应激反应基因遗传变异与儿童注意缺陷多动障碍的关联研究
【图文】:
图 1 琼脂糖电泳检测部分 DNA 样本结果1.3.2 候选基因遗传变异位点筛选单核苷酸多态性(SNP)由单个核苷酸变异引起的 DNA 序列多态性,,单个碱基的改变在人群中的发生频率(等位基因频率)在 0%到 50%之间[86]。SNP 是人类可遗传变异中最常见的一种,占所有已知多态性的 90%以上。目前已发现人类基因组 SNP 总数有达 400 万各,平均每 1000 个碱基中就有 1 个[87]。部分 SNP会直接影响到蛋白质结构或基因表达水平,从而参与疾病遗传机制。本研究中综合 考 虑 以 下 信 息 进 行 SNP 位 点 的 筛 选 : 在 HapMap 数 据 库(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/cgi-perl/gbrowse/hapmap28_B36/)中公布的中国汉族人群(CHB)数据中获取 NR3C1 和 SLC6A4 两个基因全部 SNP 位点,然后通过 SNP-info 数据库(https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/snptag.html)筛选出标签 SNP(tagSNP)和有功能注释的潜在功能 SNP,过滤条件选择 MAF 0.1,r2 0.8的 CHB 人群,结合 F-SNP 数据库[88](http://compbio.cs.queensu.ca/F-SNP/)中各
图 2 F-SNP 功能预测流程图表 1 候选 SNP 功能注释整合分析基因 SNP TagSNP SNPfunc F 得分 Regulome DBNR3C1 rs41423247 N -- 0.176 5rs10052957 N -- 0.268 5rs6191 N miRNA(miRanda) 0.217 --SLC6A4 rs3813034 N -- 0.204 6rs12449783 Y -- 0.176 4rs25531 N TFBS 0.217 5rs2020939 Y -- 0.000 1f表 2 候选基因 SNP 位点基本信息
【学位授予单位】:华中科技大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:R749.94
【参考文献】
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本文编号:2628716
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