基于转录组测序的中国水仙成花基因的研究
【学位单位】:福建农林大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2018
【中图分类】:S682.21
【部分图文】:
图1-1拟南芥中的成花途径示意图[22】??Fig.?1-1?Overview?on?flowering?pathways?in?Arabidopsis??指在外界环境不适宜植物生长时,植物通过自身的营开花。近年来科学家们对自主途径中的晚花突变体进因的突变体无论在什么样的光周期条件下都表现为相关基因一般不受其他几个途径的影响。目前在拟南己发现多个与自主途径相关的基因,如凡〇灰E/e/iVWERING?CONTROL?LOCUS?A?(FCA)?,?FLOWERINE?RING?LOCUS?DiFLD')?,1UMINIDEPENDENC?LD\?)、FLOWERING?LOCUS?KHDOMAIN?<:FLK)、RELTVG?6?(狀项等間。有研究表明虽然这些基因调控花[29]
对两个样本获得的原始数据进行过滤后得到的clean?reads进行组装,共得到??289,544?条?Transcript?和?123,544?条?Unigene,Transcript?与?Unigene?的?N50?分别为??1,476和800。具体组装数据统计如表2-2及图2-3所示。??12??
2500bpB??1000bp^SjB|?18S??图2-2中国水仙主芽总RNA??DL15000;1-2.RNA??Fig.?2-2?The?total?RNA?of?Chinese?narcissus?bud??3.2测序与组装结果分析??2个生物学重复样本测序共获得12.35Gb?Clean?Data,各样品Q30碱基百分??比均不小于89.99%?(表2-1)。??表2-1样品测序数据评估统计表???Table?2-1?Assessment?of?assembly?quality?illumina?sequencing?technique???Samples?Total?reads?Total?nucleotides(bp)?GC?Content?Q30?percentage??T01?27,664,547?6,969,215,666?47.96%?90.63%??T02?21,354,592?5,379,699,215?48.03%?89.99%??对两个样本获得的原始数据进行过滤后得到的clean?reads进行组装,共得到??289,544?条?Transcript?和?123,544?条?Unigene,Transcript?与?Unigene?的?N50?分别为??1,476和800。具体组装数据统计如表2-2及图2-3所示。??12??
【参考文献】
相关期刊论文 前10条
1 冯莹;周翔;潘腾飞;郭志雄;潘东明;;中国水仙ZDS反义基因表达载体的构建与转基因植株的获得[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2015年09期
2 李小方;李瑞;张雪平;杨雪;邱艳;张伟;孙越;王洋;;中国水仙中SVP类似基因NSVP2可促进拟南芥的花序分枝[J];植物生理学报;2014年12期
3 吴素丽;蒋涛;刘立群;郭龙;苏超;张敏娟;钱永华;焦锋;;桑树成花素基因FT表达载体的构建及转化拟南芥植株的早花现象[J];蚕业科学;2014年06期
4 刘传娇;王顺利;薛璟祺;朱富勇;任秀霞;李名扬;张秀新;;牡丹开花调控转录因子基因PrSOC1的克隆与表达分析[J];园艺学报;2014年11期
5 韩悦;任洪杰;翟笑雨;徐启江;;羽衣甘蓝MADS–box基因BoaAGL6的克隆及表达分析[J];湖南农业大学学报(自然科学版);2014年05期
6 张艺能;周玉萍;陈琼华;黄小玲;田长恩;;拟南芥开花时间调控的分子基础[J];植物学报;2014年04期
7 孙颖;谭晓风;罗敏;李建安;;油桐花芽2个不同发育时期转录组分析[J];林业科学;2014年05期
8 石玉波;张荻;申晓辉;王玲;卓丽环;;百子莲开花相关基因ApFT的克隆及表达分析[J];园艺学报;2014年04期
9 董庆龙;冀志蕊;迟福梅;田义;安秀红;徐成楠;周宗山;;苹果MADS-box转录因子的生物信息学及其在不同组织中的表达[J];中国农业科学;2014年06期
10 吴菁华;吴少华;杨超;张志忠;;建兰AP1基因的克隆、表达及其与MADS-box转录因子相互作用的分析[J];园艺学报;2013年10期
相关博士学位论文 前7条
1 刘世男;雷竹SVP-like、SOC1-like基因的克隆及功能分析[D];北京林业大学;2016年
2 逯久幸;梅花休眠相关DELLA基因的克隆与功能分析[D];北京林业大学;2015年
3 王翊;甘菊成花相关基因表达模式和功能的研究[D];北京林业大学;2013年
4 张晓晴;中国水仙遗传转化体系研究及NTLEAFY基因在花芽分化过程中的表达[D];中国林业科学研究院;2012年
5 罗火林;睡莲花器官发育相关基因克隆、表达和功能分析[D];南京农业大学;2011年
6 陈段芬;中国水仙花型、花色发育基因(NTMADS1、NtMADS3、NTPDS1和NTPZDS1)的克隆与转化[D];中国林业科学研究院;2008年
7 段艳欣;根癌农杆菌介导的柑橘转化体系优化与转LFY、AP1基因植株的培育[D];华中农业大学;2006年
相关硕士学位论文 前10条
1 李来运;巴东木莲AGL6同源基因参与调控花发育的分子机制[D];长江大学;2017年
2 刘新庆;拟南芥春化作用相关基因MAF对营养生长时相转变的影响[D];天津农学院;2016年
3 张松文;富士响应外源GA_3和“大小年结果信号”花芽孕育的生理分子机制[D];西北农林科技大学;2016年
4 吴雪琴;漳州水仙开花及花色基因植物表达载体构建与转化研究[D];福建农林大学;2015年
5 罗鹏;漳州水仙鳞茎盘转录组分析及类黄酮合成途径基因的表达[D];福建农林大学;2014年
6 王超;梨成花相关基因LFY、TFL1和FT的克隆表达与成花调控机制研究[D];南京农业大学;2013年
7 贾林燕;中国水仙(Narcissus tazetta var.chinensis)NFT1基因在开花和休眠中的功能分析[D];华东师范大学;2013年
8 林玉华;中国水仙花文化研究[D];福建农林大学;2013年
9 陈静;中国水仙花芽分化及胚胎学研究[D];吉林农业大学;2012年
10 杨超;中国水仙花发育相关基因的克隆与表达分析[D];福建农林大学;2012年
本文编号:2843607
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/2843607.html