毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选

发布时间：2017-12-27 20:13

本文关键词：毛白杨不同组织器官稳定表达看家基因的筛选　出处：《植物生理学报》2016年08期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：以毛白杨(Populus tomentosa)‘BJHR01’的不同组织器官为材料,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术及内参基因表达稳定性分析软件Best Keeper、Norm Finder和geNorm分析了8个看家基因在毛白杨不同组织器官中的表达稳定性。所选看家基因包括细胞骨架蛋白肌动蛋白基因(actin)、微管蛋白基因(TUB)、18S核糖体RNA基因(18S rRNA)、翻译延伸因子(EF-1 beta)、翻译起始因子(eIF 5AV)、组蛋白编码基因(H3)、核糖体蛋白基因(RP)和泛素蛋白基因(UBQ),结果发现eIF 5AV、actin和UBQ三个内参基因在毛白杨不同组织器官中表达水平稳定,适合在定量PCR分析中作为内参基因;TUB的表达稳定性最差,不适宜作为毛白杨不同组织器官基因表达研究的内参基因。在毛白杨不同组织器官基因表达水平研究中,可选用eIF 5AV、actin和UBQ三个内参基因的几何平均数作为参照标准,实验数据的分析将更为准确。
[Abstract]:In poplar (Populus tomentosa) "BJHR01" in different organs as materials, using real-time fluorescence quantitative PCR (qRT-PCR) Keeper, Norm stability analysis software Best Finder and geNorm 8 housekeeping genes in different organs of poplar tissue expression stability analysis and reference gene expression technology. The selected housekeeping genes including cytoskeletal protein actin gene (actin), tubulin gene (TUB), 18S (18S rRNA) ribosomal RNA gene, translation elongation factor (EF-1 beta), translation initiation factor (eIF 5AV), group of protein encoding gene (H3), ribosomal protein gene (RP) and the ubiquitin gene (UBQ), the expression level of 5AV, actin and UBQ eIF three reference genes in Poplar in different organs, suitable as a reference gene in quantitative PCR analysis; stability of the expression of TUB was the worst, not suitable for Poplar organ gene in different tissues of reference gene expression. In different organs of poplar gene expression study, the geometric mean can be used eIF 5AV, actin and UBQ of the three reference genes as reference standard, the analysis of the experimental data will be more accurate.
【作者单位】：北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心;首都师范大学;
【基金】：国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目(2013AA-102702) 国家重点基础研究发展计划(“973”计划)项目(2012CB114501)~~
【分类号】：S792.117
【正文快照】： 收稿2016-06-29修定2016-07-18资助国家高技术研究发展计划(“863”计划)项目(2013AA-102702)和国家重点基础研究发展计划(“973”计划)项目(2012CB114501)。林木是最主要的可再生资源,具有重要的经济价值。当前,随着毛果杨(Populus trichocarpa)、巨桉(Eucalyptus grandis)等

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