整合分析基因表达与拷贝数变异识别癌症的驱动基因及调控子miRNAs

发布时间：2017-12-01 15:05

  本文关键词：整合分析基因表达与拷贝数变异识别癌症的驱动基因及调控子miRNAs

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【摘要】：目的:通过整合分析基因的表达与拷贝数变异(CNV)识别癌症的驱动基因及调控子mi RNAs。方法:通过整合基因表达与CNV数据,分别计算了乳腺癌、结肠癌、肺癌、肾癌、膀胱癌、头颈癌六种癌症中mi RNAs的调控得分,提出了一个识别驱动基因和显著调控子mi RNAs的方法。结果:本文研究发现,CNV区域上编码的基因相比于非CNV区域上编码的基因更倾向于受mi RNAs调控。但是,癌相关CNV区域上的基因相比正常CNV区域上的基因更少受mi RNAs调控。本研究识别出了EXOSC4、ZNF7、BOP1等原癌基因,以及mi R-488、mi R-27a、mi R-454等在多种癌症中都起调控作用的调控子mi RNAs。结论:本文的方法为癌症研究带来了新的启发,这些具有调控扩增基因过表达作用的mi RNAs的发现,有助于我们更进一步了解癌基因表达的复杂调控机制,进而推动癌症的诊断、治疗和预后。
【作者单位】： 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院;中国科学院上海生命科学院健康科学研究所;
【基金】：黑龙江省教育厅科技研究项目(12541278)
【分类号】：R73-3
【正文快照】： Chinese Library Classification(CLC):R749.231;Q-33 Document code:AArticle ID:1673-6273(2016)05-940-04前言拷贝数变异(Copy number variations,CNV)与疾病的关系已被越来越多的研究发现。CNV和基因表达间的关系也被日渐增多的研究证实[1]。Driver基因更有可能在基因组留

【共引文献】

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