高通量测序时代下持家基因定义的发展

发布时间：2020-03-17 13:06

【摘要】：持家基因一般指在所有细胞中均稳定表达的一类组成型基因,其产物是维持细胞基本生命活动所必需的。持家基因的定义及其发展,反映了其本质和时代特征。本文从基因表达水平量化技术的角度,结合作者利用转录组数据对猪持家基因的分析,讨论了持家基因的定义及其发展,尤其是技术的进步及数据量的剧增对持家基因的定义所引发的问题。本文总结发现,应该在研究技术的进步中,动态地认识持家基因定义所具有的层次性,从而对持家基因的定义不断赋予新的时代特征。
【图文】：

广泛性,基因表达

基可以提供单碱定义过程中，变异[56,57]，从第三，转录组使其能够准确测序具有较好可检测性。不定量表达值不些特点，利用提高了基因的序时代下持家基组出家除计eder对标基，因况表基一平筛达的的家基碱从组确好不不用的可检测且可利持家基定义的2.4.3为本文从format获取了(肌肉、小脑、网膜、淋巴)。化，并下4个个组织本在不本在所小于4持家基在21远多于数据定为平的定的表达组织。图2Fig.2基因定义的发展测性，也可准利用不同的操基因，进而进的可靠性。以猪转录组家基因的优为了探索RN从NCBI(Natiotion)的SRA(了15个实验用、心、肝、脾枕叶皮层、肠系膜、子。利用FPKM并对基因表达个标准定义持织中均表达；不同组织中的所有样本中的，进一步针基因的所有转个组织中，microarrays定义持家基因为避免上述多定量，选取单一达稳定性。该利用K-S一致猪基因表达广Thebreadth展准确的评估基操作单元(转录进行相互验证组数据为例，优势NA-seq数据定onalCenterSequenceRe用的21种猪脾、肺、肾、子宫内膜、子宫、卵巢、M方法对RN达的广泛性进行持家基因：((2)通过K-S的表达水平稳的任一表达值针对表达稳定转录本都必须6072(约20%s数据检测量因具有较大检多个实验间的一实验(PRJE实验共有10致性检验评估广泛性分布distributionof基因表达的稳录本和外显子证，加强了对探索RNA-s定义持家基因forBiotechneadAchieve)猪组织的RNA、下丘脑、额性腺、皮下睾丸、胎盘NA-seq数据行检测(图2)

广泛性,基因表达

基可以提供单碱定义过程中，变异[56,57]，从第三，转录组使其能够准确测序具有较好可检测性。不定量表达值不些特点，利用提高了基因的序时代下持家基组出家除计eder对标基，因况表基一平筛达的的家基碱从组确好不不用的可检测且可利持家基定义的2.4.3为本文从format获取了(肌肉、小脑、网膜、淋巴)。化，并下4个个组织本在不本在所小于4持家基在21远多于数据定为平的定的表达组织。图2Fig.2基因定义的发展测性，，也可准利用不同的操基因，进而进的可靠性。以猪转录组家基因的优为了探索RN从NCBI(Natiotion)的SRA(了15个实验用、心、肝、脾枕叶皮层、肠系膜、子。利用FPKM并对基因表达个标准定义持织中均表达；不同组织中的所有样本中的，进一步针基因的所有转个组织中，microarrays定义持家基因为避免上述多定量，选取单一达稳定性。该利用K-S一致猪基因表达广Thebreadth展准确的评估基操作单元(转录进行相互验证组数据为例，优势NA-seq数据定onalCenterSequenceRe用的21种猪脾、肺、肾、子宫内膜、子宫、卵巢、M方法对RN达的广泛性进行持家基因：((2)通过K-S的表达水平稳的任一表达值针对表达稳定转录本都必须6072(约20%s数据检测量因具有较大检多个实验间的一实验(PRJE实验共有10致性检验评估广泛性分布distributionof基因表达的稳录本和外显子证，加强了对探索RNA-s定义持家基因forBiotechneadAchieve)猪组织的RNA、下丘脑、额性腺、皮下睾丸、胎盘NA-seq数据行检测(图2)

【参考文献】