海岛棉蔗糖合成酶基因克隆及生物信息学和表达模式分析

发布时间：2017-10-30 23:17

  本文关键词：海岛棉蔗糖合成酶基因克隆及生物信息学和表达模式分析

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【摘要】：蔗糖合成酶(Sucrose Synthase,EC 2.4.1.13,Sus)在植物不同组织及不同发育阶段起不同的作用,是参与植物糖类代谢调控的关键酶之一。本研究,我们利用目前已完全确定的亚洲棉(Gossypium arboretum L.)Sus基因7个成员(Ga Sus1-Ga Sus7,Gene Bank登录号JQ995522-JQ995528)进行同源克隆并通过q RT-PCR方法对不同纤维发育时期Sus表达模式进行了检测。得到的两个组配海岛棉(Gossypium barbadense L.)重组自交系(recombinant inbred line,RIL,F2:6)亲本材料5917(高比强度品种,平均比强度48.2 c N.tex-1)和Pima-7(低比强度品种,平均比强度37.6 c N.tex-1)的Sus g DNA序列。利用生物信息学方法对基因结构特征分析比较发现,5917、Pima-7与亚洲棉Sus编码区(CDS)中分别存在(Sus1与Ga Sus1:9,8;Sus2与Ga Sus2:25,8;Sus3与Ga Sus3:8,9;Sus4与Ga Sus4:40,41;Sus5与Ga Sus5:27,27;Sus6与Ga Sus6:16,16;Sus7与Ga Sus7:7,7)处单核苷酸多态性(SNP)位点。两个海岛棉品种间Sus1,Sus2,Sus3,Sus4 CDS中存在(1,21,4,1)处差异SNP位点,Sus5,Sus6,Sus7 CDS中无差异。海岛棉Sus CDS中核酸序列碱基置换虽改变了相应氨基酸组成,但氨基酸理化性质和蛋白质结构与功能均与亚洲棉相同未发生明显变化。海岛棉纤维发育过程中,Sus在纤维中的表达具有特异性。本研究在设立高、低比强度研究对象并比对8个纤维生育时期的基础上进一步发现Sus3在纤维次生壁加厚初期(20 DPA)开始大量表达到达峰值随后下降。高比强度海岛棉品种5917 Sus1除在纤维发育起始期(0 DPA~5 DPA)大量表达外,在纤维次生壁加厚后期和末期(30 DPA~35 DPA)表达量又重新升高,低比强度海岛棉品种Pima-7 Sus1无此回升现象且表达量远低于前者。研究表明,Sus3在纤维次生壁加厚初期起作用,Sus1作用于纤维次生壁加厚后期和末期,这两个Sus在纤维次生壁加厚期发挥重要的作用,可能与纤维比强度的形成和差异有关。
【作者单位】： 新疆农业大学农学院农业技术重点实验室;
【关键词】： 海岛棉 蔗糖合成酶 同源克隆 基因表达
【基金】：自治区高技术研究发展计划(201411103)资助
【分类号】：S562
【正文快照】： Sus是一个多基因家族,目前已经发现的Sus有80 多个,覆盖45 个物种(Goren et al., 2011)。Sus在Sucrose+UDP ←→fructose+UDPG的可逆反应过程中起催化作用,参与调节库器官中蔗糖强度及调控细胞生长分化(Kleczkowski et al., 2010)。大量研究表明Sus功能主要有参与淀粉及纤维素

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本文编号：1119763