柑橘黄化脉明病毒侵染对柠檬基因及小RNA表达的影响

发布时间：2020-05-27 08:48

【摘要】：柑橘黄化脉明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)是我国新近发现的危害柠檬的重要病毒,目前对其致病机制的研究较少。本研究以1年生柠檬实生苗为寄主植物,对嫁接接种CYVCV和模拟接种的柠檬植株叶片分别进行了转录组及小RNA测序,利用生物信息学技术挖掘CYVCV侵染诱导差异表达的基因和miRNA,研究这些基因和miRNA在柠檬应答CYVCV胁迫中的功能。取得的研究结果如下:1.将接种后第30 d、60 d和90 d三个时间点收集的CYVCV侵染及对照柠檬植株叶片样品分别进行等量混合后进行转录组测序。测序结果显示,受CYVCV侵染的柠檬样品中有679个基因上调表达,637个基因下调表达,这些基因中分别有1114个和453个注释到GO功能和KEGG通路。GO功能主要集中在生物学过程和分子功能,其中细胞间信息传递、氧化还原过程、对真菌的防御反应、酶激活和酶抑制等功能富集最为显著。KEGG通路主要集中在代谢通路,其中光合作用、叶绿素生物合成与代谢、碳代谢和光合作用中的碳固定途径富集最为显著,共包含68个差异表达基因,推测这些代谢途径的基因表达量变化可能与柠檬受CYVCV侵染后叶片表现的叶片褪绿及黄化等症状相关。2.选取与光合作用、叶绿素生物合成与代谢以及碳代谢等通路相关的16个差异表达基因进行qRT-PCR分析,结果显示这些基因存在时间动态变化,其中有6个基因为先下调后上调表达,4个为先上调后下调表达。同时选取5个AGO同源基因和3个DCL同源基因进行qRT-PCR分析,结果显示有7个基因存在差异表达变化。分析这些基因的时间动态变化发现多数基因在第60 d的表达量变化明显与30 d和90 d不同。根据qRT-PCR结果筛选出6个差异显著的基因,分析其在CYVCV侵染的甜橙和小h久手仓曛斜泶锪勘浠，

本文编号：2683276