家蚕抗病毒候选基因BmPGRP-S2和BmSCP1的功能研究及抗性素材制备
【图文】:
1. 文献综述double-stranded RNA,dsRNA)介导细胞内靶基因的 mRNA 发生特致相应基因沉默的现象[47]。该现象首先在植物中发现,之后陆续在有报道[47, 48]。RNAi 是宿主免疫机制中一条重要的防御通路[49, 50],种不同的模式:转录抑制模式和 RNAi 切割模式[51]。在转录抑制模A 进入细胞后被 Dicer-2 切割成 21-23nt 大小的小干扰 RNA(small inter,siRNA),随后 siRNA 的一条链被整合进一种叫做 RNA 诱导的沉NA-induced silencing complex,RISC)中,最后 RISC 在 siRNA 的引 mRNA 结合,将该靶标 mRNA 降解。第二种模式是 RNAi 切割模侵为例,,病毒的 dsRNA 首先被细胞内的 Dicer-2 识别,随后被具有核ase III)活性的 Dicer-2 切割为 21 nt 大小的 siRNA。siRNA 与 RISC 一起装配形成成熟的 RISC 复合体,在碱基互补配对原则的指导下A 被切割降解,从而抑制病毒复制。
图 3.1 BmPGRP-S2 的序列分析Fig 3.1 The sequence analysis of BmPGRP-S2.划线:信号肽;红色字体:PGRP 结构域;黄色方框:Ami_2 结构域;*:终止密码子derline, the signal peptide; red words, the PGRP domain; yellow box, the Ami_2 domain; asterisk, the don.3.2 BmPGRP-S2 不具备酰胺酶活性将 BmPGRP-S2 的氨基酸序列放入 NCBI 中进行 Blast 比对,选取典型的不酰胺酶活性的 PGRP(sDmPGRP-SA、HsPGRP-IαC)和具有酰胺酶活性的 PGRBmPGRP-S5、DmPGRP-SC1b)以及 T7 溶菌酶的氨基酸序列进行多序列对比,发现 T7 噬菌体溶菌酶中的酰胺酶活性关键氨基酸半胱氨酸位点,在具备酶活性的 PGRPs 中同样为半胱氨酸,在无酰胺酶活性的 PGRPs 中被丝氨酸代。BmPGRP-S2 的第 171 个氨基酸同样被丝氨酸所取代。因此,BmPGRP具备酰胺酶活性。比对结果如图 3.2 所示。
【学位授予单位】:西南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S884.5
【参考文献】
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本文编号:2708903
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