高温胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选及稳定性分析

发布时间：2018-03-16 12:21

  本文选题：茄子　切入点：高温胁迫　出处：《园艺学报》2017年03期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：为筛选茄子(Solanum melongena L.)高温胁迫下稳定表达的内参基因,以不同茄子品系(种)为研究对象,利用实时荧光定量PCR技术对来自茄子高温胁迫转录组数据库8个候选内参基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同试验情况下进行表达检测,并结合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder软件综合评价9个内参基因的表达稳定性。结果表明,在茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4经高温处理不同时间的样品和不同组织样品以及10个耐热性不同的茄子品系(种)中,9个内参基因的表达丰度及稳定性存在差异;茄子热敏品系05-1和耐热品系05-4高温胁迫处理不同时间样品中表达稳定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同组织中表达水平最稳定的是SmEF1a和SmTRX;高温胁迫下不同茄子品系(种)中以SmTRX和SmEF2的表达稳定性最好。综合来看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子试验样品中的表达稳定性最好,而SmActin和SmCK I的表达稳定性较差。
[Abstract]:In order to screen the stable expression genes of eggplant Solanum melongena L. under high temperature stress, different eggplant lines (species) were studied. The expression of 8 candidate internal reference genes (SmEF1aOOSm2E2OSm40s RPS29rPS29S60s RPL24s SmTRXCK-SmDAHPS / SmUCP-SmUCP) and SmActin from eggplant high temperature stress transcriptional database were detected by real-time fluorescence quantitative PCR (RFP) under different experimental conditions. Combined with GeNorm Finder Best Keeper and ReFinder software, the expression stability of 9 internal reference genes was evaluated. In eggplant heat-sensitive line 05-1 and heat-resistant strain 05-4, the expression abundance and stability of 9 internal reference genes were different among the samples and tissue samples treated with high temperature for different time and 10 eggplant lines (species) with different heat resistance. The best expression stability of eggplant was SmEF1a and SmUCP.The expression levels of SmEF1a and SmTRX were the most stable in different tissues of eggplant under high temperature stress, and different eggplant lines (species) under high temperature stress. The expression stability of SmTRX and SmEF2 was the best in all eggplant samples, and the stability of SmEF1a and SmTRX was the best in all eggplant samples. However, the expression of SmActin and SmCK I was not stable.
【作者单位】： 广东省农业科学院蔬菜研究所;华南农业大学园艺学院;海南省农业科学院蔬菜研究所;
【基金】：国家自然科学基金项目(31501755) 广东省自然科学基金项目(2015A030313568) 广东省科技计划项目(2016B070701010) 广州市科技计划项目(2014J4100094,201510010075)
【分类号】：S641.1

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本文编号：1619889