SgP5CS基因克隆和生物信息学分析

发布时间：2018-10-24 17:50

【摘要】：利用同源克隆的方法,获得了碱蓬P5CS基因全长ORF,命名为SgP5CS。SgP5CS ORF全长2 151 bp,生物信息学软件预测其编码716个氨基酸组成的多肽,相对分子量为77 431.8 u,等电点为5.71,为稳定的亲水性蛋白,无跨膜结构域。Clustal X多重序列比对发现SgP5CS编码的氨基酸序列与盐角草P5CS相似性为93%,与盐角草P5CS的亲缘关系最近,其次是甜菜。脯氨酸是生物体内重要的渗透调节剂,而Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶则是植物合成脯氨酸的关键酶之一,SgP5CS的克隆将为进一步的功能分析鉴定基础。
[Abstract]:Using homologous cloning method, the peptide encoding 716 amino acids of Suaeda salsa P5CS gene, named as SgP5CS.SgP5CS ORF full length 2 151 bp, bioinformatics software, was obtained. The relative molecular weight is 77 431.8 u, the isoelectric point is 5.71, and the protein is a stable hydrophilic protein. The amino acid sequence encoded by SgP5CS was found to be similar to P5CS of Salmonella Salina by multiple sequence alignment of. Clustal X without transmembrane domain, and the close relationship was found between SgP5CS and P5CS. The next is beet. Proline is an important osmotic regulator in organism, and 螖 1-pyrroliden-5-carboxylic acid synthase is one of the key enzymes in plant proline synthesis. The cloning of SgP5CS will be the basis of further functional analysis and identification.
【作者单位】： 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所;萧山区种子管理站;
【基金】：中国博士后科学基金面上项目(2014M551772) 国家转基因生物新品种培育重大专项(2014ZX0800403B)
【分类号】：Q943.2

【共引文献】

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本文编号：2292104