绵羊Wnt10b基因克隆及生物信息学分析
本文关键词:绵羊Wnt10b基因克隆及生物信息学分析
【摘要】:Wnt10b是Wnt家族中重要成员之一,绵羊Wnt10b基因尚属未知。本研究利用RT-PCR和RACE技术克隆了绵羊Wnt10b基因的全序列,并对该基因进行了比较全面的生物信息学分析。结果表明:绵羊Wnt10b基因序列全长2321 bp,包括1116 bp的编码区序列,编码391个氨基酸;其可变剪接体Wnt10b-AS由于CDS序列部分缺失编码166个氨基酸。同源性分析发现,绵羊Wnt10b基因核苷酸和氨基酸序列与其它哺乳动物同源性较高。氨基酸序列分析发现该蛋白为亲水性不稳定蛋白,相对分子量为43.0254 k Da。预测含有6个磷酸化位点,5个豆蔻酰化位点,二级结构以无规则卷曲和α螺旋为主。生物信息学分析表明Wnt10b及Wnt10-AS均为分泌型跨膜蛋白,主要存在细胞外基质中,通过与细胞膜上受体结合,调控下游靶基因的表达。Wnt10b-AS由于缺失多个翻译后修饰位点,可能通过与主转录本不同的作用机制发挥生物学功能。本研究为进一步探讨Wnt10b基因在绵羊毛囊生长发育中的功能和作用机制奠定了信息学基础。
【作者单位】: 中国农业大学动物科技学院动物遗传资源与分子育种实验室;
【关键词】: Wntb 绵羊 生物信息学分析
【基金】:国家转基因重大专项"高产超细毛转基因羊新品种培育"(2014ZX08008-001,2013ZX08008-001)
【分类号】:S826.2
【正文快照】: 20世纪90年代初,世界羊毛产量显著萎缩。与此同时,世界各国开始注重对细毛羊和超细毛羊品种的选育。我国从19世纪初开始引入美利奴绵羊,终于在1985年育成“中国美利奴”,实现了我国细毛羊品种质的飞跃。我国是世界羊毛生产大国,由于对毛用羊优良品种改良和选育工作缺乏持续性,
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 魏星灿;贾青;陶隽;胡慧艳;;猪CB1基因的生物信息学分析[J];河南农业科学;2013年12期
2 蔡惠芬;陈志;罗卫星;刘若余;张依裕;石照应;;黔北麻羊RERGL基因cDNA克隆与生物信息学分析[J];湖北农业科学;2012年15期
3 刘静宜;李文卉;曲自刚;高小磊;岳龙;孙树民;付宝权;;旋毛虫硫氧还蛋白过氧化物酶基因的克隆与生物信息学分析[J];中国兽医科学;2014年04期
4 李芬;周佩;杨婷;陈宁博;马云;;牛ANGPTL2基因结构与功能的生物信息学分析[J];华北农学报;2012年01期
5 阎晓菲;黄兵;韩红玉;杨斌;岳城;赵其平;姜连连;董辉;;鸡堆型艾美耳球虫新基因的克隆与生物信息学分析[J];中国畜牧兽医;2014年07期
6 魏博;潘阳阳;禹尧;田枫;余四九;;牦牛PAFR基因生物信息学分析及其在妊娠前后子宫中的表达[J];生物技术通报;2014年08期
7 何桦;王浩瀚;刘贺贺;潘志雄;王继文;;鹅ATP5E基因cDNA克隆及生物信息学分析[J];中国畜牧杂志;2013年05期
8 王伟;连林生;李继中;;猪MSTN基因生物信息学分析[J];安徽农业科学;2012年10期
9 胡慧艳;贾青;陶隽;魏星灿;陶文欢;墨锋涛;邢增喜;;家猪TBP蛋白结构与理化性质的生物信息学分析[J];河南农业科学;2014年03期
10 乔莉娟;王立贤;苏振环;颜华;;猪肺表面活性蛋白A的DNA全序列克隆与生物信息学分析[J];畜牧兽医学报;2008年04期
中国重要会议论文全文数据库 前5条
1 焦斐;阎萍;梁春年;郭宪;包鹏甲;裴杰;丁学智;褚敏;吴晓云;刘建;;牛FAS基因的生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养牛学分会2011年学术研讨会论文集[C];2011年
2 王玲;高莲;李健;赖松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息学分析[A];第五届中国畜牧科技论坛论文集[C];2011年
3 李婷;张英杰;刘月琴;李雪梅;李兰会;;反刍动物INHA基因编码区生物信息学分析[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会2014年全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2014年
4 晋大鹏;王立贤;张龙超;颜华;乔丽娟;程笃学;李勇;;猪肺表面活性蛋白A基因启动子区的克隆及生物信息学分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
5 吴晓云;阎萍;梁春年;郭宪;;牦牛ATP6和ATP8基因生物信息学分析[A];《第六届中国牛业发展大会》论文集[C];2011年
,本文编号:1115281
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/1115281.html