梨小食心虫中肠氨肽酶N3(GmolAPN3)基因的克
【学位单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:S433
【部分图文】:
2.3 梨小食心虫 GmolAPN3 蛋白的分段原核表达2.3.1 梨小食心虫中肠组织的收集、RNA 的提取以及 cDNA 第一链的合成方法同 2.2.1,2.2.2,2.2.32.3.2 GmolAPN3 基因片段引物的设计根据梨小食心虫 GmolAPN3 氨基酸序列的结构特点,将 GmolAPN3 分成以下 4 个部分,其中需要去掉 N-端的信号肽序列,C-端的 GPI 锚定序列,根据氨基酸片段寻找对应的基因序列并设计分段克隆的引物。
图 3.1 梨小食心虫中肠 RNA 琼脂糖凝胶电泳Fig. 3.1 Agarose gel electrophoresis of RNA from midgut of Grapholith 提取的梨小食心虫中肠 RNA 经过 1%的琼脂糖凝胶电泳检 5S 三条带且 28S 及 18S 条带清晰(图 3.1),表明所提取的 1.9-2.0 之间,所提取 RNA 的完整性及纯度已达到反转录
图 3.4 GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain(A)、ERAP1-like C-terminal domain(B)和 GmolAPN3(C)的三维结构Fig. 3.4 The 3D structure of GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain(A),ERAP1-like C-terminal domain(B)and GmolAPN3(C)红色: GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain; 蓝色: ERAP1-like C-terminal domain; 绿色:锌结合位点; 黑色: 其他部分.Red: GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain; Blue: ERAP1-like C-terminal domain; Green:Zinc binding site; Black: Other parts.结构域分析表明,GmolAPN3 氨肽酶含有 GluZincin superfamily Aminopeptidase Ndomain(66—537 位氨基酸)和 ERAP1-like C-terminal domain(609-912 位氨基酸)2 个保守结构域(图 3.3),并且在 GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain 的第373—396 位氨基酸处有锌指结构373HEXXH(X)18E396,是酶的活性位点。三维结构模型(图3.4)显示,在 GluZincin superfamily Aminopeptidase N domain 富含 α 螺旋和 β 折叠(图3.4: A);如图 3.4: B 所示,ERAP1-like C-terminal domain 主要由 16 个 α 螺旋组成了 8
【参考文献】
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本文编号:2840928
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