TET1-DNMT网络调控基因表达的表观遗传机制

发布时间：2020-11-10 07:37

　　 表观遗传是指在基因组序列保持不变的情况下,因为修饰变化而导致的可遗传性状变化的过程。它包括组蛋白修饰、DNA修饰、RNA修饰等。DNA的甲基化与肿瘤的发生发展密切相关。DNMT是一种DNA甲基转移酶,可以将把C原子加到CpG位点的C原子上形成5甲基胞嘧啶,它通过招募抑制因子或阻断与转录因子的结合来抑制肿瘤抑制基因的表达。TET蛋白是一种羟甲基化蛋白,可以将5-甲基胞嘧啶(5mc)转化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmc),然后还原成胞嘧啶,以达成DNA去甲基化的效果。肺癌是恶性程度最高的癌症之一。死亡率排在恶性肿瘤的前三位。研究课题在非小细胞肺癌A549的基础上,敲低DNMT1与TET1,通过生长曲线、侵袭实验、划痕实验等功能性实验观察其对细胞的影响,通过PCR、Western等试验观察其相互作用。初步结果为DNMT1促进肺癌细胞的生长,敲低DNMT1以后细胞的侵袭效率降低明显,TET1抑制肺癌细胞的生长,DNMT1促进TET1的表达,而TET1抑制DNMT1的表达。敲低DNMT1以后,DOTBLOT实验验证了全基因组的甲基化程度降低,而敲低TET1以后全基因组甲基化的程度增加,双敲低DNMT1和TET1后,结果在两个单敲低之间。敲低DNMT1以后,一些高甲基化的基因并没有发生甲基化的缺失。实验研究证明,DNMT1/3A/3B与TET1之间存在相互调控关系,而甲基化是肺癌的致病因素之一,研究甲基化及其敲低对细胞的影响,可以为肺癌的治疗提供新的思路。但具体由什么基因的甲基化异常导致肺癌的发生,还需要进一步的实验验证。
【学位单位】：北京工业大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2018
【中图分类】：Q34
【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩写词
第1章 绪论
    1.1 表观遗传
    1.2 TET蛋白
    1.3 DNA甲基化转移酶
        1.3.1 甲基化转移酶的去甲基化及去羟甲基化作用
    1.4 DNA甲基化与肺癌
    1.5 组蛋白修饰与肺癌
    1.6 非编码RNA与肺癌
        1.6.1 miRNA与肺癌的诊断
        1.6.2 lncRNA与肺癌
    1.7 SOCS甲基化与肺癌
    1.8 研究内容与意义
第2章 DNMT1对肺癌细胞的影响
    2.1 引言
    2.2 实验材料
        2.2.1 仪器设备
        2.2.2 试剂
        2.2.3 引物的设计合成
    2.3 实验方法
        2.3.1 质粒的构建
        2.3.2 质粒的热激转化
        2.3.3 质粒的提取
        2.3.4 DNA回收
        2.3.5 细胞培养
        2.3.6 MTT法细胞毒检测
        2.3.7 RNA提取及RTPCR实验
        2.3.8 蛋白质提取及Western检测
        2.3.9 转染
        2.3.10 统计学处理
    2.4 实验结果
        2.4.1 DNMT在肺癌中有较高的临床表达
        2.4.2 DNMT蛋白之间存在互作
        2.4.3 DNMT1促进肺癌细胞中TET1的表达
        2.4.4 DNMT1与肺癌的不良预后有关
        2.4.5 敲低DNMT1基因抑制肺癌细胞的增殖与迁移
        2.4.6 敲低DNMT1对一些高甲基化基因的甲基化没有影响
    2.5 讨论
    2.6 本章小结
第3章 TET1对肺癌细胞的影响
    3.1 引言
    3.2 实验方法
        3.2.1 细胞培养
        3.2.2 RNA提取及RTPCR实验
        3.2.3 统计学处理
    3.3 实验结果
        3.3.1 TET1在肺癌中的临床表达
        3.3.2 TET与DNMT之间存在相互作用
        3.3.3 TET1抑制肺癌细胞DNMT1的表达
        3.3.4 TET1与肺癌的不良预后有关
        3.3.5 TET1抑制肺癌细胞的增殖
    3.4 讨论
    3.5 本章小结
结论
参考文献
攻读硕士学位期间所发表的学术论文
致谢

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 申燕红;;表观遗传改良棉——纤维培育新突破[J];中国纤检;2017年07期

2 李潇卓;;食品和营养的表观遗传观点和展望[J];食品安全导刊;2016年21期

3 刘晓敏;董哲毅;陈香美;;表观遗传修饰在糖尿病肾病发病机制中的作用研究进展[J];中华肾病研究电子杂志;2016年04期

4 彭文培;曾长军;;精子发生及冷冻过程中表观遗传调控的研究进展[J];中国畜牧兽医;2014年09期

5 毛媛;杜芳腾;杜瑶;张吉翔;;表观遗传修饰在调控寿命中的作用[J];生命的化学;2013年06期

6 ;发现新的改善癌症治疗的表观遗传机制[J];基层医学论坛;2013年09期

7 ;研究发现植物比动物具有广泛的表观遗传性[J];福建农业科技;2012年11期

8 黄世杰;;癌的表观遗传性治疗:过去,现在和将来[J];国外医学.药学分册;2006年05期

9 ;发现新的改善癌症治疗的表观遗传机制[J];基层医学论坛;2013年08期

10 许峰;李晓;;骨髓增生异常综合征的表观遗传改变[J];中国实验血液学杂志;2010年02期

相关博士学位论文 前10条

1 田文芳;肝脏损伤中的表观遗传机制初探[D];南京医科大学;2015年

2 刘森;三种蝙蝠表观遗传多样性及其影响因素研究[D];东北师范大学;2012年

3 张迁;树突状细胞分化成熟的表观遗传组学研究[D];第二军医大学;2011年

4 郭艺迪;LSD1介导的表观遗传修饰调控GATA Switch的机制研究[D];吉林大学;2016年

5 潘冬;表观遗传调控参与肿瘤细胞辐射应答的机制研究[D];中国科学院大学(中国科学院近代物理研究所);2017年

6 解少俊;玉米表观遗传组的研究[D];中国农业大学;2014年

7 聂亚莉;人肝脏UGT1A1基因的发育表达及表观遗传调控机制[D];郑州大学;2016年

8 李少英;乳腺癌全基因组甲基化差异分析与重要功能基因的临床验证[D];南方医科大学;2014年

9 张剑锋;松嫩平原天然羊草（Leymus chinensis（Trin.）Tzvel.）种群的分子遗传与表观遗传多态性及其种群遗传结构研究[D];东北师范大学;2009年

10 杨飞;玉米有丝分裂过程中表观遗传修饰间的相互作用[D];武汉大学;2010年

相关硕士学位论文 前10条

1 王珂;氟化物对小鼠骨损伤的表观遗传机理研究[D];湖北大学;2015年

2 刘亚茹;TET1-DNMT网络调控基因表达的表观遗传机制[D];北京工业大学;2018年

3 王圣洁;γ-氨基丁酸对开花关键基因FT和FLC组蛋白甲基化的表观遗传调控[D];中南民族大学;2016年

4 马丽丽;高山龙胆群体遗传与表观遗传结构研究[D];东北师范大学;2011年

5 谭洁琼;果蝇原始生殖细胞增殖与分化的表观遗传调控初步研究[D];上海交通大学;2015年

6 吴伟琴;长白山不同海拔高度岳桦天然群体的遗传及表观遗传结构研究[D];东北师范大学;2011年

7 周玉新;人参的表观遗传结构研究[D];东北师范大学;2015年

8 邓莹;不同水陆生境中喜旱莲子草表观遗传调控因子动态表达式样分析[D];复旦大学;2014年

9 张伟;化学表观遗传修饰法研究海葵来源月状旋孢腔菌代谢产物多样性初探[D];中国海洋大学;2014年

10 戴胜冬;表观遗传修饰间相互作用关系的研究[D];杭州电子科技大学;2015年

本文编号：2877669