的95%的置信区间和OR值。此外,我们还采用实时定量PCR的方法,在29对食管鳞癌组织和癌旁组织中,检验了BRCA1 rs799917TC与BRCA1表达量之间的关系。研究发现,BRCA1 rs799917 C等位基因是风险位点,与TT基因型的个体相比,CT基因型和CC基因型的个体患食管鳞癌的风险增加(OR=1.48,p=0.005；OR=1.34,p=5.3×10-5);分层分析发现,BRCAl rs799917与吸烟和饮酒存在多重相互作用(基因-吸烟：Pinteraction:5.8×10-5;基因-饮酒：Pinteraction=7.1×10-7),吸烟和饮酒都能够增加食管鳞癌的患病风险(P值均小于0.05)。体内BRCA1表达量检测的实验表明无论在食管鳞癌组织中还是癌旁组织中,BRCA1 rs799917C等位基因能够降低BRCA1的表达量。这也说明BRCA1 rs799917是一种基因-环境相互作用的方式影响食管鳞癌的患病风险。
【关键词】：BRCA1 rs799917 单核苷酸多态性 食管鳞癌 患病风险
【学位授予单位】：北京化工大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R735.1
【目录】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-14
• 符号和缩略词说明14-15
• 第一章 绪论15-23
• 1.1 BRCA1基因概述15-17
• 1.1.1 BRCA1基因简介15
• 1.1.2 BRCA1基因的结构15-16
• 1.1.3 BRCA1基因的功能16-17
• 1.2 食管癌17-19
• 1.2.1 食管癌简介18
• 1.2.2 食管癌患病的危险因素18-19
• 1.2.3 食管癌的治疗19
• 1.3 单核苷酸多态性19-21
• 1.3.1 单核苷酸多态性介绍20
• 1.3.2 单核苷酸多态性的检测方法20-21
• 1.4 BRCA1基因与食管癌21
• 1.5 miRNA21
• 1.6 立项背景与研究意义21-22
• 1.7 本论文的主要研究内容22-23
• 第二章 BRCA1基因多态性与中国人群食管鳞癌患病风险的相关性研究23-49
• 2.1 实验材料23-26
• 2.1.1 实验试剂23-24
• 2.1.2 实验设备24-25
• 2.1.3 实验耗材25-26
• 2.1.4 实验研究对象26
• 2.2 实验方法26-36
• 2.2.1 血液中全基因组DNA提取26-29
• 2.2.1.1 相关溶液的配制27-28
• 2.2.1.2 用酚氯仿法提取血液中全基因组DNA具体步骤28-29
• 2.2.2 基因分型29-35
• 2.2.2.1 PCR-RFLP基因分型原理29-30
• 2.2.2.2 PCR反应体系参数以及反应条件优化30-32
• 2.2.2.3 限制性内切酶酶切32-33
• 2.2.2.4 琼脂糖凝胶电泳33-35
• 2.2.3 数据统计和分析35-36
• 2.3 实验结果与讨论36-45
• 2.3.1 引物设计结果与讨论36-37
• 2.3.2 PCR反应条件优化结果与讨论37-39
• 2.3.3 酶切条件的优化结果与讨论39-40
• 2.3.4 数据统计和分析结果与讨论40-45
• 2.3.4.1 食管鳞癌病例组和正常对照组选择性特征资料分布情况的结果与讨论40-41
• 2.3.4.2 Hardy-Weinberg平衡检测结果与讨论41-42
• 2.3.4.3 BRCA1 rs799917与食管鳞癌患病风险关系的研究结果与讨论42-44
• 2.3.4.4 分层分析BRCA1 rs799917基因分型与食管鳞癌患病风险的关系的结果与讨论44-45
• 2.4 注意事项45-47
• 2.4.1 血液中全基因组DNA提取过程中的注意事项45
• 2.4.2 引物设计过程中的注意事项45
• 2.4.3 PCR过程中的注意事项45-47
• 2.4.4 琼脂糖凝胶电泳过程中的注意事项47
• 2.5 本章小结47-49
• 第三章 rs799917 T/C与BRCA1表达量之间关联研究49-61
• 3.1 实验材料49-52
• 3.1.1 实验试剂49-50
• 3.1.2 实验设备50-51
• 3.1.3 实验耗材51-52
• 3.1.4 相关溶液的配制52
• 3.1.5 实验研究对象52
• 3.2 实验方法52-57
• 3.2.1 组织中RNA的提取52-53
• 3.2.2 反转录53-54
• 3.2.3 实时定量PCR检测BRCA1表达量54-56
• 3.2.4 组织中全基因组DNA的提取56-57
• 3.2.5 组织样本的基因分型57
• 3.2.6 数据统计分析57
• 3.3 实验结果与讨论57-58
• 3.4 注意事项58
• 3.5 本章小结58-61
• 第四章 结论、创新点与展望61-63
• 4.1 本论文的相关结论61
• 4.2 本论文的创新点61
• 4.3 展望61-63
• 参考文献63-69
• 致谢69-70
• 研究成果及学术论文70-71
• 作者和导师简介71-72
• 附件72-73

【共引文献】

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本文编号：660052