小菜蛾抗氟苯虫酰胺种群的基因差异表达分析
【图文】：
图 2.1 RNA-Seq 实验流程图Fig.2.1 Principle and procedure of RNA-Seq2 标准信息分析流程图 2.2 所示，参照 NCBI 已经登录的小菜蛾基因组序列对 RNA-Seq 获得的相应的生物信息学注释分析。2.1 过滤杂质数据测序得到的原始图像数据经 base calling 软件转化为序列数据，结果以 FA（Cock PJAet al., 2010）存储并生成原始数据 raw data 或 raw reads。由于可能包含低质量序列、接头序列等，为了保证信息分析结果的可靠性，我na GAPipeline v1.5 软件，分析高通量数据的质量，将所得序列数据中碱基Sequencing quality）表示，测序错误率用 E 表示，则 Illumina HiSeqTM2000测序质量值存在以下关系：SQ =㧟10log10E（MinochenAE et al., 2011）。Ipeline v1.5 中 SQ 范围为 2 到 41，去除杂质数据得到 clean reads，数据过滤
图 2.2 RNA-Seq 注释分析流程图Fig.2.2Analysis process of the RNA-Seq experiment 与参考序列比对短 reads 比对软件 SOAPaligner/soap2 把 clean reads 分别比对到参考基基 因 序 列 上 ， 参 考 序 列 为 小 菜 蛾 基 因 组 www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/AHIO00000000.1） 测序评估统计每个样品由 raw reads 得到的测序碱基数、clean datas 占 Raw datds 比对到参考序列上的比例以及测序饱和度分析，来评估测序的质量 基因表达量统计泊松分布，参照 Audic S 等（1997）发表在 Genome Research 上的基检测方法，假设观测到基因 A 对应的 reads 数为 x，已知在一个大文表达量只占所有基因表达量的一小部分，，在这种情况下，x 的分布服
【学位授予单位】：山东农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S433.4
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本文编号：2525493
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