马氏珠母贝TRA F7基因cDNA的克隆及表达分析
本文选题：马氏珠母贝 切入点：TRA 出处：《基因组学与应用生物学》2016年01期 论文类型：期刊论文
【摘要】：肿瘤坏死因子受体相关因子7(TRA F7)属于TRAFs家族,参与多种免疫炎症反应。为了研究马氏珠母贝TRAF7(PmTRA F7)的生物学功能,本研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得PmTRA F7基因cDNA的全长序列并对其序列特征进行分析;同时利用荧光定量PCR(RT-PCR)技术检测了马氏珠母贝不同组织中PmTRA F7基因mRNA的表达。结果显示,PmTRA F7基因cDNA全长2246bp,开放阅读框(ORF)1809bp,编码602个氨基酸,5'非翻译区(5'UTR)长211bp,3'非翻译区(3'UTR)长226bp,预测分子量约为67.50kD,理论等电点为6.56。多序列比对结果发现软体动物间TRA F7具有高保守性。软件分析结果显示PmTRA F7的氨基酸序列具有典型的RING结构、锌指结构和7个重复的WD40序列。荧光定量数据分析表明,PmTRA F7基因在全组织中均有表达,在肝胰腺中表达量最高,外套膜和鳃中表达量也较高。
[Abstract]:Tumor necrosis factor receptor-associated factor 7 (TRA F7) belongs to the TRAFs family and participates in a variety of immune inflammatory reactions. In order to study the biological function of TRAF7(PmTRA F7, In this study, the full-length cDNA sequence of PmTRA F7 gene was cloned by rapid amplification of cDNA terminal and its sequence characteristics were analyzed. The expression of PmTRA F7 gene mRNA in different tissues of PmTRA F7 was also detected by fluorescence quantitative PCR RT-PCR.The results showed that the full length of cDNA of PmTRA F7 gene was 2246 BP, the open reading frame ORFN 1809 BP, encoding 602 amino acid 5 'untranslated region 5UTRs 211bpt3' untranslated region. The predicted molecular weight was 67.50 KD and the theoretical isoelectric point was 6.56. The results of multiple sequence alignment showed that TRA F7 was highly conserved among molluscs. The results of software analysis showed that the amino acid sequence of PmTRA F7 had a typical RING structure. Fluorescence quantitative analysis showed that the PmTRA F7 gene was expressed in the whole tissue, the highest in the hepatopancreas, and the higher in the coat and Gill.
【作者单位】： 广东海洋大学;
【基金】：国家自然科学基金“马氏珠母贝植核育珠移植耐受免疫相关基因与蛋白质鉴定及关联度研究”(31472306) 广东省科技计划项目“海水珍珠贝功能基因的开发与应用研究”(2012A031100010) 湛江市科技计划项目“马氏珠母贝抗菌功能多肽的提取与制备技术”(2013A03022)共同资助
【分类号】：S917.4
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，本文编号：1619961
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