甜瓜果斑病致病基因生物信息学分析

发布时间：2019-05-27 02:55

【摘要】：以已报道的甜瓜果斑病的致病基因和多个与致病性相关的未知蛋白为试材,采用生物信息学方法研究了其致病基因,并且利用生物信息学的工具和软件分析这些未知蛋白,以期为今后从分子水平防治果斑病奠定理论基础。结果表明:通过DNAMAN软件的比对分析,得到3个综合匹配程度较高的未知蛋白,预测这些蛋白是由该病菌Ⅲ型分泌系统的hrp基因簇编码;通过Bioedit和ProtParam软件工具分析获得6个未知蛋白的氨基酸组成、大小、分子质量、理论等电点和疏水性;同时运用DNAMAN软件分析得到相对应的二级结构。该研究结果可为今后深入研究此类基因提供指导作用。
[Abstract]:The pathogenic genes of muskmelon fruit spot disease and several unknown proteins related to pathogenicity were studied by bioinformatics method, and the unknown proteins were analyzed by bioinformatics tools and software. In order to lay a theoretical foundation for the prevention and treatment of fruit spot disease at the molecular level in the future. The results showed that three unknown proteins with high degree of comprehensive matching were obtained by DNAMAN software comparison and analysis, and it was predicted that these proteins were encoded by the hrp gene cluster of the type III secretory system of the pathogen. The amino acid composition, size, molecular weight, theoretical isoelectric point and hydrophobicity of six unknown proteins were obtained by Bioedit and ProtParam software tools, and the corresponding secondary structures were obtained by DNAMAN software analysis. The results of this study can provide guidance for the further study of this kind of genes in the future.
【作者单位】： 新疆大学生命科学与技术学院;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(31260258)
【分类号】：S436.5

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