杨树MYB基因应答非生物胁迫的表达特性
发布时间:2019-08-19 13:10
【摘要】:MYB转录因子以其含有的保守MYB结构域为特征,是植物转录因子中数量最多的家族之一,广泛参与植物生长发育和代谢的调节。利用生物信息学分析获得222条杨树MYB基因,用实时定量PCR筛选出8条对盐胁迫有强烈应答的基因,研究其在盐、干旱、ABA等非生物胁迫下的表达模式;结果表明:这8条MYB基因虽然在杨树根、茎、叶组织中均有表达,但是在不同胁迫条件和不同组织中的表达水平明显不同。在盐和干旱胁迫条件下,8个基因在根、茎、叶中均被诱导表达,表现为相似的表达模式。在ABA处理条件下,而多数基因无明显应答。说明杨树MYB基因在应答环境变化与激素调节中具有不同的作用,并且在不同组织中的作用有所差异。
【图文】:
图1杨树MYB结构域氨基酸序列比对表3杨树MYB基因应答盐胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶相对表达量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中数据为平均值±标准差。2.3杨树MYB基因应答干旱胁迫表达模式在干旱迫条件下,8个MYB基因在叶中均被诱导表达,但多数基因在根和茎中的表达水平比在叶中的表达水平低,这种基因表达趋势与在盐胁迫条件下的的表达趋势相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在叶中被干旱诱导表达2倍以上,在根和茎中的表达水平变化不明显;PtrMYB164和PtrMYB185在根和叶中可被干旱诱导表达,而在茎中的表达水平则无明显变化;PtrMYB162在茎和叶中可被干旱诱导表达,而在根中的表达水平则无明显变化;PtrMYB96在干旱胁迫条件下,无论在根和茎中还是叶中,其表达水平变化不明显,均未超过2倍。可见PtrMYB96虽然响应盐胁迫,但对干旱胁迫无明显应答(表4)。说明有些杨树MYB基因在干旱胁迫条件下也表现出一定的组织特异性。表4杨树MYB基因应答PEG胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶的相对表达量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
图1杨树MYB结构域氨基酸序列比对表3杨树MYB基因应答盐胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶相对表达量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中数据为平均值±标准差。2.3杨树MYB基因应答干旱胁迫表达模式在干旱迫条件下,,8个MYB基因在叶中均被诱导表达,但多数基因在根和茎中的表达水平比在叶中的表达水平低,这种基因表达趋势与在盐胁迫条件下的的表达趋势相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在叶中被干旱诱导表达2倍以上,在根和茎中的表达水平变化不明显;PtrMYB164和PtrMYB185在根和叶中可被干旱诱导表达,而在茎中的表达水平则无明显变化;PtrMYB162在茎和叶中可被干旱诱导表达,而在根中的表达水平则无明显变化;PtrMYB96在干旱胁迫条件下,无论在根和茎中还是叶中,其表达水平变化不明显,均未超过2倍。可见PtrMYB96虽然响应盐胁迫,但对干旱胁迫无明显应答(表4)。说明有些杨树MYB基因在干旱胁迫条件下也表现出一定的组织特异性。表4杨树MYB基因应答PEG胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶的相对表达量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
【作者单位】: 林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学);
【基金】:国家级大学生创新创业训练计划项目(201610225001)
【分类号】:Q943.2
本文编号:2528275
【图文】:
图1杨树MYB结构域氨基酸序列比对表3杨树MYB基因应答盐胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶相对表达量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中数据为平均值±标准差。2.3杨树MYB基因应答干旱胁迫表达模式在干旱迫条件下,8个MYB基因在叶中均被诱导表达,但多数基因在根和茎中的表达水平比在叶中的表达水平低,这种基因表达趋势与在盐胁迫条件下的的表达趋势相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在叶中被干旱诱导表达2倍以上,在根和茎中的表达水平变化不明显;PtrMYB164和PtrMYB185在根和叶中可被干旱诱导表达,而在茎中的表达水平则无明显变化;PtrMYB162在茎和叶中可被干旱诱导表达,而在根中的表达水平则无明显变化;PtrMYB96在干旱胁迫条件下,无论在根和茎中还是叶中,其表达水平变化不明显,均未超过2倍。可见PtrMYB96虽然响应盐胁迫,但对干旱胁迫无明显应答(表4)。说明有些杨树MYB基因在干旱胁迫条件下也表现出一定的组织特异性。表4杨树MYB基因应答PEG胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶的相对表达量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
图1杨树MYB结构域氨基酸序列比对表3杨树MYB基因应答盐胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶相对表达量PtrMYB171.429±0.051.136±0.076.948±0.92PtrMYB961.244±0.101.265±0.357.101±0.48PtrMYB1391.609±0.621.392±0.388.052±0.99PtrMYB1626.704±0.212.918±0.024.262±0.43PtrMYB1649.501±1.262.427±0.0410.797±0.97PtrMYB1682.519±08.750±0.117.714±1.15PtrMYB1854.454±0.241.902±0.988.558±0.39PtrMYB2122.655±0.062.934±0.054.212±0.90注:表中数据为平均值±标准差。2.3杨树MYB基因应答干旱胁迫表达模式在干旱迫条件下,,8个MYB基因在叶中均被诱导表达,但多数基因在根和茎中的表达水平比在叶中的表达水平低,这种基因表达趋势与在盐胁迫条件下的的表达趋势相似(表4)。PtrMYB17、PtrMYB139和PtrMYB168只在叶中被干旱诱导表达2倍以上,在根和茎中的表达水平变化不明显;PtrMYB164和PtrMYB185在根和叶中可被干旱诱导表达,而在茎中的表达水平则无明显变化;PtrMYB162在茎和叶中可被干旱诱导表达,而在根中的表达水平则无明显变化;PtrMYB96在干旱胁迫条件下,无论在根和茎中还是叶中,其表达水平变化不明显,均未超过2倍。可见PtrMYB96虽然响应盐胁迫,但对干旱胁迫无明显应答(表4)。说明有些杨树MYB基因在干旱胁迫条件下也表现出一定的组织特异性。表4杨树MYB基因应答PEG胁迫表达模式基因名称根的相对表达量茎的相对表达量叶的相对表达量PtrMYB171.932±0.571.231±0.072.930±0.15PtrMYB961.540±0.061.667±0.371.808±0.55PtrMYB1391.488±0.201.833±0.132.294±0.09PtrMYB1621.065±0.423.813±0.232.299±
【作者单位】: 林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学);
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【分类号】:Q943.2
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