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牛GUCY1A3和SFXN1基因的克隆及生物信息学分析

发布时间:2019-07-12 16:34
【摘要】:试验以人GUCY1A3和SFXN1基因序列为探针,BLAST获得同源性较高的牛的表达序列标签(ESTs)序列及部分mRNA序列。通过RT-PCR方法从牛肌肉及脑组织克隆cDNA序列与牛表达序列标签进行拼接,获得牛GUCY1A3和SFXN1基因,并对其进行了生物学特性分析。序列分析表明,牛GUCY1A3基因编码区长2 076bp,编码691个氨基酸;牛SFXN1基因编码区长969bp,编码322个氨基酸。氨基酸序列分析表明,GUCY1A3蛋白磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,主要分布在细胞质中,不属于分泌蛋白,二级结构预测以α螺旋为主,保守结构域含1个CYCc功能结构域;SFXN1蛋白磷酸化位点分布于丝氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和苏氨酸(Thr)残基上,主要分布在内质网和浆膜上,属于跨膜蛋白,二级结构以α螺旋为主,保守结构域含1段低复杂度序列和3段跨膜螺旋区。试验结果为进一步研究牛GUCY1A3和SFXN1基因的表达调控机制与功能奠定了基础。
[Abstract]:Using human GUCY1A3 and SFXN1 gene sequences as probes, the (ESTs) sequence and some mRNA sequences of bovine expression sequence tags with high homology were obtained by BLAST. Bovine GUCY1A3 and SFXN1 genes were obtained by splicing cDNA sequences from bovine muscle and brain tissue with bovine expression sequence tags, and their biological characteristics were analyzed. Sequence analysis showed that the coding region of bovine GUCY1A3 gene was 2076bp, encoding 691 amino acids, and the coding region of bovine SFXN1 gene was 969bp, encoding 322amino acids. Amino acid sequence analysis showed that the phosphate sites of GUCY1A3 protein were distributed on serine (Ser), tyrosine (Tyr) and threonine (Thr) residues, which were mainly distributed in cytoplasm and did not belong to secretory proteins. The secondary structure was predicted to be 伪 helix, and the conserved domain contained one CYCc functional domain. The phosphate sites of SFXN1 protein are distributed on serine (Ser), tyrosine (Tyr) and threonine (Thr) residues, mainly on endoplasmic reticulum and serosa. They belong to transmembrane protein. The secondary structure is mainly 伪 helix. The conserved domain contains 1 segment of low complexity sequence and 3 segments of transmembrane spiral region. The results laid a foundation for further study on the expression and regulation mechanism and function of bovine GUCY1A3 and SFXN1 genes.
【作者单位】: 天津农学院动物科学与动物医学学院;
【基金】:基金项目:高产转基因肉牛新品种培育(2014ZX08007-002)
【分类号】:Q78;S823

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号:2513829

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