桃PME基因家族的鉴定与分析

发布时间：2018-03-15 05:30

  本文选题：桃　切入点：果胶甲酯酶　出处：《江苏农业科学》2016年05期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：果胶甲酯酶属于碳水化合物酯酶家族CE-8,是调节果胶甲酯化程度的一种普遍存在的酶,是植物细胞壁的主要成分。为深入研究桃PME基因家族的功能,利用生物信息学方法对桃基因组中PME基因家族成员进行鉴定,并对其基因组信息、蛋白生理生化特征、基因结构、保守结构域和系统进化树等方面进行了研究。结果表明:在桃基因组中共鉴定出69个PME基因,可以分为GroupⅠ、GroupⅡ两大类,GroupⅡ又可以进一步分成3个分支;PME基因在桃的8条染色体上呈现不均匀分布,并存在明显的串联重复现象,共发现18个串联重复基因簇,包含47个基因,串联重复是桃PME基因扩增的主要方式。对桃PME基因结构的分析表明,PME基因在进化上存在着一定的保守性;对桃PME蛋白氨基酸序列的多重比对发现了PME蛋白5个典型的保守结构区域;通过MEME软件对桃PME蛋白保守基序的分析发现了12个比较保守的基序。
[Abstract]:Pectin methylesterase belongs to the carbohydrate esterase family CE-8, which is a ubiquitous enzyme that regulates the degree of pectin methyl ester and is the main component of plant cell wall. In order to study the function of peach PME gene family, pectin methylesterase belongs to the carbohydrate esterase family. The PME gene family members in peach genome were identified by bioinformatics, and the genome information, protein physiological and biochemical characteristics and gene structure were analyzed. The conserved domain and phylogenetic tree were studied. The results showed that 69 PME genes were identified in peach genome. It can be divided into two groups, Group 鈪，

本文编号：1614653