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猪流行性腹泻病毒山西分离株M基因序列分析

发布时间:2018-07-07 13:01

  本文选题:猪流行性腹泻 + 山西分离株 ; 参考:《中国兽医杂志》2017年03期


【摘要】:为了研究山西地区猪流行性腹泻病毒M基因的遗传变异情况,从2014年10月~2015年4月山西地区11个地市收集的猪流行性腹泻病毒(PEDV)病料中扩增到4株PEDV的M基因,并进行序列比对及遗传分析。结果表明,4株PEDV的M基因与CV777毒株比较,部分核苷酸及氨基酸发生改变。4株PEDV的M基因核苷酸和氨基酸的同源性分别为99.6%~100%和99.1%~99.6%,与参考毒株的核苷酸和氨基酸的同源性分别为96.3%~99.9%和96.0%~99.1%。遗传进化分析显示,4株PEDV与2010-2013年中国分离株(BJ2010、HB/BD、HB/FN、HLJ-2012、GDHZ-1202、SHQP/YM/2013)、2008年泰国KU04RB08株亲缘关系较近;与2株泰国株(M_NIAH2013_95和M_NIAH1795_04)、2株欧洲株(CV777和Br1/87)和2006年中国分离株LZC亲缘关系较远。
[Abstract]:In order to study the genetic variation of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) M gene in Shanxi, 4 strains of PEDV M gene were amplified from porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) collected from 11 cities in Shanxi from October 2014 to April 2015. Sequence alignment and genetic analysis were carried out. The results showed that the M gene of PEDV was compared with that of CV777 strain. The nucleotide and amino acid homology of M gene of PEDV was 99.6% and 99.6%, respectively. The homology of M gene with reference strain was 96.399% and 96.0% 99.1, respectively. Genetic evolution analysis showed that four PEDV strains were closely related to Chinese isolates from 2010 to 2013 (BJ2010 / HB-BDHBP / FNN / HLJ-2012GDHZ-1202HHZ-1202HQP- / YM / 2013), and to two Thai strains (MNIAH201395 and MNIAH179504) and two European strains (CV777 and Br187) to Chinese isolate LZC in 2006.
【作者单位】: 山西省农业科学院畜牧兽医研究所;
【基金】:山西省科技攻关项目(20140311020-2-A);山西省科技攻关项目(20150311018-3)
【分类号】:S852.651

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