施氏鲟Asnanos1基因序列分析及其在雌雄不同组织中表达
【图文】：
MarineSciences/Vol.41,No.4/201719图1Asnanos1全长cDNA序列及氨基酸序列Fig.1cDNAanddeducedaminoacidsequencesoftheAsnanos1gene黄色底为磷酸化位点;起始密码子atg用红色线表示;终止密码子taa用加粗表示;灰色区域为α螺旋。下划线所指示的区域为保守的-CCHC-锌指结构域,黑色加粗显示的为核心的Cys或HisPhosphorylationsitesaremarkedinyellow;Theinitiationcodon(atg)ismarkedbyredline;Thestopcodon(taa)ischaracterizedinbold;Fiveα-helixedaremarkedwithgray;Conserved-CCHC-zincfingerdomainisunderlined;CysorHisareinbold图2推测的Asnanos1氨基酸序列的三级结构Fig.2Predictedthree-dimensionalstructureoftheAsnanos1gene结果显示(图4),Asnanos1基因在施氏鲟除心脏以外的各组织中均有表达,在雌、雄鱼的鳃、脑、肾、肝脏、脾脏等组织中表达量无显著差异,但在卵巢中的表达量显著高于其他各组织(P<0.05)。3讨论与结论本研究获得了Asnanos1的cDNA全长为1389bp,其中,5′UTR为414bp,3′UTR为279bp以及696bp的ORF。该基因共编码231个氨基酸。Blast分析可知,Asnanos1与nanos2和nanos3在分类进化上的关系较远,而与nanos1聚为一大支。这些结果充分表明本研究所得到的基因序列为Asnanos1。系统进化树结果显示:在nanos1的进化中,施氏鲟与斑点雀鳝聚为一支,但与中华鲟有一定的距离,产生这个现象的原因有待于进一步研究。Asnanos1蛋白氨基酸序列的C端具有两个保守-CCHC-(-Cys-Cys-His-Cys-)锌指结构域,这一结构特征与在其他物种nanos1中也同样存在,是nanos1蛋白发挥功能所必需的。
MarineSciences/Vol.41,No.4/201719图1Asnanos1全长cDNA序列及氨基酸序列Fig.1cDNAanddeducedaminoacidsequencesoftheAsnanos1gene黄色底为磷酸化位点;起始密码子atg用红色线表示;终止密码子taa用加粗表示;灰色区域为α螺旋。下划线所指示的区域为保守的-CCHC-锌指结构域,黑色加粗显示的为核心的Cys或HisPhosphorylationsitesaremarkedinyellow;Theinitiationcodon(atg)ismarkedbyredline;Thestopcodon(taa)ischaracterizedinbold;Fiveα-helixedaremarkedwithgray;Conserved-CCHC-zincfingerdomainisunderlined;CysorHisareinbold图2推测的Asnanos1氨基酸序列的三级结构Fig.2Predictedthree-dimensionalstructureoftheAsnanos1gene结果显示(图4),Asnanos1基因在施氏鲟除心脏以外的各组织中均有表达,在雌、雄鱼的鳃、脑、肾、肝脏、脾脏等组织中表达量无显著差异,但在卵巢中的表达量显著高于其他各组织(P<0.05)。3讨论与结论本研究获得了Asnanos1的cDNA全长为1389bp,其中,5′UTR为414bp,3′UTR为279bp以及696bp的ORF。该基因共编码231个氨基酸。Blast分析可知,Asnanos1与nanos2和nanos3在分类进化上的关系较远,而与nanos1聚为一大支。这些结果充分表明本研究所得到的基因序列为Asnanos1。系统进化树结果显示:在nanos1的进化中,施氏鲟与斑点雀鳝聚为一支,但与中华鲟有一定的距离,产生这个现象的原因有待于进一步研究。Asnanos1蛋白氨基酸序列的C端具有两个保守-CCHC-(-Cys-Cys-His-Cys-)锌指结构域,这一结构特征与在其他物种nanos1中也同样存在,是nanos1蛋白发挥功能所必需的。
【作者单位】： 莆田市水产科学研究所;集美大学水产学院;福建农林大学动物科学学院;
【基金】：国家自然科学基金资助项目(41306174) 福建省农业科技重点资助项目(2013N0024) 莆田市科技局项目(2012N16)~~
【分类号】：S917.4
【参考文献】
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【共引文献】
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【二级参考文献】
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，本文编号：2551643
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