BAP1基因启动子区G-四链体的结构鉴定及其对基因表达调控的研究

发布时间：2020-10-17 06:41

　　 越来越多的证据表明,在癌症的发展和进展中,BAP1起到了关键作用,但是目前对BAP1基因表达的调控机制尚不清楚。G-四链体是富含串联重复鸟嘌呤的DNA或RNA组成的二级结构。由氢键连接的四个鸟嘌呤形成环状平面G-四分体,三个或更多G-四分体堆叠形成了 G-四链体。大量的研究表明,G-四链体结构在肿瘤发生过程中起着重要的调节作用,因此,G-四链体结构和相关的解旋酶在癌症治疗中是一个新的探索领域。在本论文中,我们发现BAP1启动子区域反义链上包含多个串联的鸟嘌呤以及重复序列,这些序列具有很高的形成G-四链体结构的可能性。我们根据BAP1启动子反义链的鸟嘌呤富集区域序列合成了寡核苷酸链,在圆二色性光谱分析研究中,这些序列显示了 G-四链体结构特征吸收峰,进一步的分析也揭示了它们可以形成多种G-四链体结构。在报告载体研究中,BAP1启动子中预测G-四链体结构形成序列的突变或删除会降低报告载体的表达,显示G-四链体的存在促进了 BAP1基因表达。与此相符,具有DNA解旋酶活性的染色质重塑蛋白CHD2和CHD7与BAP1启动子结合并可能消除G4-四链体结构以抑制BAP1基因表达。总之,BAP1启动子反义链上包含了可以形成G-四链体结构的序列,这些G-四链体结构促进BAP1基因的表达,而DNA解旋酶CHD2和CHD7可能通过解开这些G-四链体来抑制BAP1基因表达。
【学位单位】：东北林业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：Q78
【部分图文】：

Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ?Ｓｔａｒｔ?Ｓｉｔｅ，在图?３－１?中标注为＋１）上游?１０００?ｂｐ?减基序列中?Ｇ／Ｃ??百分含量达到６９．７％，而在转录起始位点上游的２００?ｂｐ碱基序列胞嘧啶与鸟嘌呤的含量??中更是高达７９．０％?（见图３－１）。??屬一－?———￣■—?Ｐｒｏｍｏｔｅｒ?———?．＿．－５’－ＵＴＲ?爹??ＴＳＳ??－１０００?－８００?－６００?－４００?－２００?－１，＋１?＋２２７??．；??６９．７％?７９．０％，??（Ｇ／Ｃ?ｃｏｎｔｅｎｔ）??图３－１?ＢＡＰ１基因ＴＳＳ上游启动子区Ｇ／Ｃ含量分析，ＴＳＳ表示转录起始位点??Ｇ－四链体结构在基因启动子区域的正义链或反义链中均能够形成。当我们观察??ＢＡＰ１启动子区时，显然可以发现序列中含有很多连续的胞嘧啶分布在其中，从而其反??义链相应区域形成了保守的核苷酸序列模块（Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３?），该??序列模型即为形成Ｇ－四链体的保守序列。尤其是在该区域内，在ＴＳＳ上游２００?ｂｐ序列??内，仅仅胞嘧啶含量就占有６２．５％?（见图３－２）。因此，仅仅通过ＤＮＡ序列的特征来??看

在预测Ｇ－四链体结构中有很多种算法，在这里，我们利用了一种称为ＱＧＲＳ??Ｍａｐｐｅｒ的在线预测算法来分析ＢＡＰ１基因的启动子序列［８６］。从分析结果中我们发现，??在其反义链上有数个连续的鸟嘌呤簇的得分超过４０?（见图３－３），而己知能够形成稳定??Ｇ－四链体结构的ＭＹＣ启动子内鸟嘌呤富集序列得分为４２分。而有趣的一点是，在??ＢＡＰ１启动子中，一些具有高分，即具有比较高潜能形成Ｇ－四链体的序列是重复出现??的

?？Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ??ＴＳＳ??图３－２?ＢＡＰ１基因ＴＳＳ上游启动子区序列??３．１．２利用ＱＧＲＳ?Ｍａｐｐｅｒ预测Ｇ－四链体??在预测Ｇ－四链体结构中有很多种算法，在这里，我们利用了一种称为ＱＧＲＳ??Ｍａｐｐｅｒ的在线预测算法来分析ＢＡＰ１基因的启动子序列［８６］。从分析结果中我们发现，??在其反义链上有数个连续的鸟嘌呤簇的得分超过４０?（见图３－３），而己知能够形成稳定??Ｇ－四链体结构的ＭＹＣ启动子内鸟嘌呤富集序列得分为４２分。而有趣的一点是，在??ＢＡＰ１启动子中，一些具有高分，即具有比较高潜能形成Ｇ－四链体的序列是重复出现??的
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本文编号：2844434