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猪巨细胞病毒福建株gB基因的克隆和序列分析

发布时间:2018-06-12 12:38

  本文选题:猪巨细胞病毒 + gB基因 ; 参考:《福建农业学报》2017年01期


【摘要】:为明确猪巨细胞病毒福建株(PCMV-FJ01)的gB基因特征,根据其序列特征,设计特异性引物对其进行分段扩增,并对目的片段进行克隆测序。结果发现,PCMV-FJ01株gB基因全长为2 580bp,编码859个氨基酸;其和GenBank数据库中的PCMV分离株的gB基因的核苷酸和氨基酸同源性分别均在98.3%和97.9%以上。此外,本研究还发现部分(约50%)PCMV代表株的gB基因存在ACA三核苷酸缺失(436位氨基酸存在谷氨酰胺Q的缺失)。除ZZ株外,PCMV不同分离株的gB基因是否存在基因缺失和其遗传进化正相关。
[Abstract]:In order to identify the GB gene characteristics of porcine cytomegalovirus strain PCMV-FJ01, a specific primer was designed to amplify PCMV-FJ01, and the target fragment was cloned and sequenced. The results showed that the total length of GB gene of PCMV-FJ01 strain was 2580bp, encoding 859 amino acids, and the nucleotide and amino acid homology of GB gene was 98.3% and 97.9% respectively with PCMV isolated in GenBank database. In addition, some of the GB gene of PCMV were found to have deletion of ACA trinucleotide and amino acid at 436 amino acids, and the deletion of glutamine Q was found in some of the GB genes of PCMV. There was a positive correlation between gene deletion and genetic evolution of GB gene in different PCMV isolates except ZZ strain.
【作者单位】: 福建省农业科学院畜牧兽医研究所/福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心;
【基金】:福建省畜禽疫病防控技术重大研发平台项目(2014N2003) 福建省科技计划项目——省属公益类科研院所基本科研专项(2014R1023-16、2014R1023-13)
【分类号】:S852.65

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本文编号:2009702


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