甘薯低温胁迫基因IbICE1的克隆及表达分析

发布时间：2018-03-21 18:12

  本文选题：甘薯　切入点：IbICE　出处：《沈阳农业大学学报》2017年02期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：克隆甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)低温胁迫基因Ib ICE1,对其进行序列分析及低温胁迫下表达水平分析,探讨Ib ICE1对甘薯耐低温胁迫能力的影响。以辽薯36为试验材料,利用RACE技术克隆甘薯Ib ICE1基因,Ib ICE1基因的c DNA全长2150bp,包含1611bp完整的开放阅读框,该基因编码536个氨基酸残基,分子量58.26 k D,等电点5.72。进化树分析表明,Ib ICE1同玉米和拟南芥ICE1基因亲缘关系较近。Ib ICE1蛋白C端含有一个典型的b HLH结构域,并与其他植物的ICE1蛋白具有较高的同源性。采用RT-PCR研究该基因在低温处理时的表达量及在甘薯不同组织中的表达量,结果表明,该基因的表达受低温胁迫诱导,在甘薯的茎、叶和根均有表达,其中叶中表达量最高,推测Ib ICE1基因在甘薯耐低温胁迫中发挥重要作用。
[Abstract]:The low temperature stress gene Ib ICE1 of Ipomoea batatas L. Lam. was cloned and sequenced and the expression level of Ib ICE1 was analyzed to study the effect of Ib ICE1 on the tolerance of sweet potato to low temperature stress. The c DNA of Ib ICE1 gene Ib ICE1 gene of sweet potato was cloned by RACE technique, containing a complete open reading frame of 1611bp. The gene encodes 536 amino acid residues. The molecular weight was 58.26kD and the isoelectric point was 5.72.The phylogenetic tree analysis showed that Ib ICE1 was closely related to the ICE1 gene of maize and Arabidopsis thaliana. The C-terminal of Ib ICE1 protein contained a typical b HLH domain. RT-PCR was used to study the expression of ICE1 protein in different tissues of sweet potato under low temperature treatment. The results showed that the expression of the gene was induced by low temperature stress and was induced in stem of sweet potato. The expression of Ib ICE1 gene was the highest in leaves and roots, suggesting that Ib ICE1 gene played an important role in the tolerance to cold stress in sweet potato.
【作者单位】： 辽宁省农业科学院;
【基金】：国家“863”计划专题项目(2012AA101204)
【分类号】：S531

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