干旱胁迫条件下发菜cphB差异表达与基因克隆

发布时间：2018-10-07 19:30

【摘要】：发菜是一种分布在干早、半干旱荒漠草原地区的陆生固氮蓝藻,对干旱具有极强的适应性。采用qRT-PCR技术,对干旱胁迫条件下发菜cphB的差异表达进行了分析,发现干旱胁迫条件下发菜cphB在转录水平上呈逐渐增加的趋势。根据发菜同源物种设计简并性引物克隆cphB基因,获得长度为864bp的DNA(GenBank登陆号为KX092456)。同源性比较发现发菜cphB基因具有较高的保守性,二级结构预测表明发菜CphB由α螺旋,β折叠和随机卷曲构成。三级结构预测表明CphB具有一个由α螺旋和β折叠组成的5股的结构域和由7个β折叠连成三明治结构的7股的结构域。将cphB基因在大肠杆菌中表达,获得符合预期的外源重组蛋白,CphB亚细胞定位于细胞质中。研究成果为进一步研究干旱胁迫条件下发菜cphB表达调控、藻蓝素的代谢机制及能量代谢机制方面奠定了基础。
[Abstract]:Nostoc is a terrestrial nitrogen-fixing cyanobacteria distributed in dry and semi-arid desert steppe, which has a strong adaptability to drought. QRT-PCR technique was used to analyze the differential expression of cphB under drought stress. It was found that the transcription level of cphB increased gradually under drought stress. The cphB gene was cloned by degenerate primers according to the homologous species of hairy, and the DNA (GenBank landing number of 864bp was KX092456. Homology analysis showed that the cphB gene was highly conserved, and the secondary structure prediction showed that the CphB was composed of 伪 helix, 尾 -fold and random crimp. The third-order structure prediction shows that CphB has a domain of 5 strands composed of 伪 helix and 尾 fold and a domain of 7 strands composed of 7 尾 folds to form a sandwich structure. The cphB gene was expressed in Escherichia coli and the recombinant protein CphB subcells were located in the cytoplasm. The results laid a foundation for further study on the regulation of cphB expression, the metabolic mechanism of phycocyanin and the mechanism of energy metabolism in sprouts under drought stress.
【作者单位】： 宁夏大学生命科学学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31360054)资助
【分类号】：Q943.2

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本文编号：2255409