普通小球藻八氢番茄红素合成酶基因psy的cDNA克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-03-31 22:06

  本文选题：八氢番茄红素合成酶　切入点：psy基因　出处：《上海海洋大学学报》2017年02期

【摘要】：通过RACE-PCR首次克隆获得了普通小球藻(Chlorella vulgaris)中八氢番茄红素合成酶编码基因psy的cDNA全长序列。该序列全长1 605 bp,包括1 245 bp开放阅读框,编码415个氨基酸。氨基酸序列对比及系统发生分析表明其与其他物种的PSY蛋白具有同源性,与绿藻聚为一支,与小球藻(Chlorella variabilis)、原壳小球藻(Auxenochlorella protothecoides)和佐夫色绿藻(Chromochloris zofingiensis)的遗传距离最近(分别为0.173、0.188和0.239),并具有较高的相似性(81%~84%)和一致性(69%~76%)。亚细胞定位预测表明普通小球藻PSY前45个氨基酸残基为叶绿体转运肽,可能引导翻译后的肽链进入叶绿体。保守区块、特征基序分析及三维建模显示,序列中具有多个潜在的蛋白质修饰位点,以及PSY蛋白的保守区块和特征基序,包括两个保守的底物-镁离子结合位点和两个活性位点遮蔽残基,用于结合底物及保护催化反应中间产物;普通小球藻PSY蛋白中还具有一个特异的底物-镁离子结合位点,其活性和功能还未知。总之,研究结果揭示了普通小球藻psy基因的cDNA全长序列及可能的蛋白质序列结构特性,结果可为构建过表达载体,提高类胡萝卜素产量提供相关信息。
[Abstract]:A full - length cDNA sequence of phytoene synthase encoding gene psy in common Chlorella vulgaris ( Chlorella vulgaris ) was obtained by RACE - PCR .

【作者单位】： 上海海洋大学水产与生命学院;上海农林职业技术学院;
【基金】：国家自然科学基金(41272381) 上海市知识服务平台上海海洋大学水产动物遗传与育种中心项目(ZF1206) 国家海洋局公益项目(201505034)
【分类号】：S917.3

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本文编号：1692654