全基因组水平上芸薹属Mlo抗病基因的比较分析
【图文】：
图2拟南芥和芸薹属物种MLO类型抗病基因的保守跨膜结构域Fig．2ConservativetransmembranemotifsofMLOgenefamilyinA．thalianaandBrassicaspecies有些基因家族的成员出现了1拷贝保留，有的呈现了2拷贝保留，，有的成员还在3拷贝保留的基础上，又出现了更多的拷贝。Mlo5，Mlo7和Mlo15基因在白菜和甘蓝基因组中出现了1拷贝保留，在油菜基因组中有2拷贝保留。Mlo1、Mlo10和Mlo11在白菜和甘蓝基因组中呈现了2拷贝保留，在油菜基因组中呈现4拷贝保留。Mlo2、Mlo6和Mlo12在白菜和甘蓝基因组中呈现了3拷贝或超过3拷贝的保留，在油菜基因组中呈现了超过6拷贝的保留。MLO类型抗病基因拷贝数的增加，意味着对应的功能增强，增强了芸薹属物种对环境的适应性。表2拟南芥和芸薹属物种MLO家族成员的扩张和丢失Table2ExpansionandlossofMLOrelatedgenesamongA．thalianaandBrassicaspecies基因GeneA．thalianaB．rapaB．oleraceaB．napusMlo11225Mlo21467Mlo31000Mlo41212Mlo51112Mlo61347Mlo71112Mlo81003Mlo91000Mlo101224Mlo111224Mlo1213410Mlo131124Mlo141125Mlo151112全部Total152318573讨论与结论MLO家族主要负责液泡铁/锰离子转运过程。该家族成员大多定位于液泡膜上，均含有Mlo特征性结构域［13］。Mlo基因普遍存在于不同物种之中，但是其生理功能随物种不同有所差异。至今为止，MLO家族还没有在芸薹属物种中得到系统的鉴定，为探讨Mlo基因在拟南芥、白菜、甘蓝、甘蓝型油菜中可能的作用和演化机制，本研究基于已获得的拟南芥、白菜、甘蓝和油菜全基因组数据进行了全面分析［15～18］。基于MLO家族保守结构域的隐马模型的profile，在四个物种全基因组的蛋白序列中进行Mlo基因检索，最后得到15个拟南
【作者单位】： 南阳师范学院;
【基金】：河南省科技厅产学研合作项目(162107000007)
【分类号】：Q943.2;S435.654
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本文编号：2549767
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