鸵鸟源新城疫病毒全基因序列测定及遗传进化分析

发布时间：2020-08-23 09:34

【摘要】：新城疫是一种高发病率和死亡率的高度接触性禽类传染病。新城疫的病原为新城疫病毒,又名禽Ⅰ型副粘病毒,属于副粘病毒科、禽腮腺炎病毒属成员。新城疫病毒基因组为单股负链RNA,其基因结构为3'-NP-P-M-F-HN-L-5',遵循六碱基原则,分别编码6种结构蛋白和2种非结构蛋白。根据对于禽的致病性差异可以将新城疫病毒分为3种类型,强毒力毒株、中等毒力毒株和低等毒力毒株。根据病毒基因组大小和序列分析,可把新城疫分为两大类,Class I和Class II。新城疫病毒的宿主范围较广,可感染约250种的野生鸟类,包括大多数种属的鸟。非洲鸵鸟是目前世界上最大的鸟,也是新城疫病毒的一个重要的自然易感宿主。新城疫病毒是一个重要的病原,能够造成鸵鸟较高的发病率和死亡率。幼年鸵鸟和成年鸵鸟常常呈现不同的临床症状。本研究主要研究结果如下:1.本研究在2006年10月,从陕西省某鸵鸟养殖场送检的组织病料(心、肝、脾、肺和肾)中,通过鸡胚分离法,血凝试验、血凝抑制试验和RT-PCR等方法进行病毒的分离鉴定,结果分离到1株鸵鸟源新城疫病毒(缩写为:NDV/Ostrich/SX-01/06)。2.分离毒株的全基因序列测定及致病性评估。利用RT-PCR方法,扩增相互的重叠10个基因片段,然后用DNA STAR将10个片段拼接,拼接得到分离毒株的全基因序列为15198 nt,其基因结构为3'-NP-P-M-F-HN-L-5'。分离毒株的MDT为86 h,ICPI为0.113。根据OIE规定的新城疫病毒的毒力评估方法,结果表明分离毒株为弱毒力新城疫毒株。然而,分离毒株的F蛋白裂解位点的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,符合有毒力毒株的分子序列特点。本研究第一次分析了鸵鸟源新城疫病毒的全基因序列,并且表明本毒株的毒力可能有多个毒力基因参与调控。3 NDV/Ostrich/SX-01/06分离株的F和HN基因的核苷酸推导的氨基酸序列分析。结果表明:相比于大多数的Class II类中的新城疫病毒分离毒株,NDV/Ostrich/SX-01/06分离株的F蛋白功能域有11个氨基酸残基发生了突变,在HN蛋白功能域有3个氨基酸残基发生了突变替换。在F蛋白的中和位点没有发现氨基酸突变替换。但是,在HN蛋白的中和表位有5个氨基酸发生了氨基酸残基替换。在来自各个方面的免疫选择压力下,新城疫病毒的遗传进化在不断的进行。4.该鸵鸟源新城疫病毒遗传进化分析。利用MEGA软件,根据ML方法,将分离毒株的F全基因进行遗传进化分析,结果表明本分离株属于Class II类中的基因VI型中的VIi亚型。同时,分离毒株NDV/Ostrich/SX-01/06与强毒力Shaanxi/10(登录号:KU853020)朱瀗源分离株的亲缘关系最近,核苷酸同源性为99.9%;与疫苗毒株的核苷酸同源性为31.8%。本研究是第一次报道VIi亚型鸵鸟源新城疫病毒,表明基因VI型新城疫病毒的易感宿主范围较广,野鸟在基因VI型新城疫的传播和流行中扮演者重要的角色。
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：S852.65

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