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黄瓜CsPAP-fib基因的克隆与序列分析

发布时间:2018-12-18 17:09
【摘要】:以温敏型黄瓜‘C09-123’为试材,通过对不同夜温处理的黄瓜幼叶进行差异蛋白质鉴定,筛选出一个与低夜温影响黄瓜雌性形成密切相关的蛋白,采用生物信息学方法,对该蛋白进行生物信息学分析,并运用基因克隆技术克隆了该基因,以期为明确该基因在黄瓜性别分化中的作用机制奠定基础,也为进一步试验研究提供基因材料。结果表明:该基因全长870bp,编码289个氨基酸,该基因编码的蛋白质属于叶绿体中一个不稳定的疏水蛋白质,无明显信号肽,无跨膜结构。与甜瓜为同一进化分支,同源性较高。该蛋白属于PAPfibrillin蛋白家族,因此将编码该蛋白的基因命名为CsPAP-fib。
[Abstract]:Using 'C09-123', a thermo-sensitive cucumber as material, a protein closely related to the effect of low night temperature on female formation of cucumber was screened by differential protein identification of young cucumber leaves treated with different night temperature. The bioinformatics method was used to study the effect of low night temperature on the female formation of cucumber. The protein was analyzed by bioinformatics and cloned by gene cloning technique in order to lay a foundation for clarifying the function mechanism of the gene in cucumber sex differentiation and to provide genetic materials for further experimental study. The results showed that the gene was 870 BP in length, encoding 289 amino acids. The protein encoded by the gene belonged to an unstable hydrophobic protein in chloroplast, with no obvious signal peptide and no transmembrane structure. It is the same evolutionary branch as muskmelon and has high homology. The protein belongs to the PAPfibrillin protein family, so the gene that encodes the protein is named CsPAP-fib.
【作者单位】: 东北农业大学园艺园林学院;
【基金】:黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划资助项目(UNPYSCT-2016007)
【分类号】:S642.2

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