基于基因表达谱的胃癌和帕金森病关联分析

发布时间：2021-07-31 12:13

　　在过去的20年里,对基因表达谱数据的分析一直以来是统计学、计算机科学、生物信息学相互交叉的重要研究方向之一。对基因表达谱数据集进行分析可以揭示基因组信息与表型之间的联系,随着高通量技术的进一步发展,测量样品中全部mRNA表达水平的成本越来越低,使得基因表达谱技术的应用也越来越广泛,由此,微阵列实验得到了大量的数据集,对基因表达谱数据选择合适的统计方法已经成为一个相当重要的课题。帕金森病是一种由黑质中多巴胺能神经元死亡引起的神经退行性疾病,而胃癌是一种常见的癌症,是由细胞异常生长引起的,也就是说,帕金森病具有细胞死亡的特点,胃癌具有细胞增殖的特点,因此帕金森病和胃癌是两种截然不同的疾病。一项流行病学研究表明,帕金森病患者患胃癌的风险相对较低。本文旨在从两个不同分析角度对基因表达谱数据集进行分析,以探讨胃癌和帕金森病之间的关系。本文基于两个不同的分析角度,首先,对胃癌和帕金森病基因表达谱进行基因差异表达分析（使用limma包提供的稳健t检验）,其次对胃癌和帕金森病基因表达谱进行加权基因共表达网络分析（WGCNA）。前者是单基因分析方法,对数据集中的每个基因逐个进行检验,后者是一种系统生物学... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：71 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

WGCNA分析一般流程

检验m个假设的可能结果

ORA分析[52]

【参考文献】：
期刊论文
[1]基因功能富集分析的研究进展[J]. 王潇,尹天舒,李柏逸,江熹霖,孙慧,窦亚光,倪琦,田卫东.  中国科学:生命科学. 2016(04)
[2]Mitogen-activated protein kinase signaling pathway and invasion and metastasis of gastric cancer[J]. Mei Yang,Chang-Zhi Huang.  World Journal of Gastroenterology. 2015(41)



本文编号：3313446