貉源犬瘟热病毒血凝素基因的克隆及序列分析
本文选题：犬瘟热病毒 切入点：血凝素基因 出处：《动物医学进展》2017年02期 论文类型：期刊论文
【摘要】：为了对1例貉源犬瘟热(CD)进行病毒检测并分析其血凝素H基因变异情况,本研究从1只疑似犬瘟热病死的貉采病料进行研磨,利用RT-PCR方法扩增犬瘟热病毒H基因,对扩增出的H基因片段进行克隆测序,并对得到的H基因序列进行分析。结果表明,该貉感染犬瘟热病毒,得到的H基因核苷酸和氨基酸序列与CDV野毒株同源性较高,分别为89.1%~98.0%和85.4%~97.5%。遗传进化分析表明其属于Asia-1型野毒株,N连接糖基化位点分析结果表明,该毒株在542aa处比参考野毒株多了1个潜在的N糖基化位点,在525aa-550aa间多出了1个抗原表位。
[Abstract]:In order to detect the virus and analyze the variation of hemagglutinin H gene in a case of raccoon dog distemper, a raccoon whose disease died of canine distemper was ground and amplified by RT-PCR method. The amplified H gene fragment was cloned and sequenced, and the H gene sequence was analyzed. The results showed that the nucleotide and amino acid sequence of the H gene of raccoon dog infected with canine distemper virus had high homology with CDV wild strain. 98.0% and 85.4%, respectively. Genetic evolution analysis showed that the strain belonged to the Asia-1 type wild strain. The results showed that the strain had one more potential N-glycosylation site than the reference wild strain at 542 AA, and one more antigen epitope at 525aa ~ 550aa.
【作者单位】： 青岛农业大学动物科技学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31472196) 青岛农业大学应用型人才培养特色名校工程2015年大学生科技创新项目
【分类号】：S852.65
【参考文献】
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【二级参考文献】
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本文编号：1641718
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