茶树硫酸盐转运蛋白基因对硒的响应及CsSULTR3.5功能分析
发布时间:2020-08-09 14:43
【摘要】:硒的丰缺与人体健康密切相关,硒缺乏或过量都会对机体产生不利影响。人类饮食中大部分的硒是直接或间接从植物中获得的,植物可食用部分硒含量的高低直接影响人体膳食的硒摄入水平。在世界范围内,缺硒现象十分普遍。茶树具有较强的富硒能力,是理想的补硒资源。深入研究茶树对硒的吸收和转运机制,对于茶树硒生物强化和遗传改良具有重要意义。本研究基于茶树基因组和转录组测序结果,从中筛选出硫酸盐转运蛋白基因家族的多条EST序列,利用RT-PCR克隆获得了8个茶树硫酸盐转运蛋白基因的cDNA序列。利用实时荧光定量PCR技术研究了CsSULTRs在不同硒/硫处理条件下的表达变化及其在茶树不同组织的表达情况,探讨了茶树CsSULTRs对硒的响应机理。并对CsSULTR3.5进行了功能初步分析。主要研究结果如下:1.生物信息学分析表明,CsSULTRs都含有硫酸盐转运蛋白典型的SLC26A/SulP transporter结构域和STAS结构域。根据与其他物种SULTR同源性远近,将克隆获得的CsSULTRs分别命名为CsSULTR1.1(GenBank登录号:KY963791)、CsSULTR1.2(GenBank登录号:KY963792)、CsSULTR2.1(GenBank登录号:KY977431)、CsSULTR3.1(GenBank登录号:KY963793)、CsSULTR3.2(GenBank登录号:KY977432)、CsSULTR3.3(GenBank登录号:MF596178)、CsSULTR3.5(GenBank登录号:MG792805)、CsSULTR4.1(GenBank登录号:KY963794)。2.qRT-PCR研究结果表明,茶树中的CsSULTRs对不同SeO_4~(2-)/SO_4~(2-)处理的响应模式不同。其中,根中的CsSULTR1.1受短时缺硫诱导显著上调表达,根中的CsSULTR1.2对加硒处理有特异性响应;而茎中的CsSULTR2.1及第3亚家族的4个成员均受缺硫处理及加硒处理诱导;CsSULTR4.1的表达则不受外界SO_4~(2-)/SeO_4~(2-)供应水平的影响。3.组织表达特异性分析结果表明,CsSULTRs在茶树的地上部和地下部、营养器官和生殖器官中均有表达。其中,在幼龄茶树中,CsSULTR1.1和CsSULTR1.2主要在根中表达;CsSULTR2.1以及第3亚家族的4个成员均在茎中高表达;CsSULTR4.1主要在茎和叶中表达。而成年茶树中,CsSULTR1.2在茎中高表达;CsSULTR2.1在花中的表达量最高;CsSULTR4.1主要在生殖器官(花和果)中的表达。此外,研究发现,CsSULTR3.5在各组织的表达丰度较其他基因高。4.构建CsSULTR3.5-GFP融合表达载体,瞬时转化水稻原生质体,通过激光扫描共聚焦观察发现CsSULTR3.5定位于细胞质膜。克隆获得CsSULTR3.5基因起始密码子(ATG)上游2 516 bp的启动子序列,顺式作用元件预测显示该区域存在多种激素响应元件、光响应元件、胁迫应答元件以及结合位点,表明该基因的表达受多种因素调控。对不同生长阶段的pCsSULTR3.5::GUS转基因拟南芥进行GUS染色,研究发现,除种子和子叶外,转基因株系各部位都有GUS活性,其中维管组织中的GUS活性最高。CsSULTR3.5过表达转基因拟南芥在不同硒/硫处理条件下的表型均与野生型拟南芥无显著差异。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S571.1
【图文】:
图 2.1 茶树硫酸盐转运蛋白基因 CsSULTRs 克隆电泳图Fig. 2.1 The electrophoresis result of the cloning of the sulfate transporter gene CsSULTRs in tea plantM:DL2000 maker;A:CsSULTR1.1; B:CsSULTR1.2; C:CsSULTR2.1;D:CsSULTR3.1;E:CsSULTR3.2; F:CsSULTR3.3; G:CsSULTR3.5; H:CsSULTR4.12.2.2 CsSULTRs 序列分析表 2.2 茶树硫酸盐转运蛋白氨基酸组成和理化性质分析Table 2.2 The analysis of amino acid composition and physicochemical properties of all identified CsULTRs genes基因名称Gene name登录号Accession No.开放阅读框ORF(bp)氨基酸Amino Acids理论等电点pI分子量Mw(kDa)CsSULTR1.1 KY963791 1 977 658 8.99 72.58CsSULTR1.2 KY963792 1 977 658 9.04 72.44CsSULTR2.1 KY977431 1 962 653 9.12 71.54CsSULTR3.1 KY963793 1 980 659 7.61 72.39CsSULTR3.2 KY977432 1 953 650 8.79 71.21CsSULTR3.3 MF596178 2 061 686 9.01 74.91
14图 2.2 CsSULTRs 亲/疏水性分析Fig. 2.2 Prediction for hydrophilicity or hydrophobicity of CsULTRsSignalP4.1 Server 信号肽预测结果显示,克隆获得的 8 个茶树硫酸盐转运蛋白均无信号都属于非分泌蛋白。
15图 2.3 CsSULTRs 信号肽预测Fig. 2.3 The Signal peptide prediction of CsULTRsTMHMM 跨膜螺旋结构域预测结果显示,CsSULTR1.1、CsSULTR1.2、CsSULTR2.1、CsSULTR3.1、CsSULTR3.2、CsSULTR3.3、CsSULTR3.5、CsSULTR4.1 分别具有 10、10、8、10、12、9、11、12 个跨膜区(TMs)。蛋白质磷酸化是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本、最普遍,也是最重要的机制。利用NetPhos 3.1 Server 对 CsSULTRs 的磷酸化位点进行预测发现,第 1 亚家族两个成员 CsSULTR1.1和 CsSULTR1.2 的磷酸化位点较少,分别为 46 个和 44 个;CsSULTR3.5 的磷酸化位点最多,共有 63 个磷酸化位点(表 2.3)。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S571.1
【图文】:
图 2.1 茶树硫酸盐转运蛋白基因 CsSULTRs 克隆电泳图Fig. 2.1 The electrophoresis result of the cloning of the sulfate transporter gene CsSULTRs in tea plantM:DL2000 maker;A:CsSULTR1.1; B:CsSULTR1.2; C:CsSULTR2.1;D:CsSULTR3.1;E:CsSULTR3.2; F:CsSULTR3.3; G:CsSULTR3.5; H:CsSULTR4.12.2.2 CsSULTRs 序列分析表 2.2 茶树硫酸盐转运蛋白氨基酸组成和理化性质分析Table 2.2 The analysis of amino acid composition and physicochemical properties of all identified CsULTRs genes基因名称Gene name登录号Accession No.开放阅读框ORF(bp)氨基酸Amino Acids理论等电点pI分子量Mw(kDa)CsSULTR1.1 KY963791 1 977 658 8.99 72.58CsSULTR1.2 KY963792 1 977 658 9.04 72.44CsSULTR2.1 KY977431 1 962 653 9.12 71.54CsSULTR3.1 KY963793 1 980 659 7.61 72.39CsSULTR3.2 KY977432 1 953 650 8.79 71.21CsSULTR3.3 MF596178 2 061 686 9.01 74.91
14图 2.2 CsSULTRs 亲/疏水性分析Fig. 2.2 Prediction for hydrophilicity or hydrophobicity of CsULTRsSignalP4.1 Server 信号肽预测结果显示,克隆获得的 8 个茶树硫酸盐转运蛋白均无信号都属于非分泌蛋白。
15图 2.3 CsSULTRs 信号肽预测Fig. 2.3 The Signal peptide prediction of CsULTRsTMHMM 跨膜螺旋结构域预测结果显示,CsSULTR1.1、CsSULTR1.2、CsSULTR2.1、CsSULTR3.1、CsSULTR3.2、CsSULTR3.3、CsSULTR3.5、CsSULTR4.1 分别具有 10、10、8、10、12、9、11、12 个跨膜区(TMs)。蛋白质磷酸化是调节和控制蛋白质活力和功能的最基本、最普遍,也是最重要的机制。利用NetPhos 3.1 Server 对 CsSULTRs 的磷酸化位点进行预测发现,第 1 亚家族两个成员 CsSULTR1.1和 CsSULTR1.2 的磷酸化位点较少,分别为 46 个和 44 个;CsSULTR3.5 的磷酸化位点最多,共有 63 个磷酸化位点(表 2.3)。
【参考文献】
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本文编号:2787257
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