基于Cyt b基因和形态学的鼠兔属系统发育研究及鼠兔属1新亚属5新种描述

发布时间：2019-09-24 22:58

【摘要】：本研究扩增了169号鼠兔属样本的Cyt b基因序列,代表13个种11个亚种及5个未分类单元,下载了66条分类地位确定而完整的Cyt b基因序列,包括25种及9个亚种。构建了Bayesian系统发育树,计算了遗传距离,开展了物种界定分析;对13个种4亚种及5个未分类单元174号完整头骨和外形的20个形态学量度数据进行主成分分析、判别分析和T检验;对头骨和身体外部特征进行了比较研究。结果显示:鼠兔属包含5个亚属,分别是Ochotona,Conothoa,Pika,Lagotona和一新亚属;5个亚属间的遗传距离在12.8%-16.0%之间;高黎贡鼠兔(Ochotona gaoligongensis)是灰颈鼠兔(O.forresti)的亚种;喜马拉雅鼠兔(O.himalayana)是灰鼠兔(O.roylei)的亚种;木里鼠兔(O.muliensis)是川西鼠兔(O.gloveri)的亚种;宁夏鼠兔(O.argentata)应为蒙古鼠兔(O.pallasi)的亚种;西伯利亚鼠兔(O.turuchanensis)为高山鼠兔(O.alpina)的同物异名。藏鼠兔循化亚种(O.thibetana xunhuaensis)应提升为种:循化鼠兔(O.xunhuaensis);东北鼠兔长白山亚种(O.hyperborea coreana)应该提升为种:长白山鼠兔(O.coreana);藏鼠兔峨眉亚种(O.thibetana sacraria)应提升为种:峨眉鼠兔(O.sacraria);藏鼠兔锡金亚种(O.thibetana sikimaria)应提升为种:锡金鼠兔(O.sikimaria)。通过分子系统学和形态学研究,发现了鼠兔属1新亚属和5个新种。新亚属命名为异耳鼠兔亚属(Alienauroa subgen.n.),属模为黄龙鼠兔(O.huanglongensis sp.n.),成员包括黄龙鼠兔新种、峨眉鼠兔、循化鼠兔,以及在龙门山和大巴山发现的2个新种,共计5个种。新亚属的鉴定特征是:耳上前缘内侧有一个密被短毛的异耳屏(Congenial tragus);头骨扁平,颅面平直;眼小,眼眶长和眼眶宽均小于其他亚属;被毛粗长而无光泽;腹毛多为灰白色。5个新种分别发现于四川黄龙自然保护区、四川北部龙门山、四川北部大巴山、四川西部邛崃山、西藏雅鲁藏布江中游的朗县。我们分别将其命名为黄龙鼠兔(Ochotona huanglongensis sp.n.)、扁颅鼠兔(Ochotona flatcalvariam sp.n.)、大巴山鼠兔(Ochotona dabashanensis sp.n.)、雅鲁藏布鼠兔(Ochotona yarlungensis sp.n.)和邛崃鼠兔(Ochotona qionglaiensis sp.n.)。黄龙鼠兔的鉴定特征是:门齿孔前段平行;脑颅扁平,颅高为颅全长的33.5%;耳大,平均20 mm以上(不含耳基部的管),异耳屏三角形,但顶端圆形;毛长而粗糙,无光泽,背部毛长约20 mm;腹面毛色以灰白为主;前后足背面灰白色,腹面黑灰色,指(趾)垫大,橘黄色,露出毛外,爪黄白色半透明。扁颅鼠兔的鉴定特征是:脑颅异常扁平,颅高约11 mm,颅高仅为颅全长的31%;眼眶很小,平均6.7 mm×5.6 mm;个体小,体长140 mm以下;体毛长而粗糙无光泽,背部毛长22 mm;耳小,平均17 mm左右,异耳屏阔圆型,相对较小;背毛沙黄色,腹毛黄白。大巴山鼠兔的鉴定特征是:异耳屏镰刀状;耳相对较小,均在17 mm以下,和峨眉鼠兔、扁颅鼠兔差不多,比该亚属循化鼠兔和黄龙鼠兔小。颅高相对较大,颅面更隆突,颅高平均12.45 mm,眼眶相对较大,平均8.52 mm×7.13 mm。雅鲁藏布鼠兔的鉴定特征是:与黑唇鼠兔(O.curzoniae)和努布拉克鼠兔拉萨亚种(O.nubrica lhasaensis)有很近的亲缘关系;唇缘有很窄的深灰色圈,深灰色圈外侧为灰白色;前后足底部毛浓密,趾端毛多而长,趾垫和爪隐于毛中;个体中等,体长150 mm左右,比黑唇鼠兔和努布拉克鼠兔拉萨亚种小得多;颅面较隆突,但与黑唇鼠兔相比,颅面相对平直;被毛黑褐色。邛崃鼠兔的鉴定特征是:大小及头骨和藏鼠兔很相似,但该种和藏鼠兔的显著不同是眶间宽狭窄,平均4.05(3.64-4.19)mm,而藏鼠兔眶间宽一般超过4.2 mm,平均为4.45 mm;该种毛色为沙色带黄色调,毛粗长;藏鼠兔为黑褐色调,毛相对较短;邛崃鼠兔前后足背面为显著的草黄色,而藏鼠兔前后足背面黄白色。
【图文】：

疑似)、高黎贡鼠兔(地模标本)、喜马拉雅鼠兔(地模标本)、木里鼠兔(地模标本)、川西鼠兔指名亚种(O.gloverigloveri)、川西鼠兔青海亚种(O.gloveribrookei)(地模标本)、东北鼠兔长白山亚种(O.hyperboreacoreana)及采自黄龙、龙门山、大巴山和西藏林芝地区及四川邛崃山的5个未归类种。为了对比，我们从GenBank中下载了66条完整、没有质疑的Cytb序列，代表25种9亚种。根据前人的研究(Lissovskyetal.，2014)，从GenBank中下载14条兔科种类Cytb做外群(分子系统学研究用标本及基因序列号见附表2，本研究采集的样品分布点见图1)。图1分子系统学研究样本采集点(GPS点位图)Fig.1SamplesdistributionofthespeciesofOchotonausedinthisstudy5

兽类学报37卷图2基于Cytb的鼠兔属系统发育树Fig.2FiftypercentmajorityruleconsensustreefromBayesianinferenceanalysisofCytbsequences.NumbersareBayesianposteriorproba-bilities，andonlycriticalnodesarepresentedwithposteriorprobabilityorbootstrapvalues2.1.2遗传距离基于Cytb计算的遗传距离显示，5个独立进化支之间的遗传距离在12.8%－16.0%之间(表1)。新进化支与指名亚属(Ochotona)之间的遗传距离最近，为12.8%，与Lagotona亚属之间的遗传距离最远，为15.8%;其与Pika，Conothoa之间的遗传距离分别为13.7%和15.8%。在新进化支内部(表2)，藏鼠兔循化亚种、藏鼠兔峨眉亚种及采集于黄龙、大巴山和龙门山的标本之间的遗传距离为6.0%－10.3%，而藏鼠兔循化亚种与藏鼠兔之间的遗传距离达到14.7%，藏鼠兔峨眉亚种和藏鼠兔之间的遗传距离达到15.0%;在指名亚属内(表3)，8个独立进化支的遗传距离在4.8%－9.5%之间，最短遗传距离出现在黑唇鼠兔和采自西藏雅鲁藏布江中游的未归类标本之间(4.8%);藏鼠兔锡金亚种和藏鼠兔的遗传距离为8.0%，，和间颅鼠兔的遗传距离为6.6%;采自邛崃山的未归类标本和它外形最相似的藏鼠兔的遗传距离为9.2%。Conothoa亚属内9个独立进化支之间的遗传距离很大(表4)，在8.2%－14%之间。在独立进化支内的一些小进化支之间的遗传距离很小，如木里鼠兔和川西鼠兔之间的遗传距离小于川西鼠兔种内的遗传距离;喜马拉雅鼠兔与灰鼠兔的遗产距离只有4%;片马鼠兔(疑似)和灰颈鼠兔之间的遗传距离只有4.3%;8
【作者单位】： 四川省林业科学研究院;四川大学生命科学学院;四川唐家河国家级自然保护区;四川黄龙自然保护区;青海孟达天池国家级自然保护区;四川省巴中市林业局;
【基金】：国家自然科学基金项目(30970330,31272274,31470110) 北京大学RAP调查项目 四川省林业厅众多自然保护区调查项目 西藏工布自然保护区本底调查项目
【分类号】：Q959

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本文编号：2541096