芸薹生链格孢转录因子基因Ab06986的克隆与功能研究
发布时间：2020-12-08 05:56
十字花科蔬菜黑斑病是由链格孢引起的世界性真菌病害,从20世纪90年代开始,该种病害在我国北方发生严重,至今仍对十字花科蔬菜的生产存在较大威胁。芸薹生链格孢（Alternaria brassicicola）为该病害主要病原之一。转录因子是参与病原菌生长发育及致病性的重要调控因子,因此研究芸薹生链格孢的致病相关转录因子,有助于认识其致病分子作用机制,对于防治芸薹生链格孢引起的黑斑病至关重要。锌指蛋白中的Zn2Cys6是真菌中特有的一类转录因子,调控真菌的多种生理过程,包括真菌的生长、产孢和侵染寄主的过程。该类转录因子在芸薹生链格孢菌种中尚未被系统的研究。本研究主要以芸薹生链格孢（A.brassicicola）的一个Zn2Cys6转录因子基因Ab06986为研究对象,克隆了Ab06986基因,对Ab06986基因缺失突变体的生物学性状进行了研究,系统探索了Ab06986基因的生物功能。本研究共获得了三株Ab06986基因缺失突变体,与野生菌、互补体的性状功能对比结果如下:（1）Ab06986基因参与调控芸...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Ab06986DNA与cDNA扩增PCR产物琼脂糖凝胶电泳
图 1 Ab06986 DNA 与 cDNA 扩增 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳1.DNAPCR 产物；2.cDNAPCR 产物；M.DNAMarker D2000Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the PCR product from theAb06986 DNA and cDNA1.PCR product of DNA;2.PCR product of cDNA;M.DNAMarker D2000以芸薹生链格孢基因组 DNA 及 cDNA 为模板，Ab06986-F 和 Ab06986-R 为引物扩增并进行电泳检测，结果如图 1 所示。将目的条带进行 PCR 产物回收，并交由生工生物工程(上海)股份有限公司进行测序。经过分析发现芸薹生链格孢中 Ab06986 基因大小为 1240 bp，RNA 为 1140 bp，其中内含子 2 个，分别位于基因的 58-108 处和 346-397处，编码 379 个氨基酸。3.1.3Ab06986 基因的保守区分析将 Ab06986 基因预测蛋白进行保守区序列分析，在 NCBI 上将基因 Ab06986 blast，显示在 50bp-150 bp 之间存在 Zn2+结合域，如图 2 所示：
图 3 芸薹生链格孢 Ab06986 基因与其他真菌同源基因相似性比对结果Fig.3 Comparison of genetic similarity between Alternaria alternataAb06986 gene and other fungi3.1.4Ab06986 基因的相似性比对利用 NCBI BLAST-protein 程序将测序得到的 Ab06986 氨基酸序列与数据库中其它真菌同源基因氨基酸序列进行同源分析，并建立真菌系统进化树如图 4 所示。
【参考文献】：
期刊论文
[1]NAC转录因子在水稻抗逆基因工程中的应用进展[J]. 段俊枝,李莹,赵明忠,魏小春,任银铃. 中国稻米. 2017(06)
[2]转录因子研究方法进展[J]. 刘相莲,乔芳,黄德玉,袁宗辉,王旭. 生理科学进展. 2017(01)
[3]植物逆境相关C2H2型锌指蛋白的研究进展[J]. 赵丽娟,易小娅,曾幼玲. 分子植物育种. 2016(03)
[4]Ste12基因对玉米大斑病菌渗透胁迫的调控作用[J]. 张运峰,张淑红,范永山,董金皋. 河北农业大学学报. 2016(02)
[5]烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析[J]. 杨明磊,晁江涛,王大伟,胡军华,吴华,龚达平,刘贯山. 遗传. 2016(04)
[6]Involvement of C2H2 zinc finger proteins in the regulation of epidermal cell fate determination in Arabidopsis[J]. An Yan,Minjie Wu,Yongqin Zhao,Aidong Zhang,Bohan Liu,John Schiefelbein,Yinbo Gan. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(12)
[7]白菜黑斑病抗性鉴定及QTL定位[J]. 陈莹,柳李旺,谢学文,孟霖,刘博,王晓武,李宝聚,武剑. 中国农业科学. 2013(24)
[8]植物病原链格孢属真菌的致病机制研究进展[J]. 康子腾,姜黎明,罗义勇,柳陈坚,李晓然. 生命科学. 2013(09)
[9]茉莉酸和真菌病原诱导的水稻WRKY30转录因子基因的分离及表达特征[J]. 彭喜旭,胡耀军,唐新科,周平兰,邓小波,王海华. 中国农业科学. 2011(12)
[10]植物C2H2型锌指蛋白的研究进展[J]. 宋冰,洪洋,王武,王贺,付永平,丁孝营. 基因组学与应用生物学. 2010(06)
博士论文
[1]拟南芥锌指蛋白ZAT18参与响应干旱胁迫机制的研究[D]. 殷明珠.中国科学院武汉植物园 2017
[2]梨树腐烂病菌的转录组分析及两个转录因子的功能研究[D]. 何锋.南京农业大学 2015
[3]稻瘟病菌Zn2Cys6和bHLH家族转录因子功能分析[D]. 曹慧娟.浙江大学 2015
[4]大豆C2H2型锌指蛋白基因SCTF-1、STF-2、STF-3的克隆及功能分析[D]. 宋冰.吉林农业大学 2012
[5]大豆疫霉MAP kinase PsSAK1信号途径及MYB转录因子基因家族的功能分析[D]. 张萌.南京农业大学 2012
[6]锌指转录因子ZNF580相互作用蛋白的筛选与鉴定[D]. 罗玉玉.天津医科大学 2011
[7]大豆疫霉转录因子PsCZF1、PsHSF1和PsMAD1的功能研究[D]. 王永林.南京农业大学 2009
[8]水稻锌指蛋白基因RZF5和RZF71的克隆与功能分析[D]. 郭书巧.南京农业大学 2006
硕士论文
[1]转录因子和染色质特征的分布特点及其关联[D]. 刘艳玲.内蒙古大学 2017
[2]芸薹生链格孢转录因子ZnCys_Ab0012基因功能研究[D]. 刘伟阳.山东农业大学 2017
[3]转录因子和组蛋白修饰的分布特征以及高低表达基因的识别[D]. 薛高高.内蒙古大学 2016
[4]芸薹生链格孢AbPbs2基因功能及下游MAPK锚定作用位点的研究[D]. 祝春晓.山东农业大学 2015
[5]BjC-P启动子真菌诱导核心元件的互作转录因子筛选及鉴定[D]. 贾双伟.中国农业科学院 2014
[6]294个稻瘟病菌转录因子基因的敲除和功能分析[D]. 张莉林.浙江大学 2013
[7]稻瘟病菌转录因子Moswi6的功能研究[D]. 王琦.南京农业大学 2010
[8]大豆C2H2型锌指蛋白转录因子基因的克隆与鉴定[D]. 刘萌萌.中国农业科学院 2007
本文编号：2904580
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Ab06986DNA与cDNA扩增PCR产物琼脂糖凝胶电泳
图 1 Ab06986 DNA 与 cDNA 扩增 PCR 产物琼脂糖凝胶电泳1.DNAPCR 产物；2.cDNAPCR 产物；M.DNAMarker D2000Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the PCR product from theAb06986 DNA and cDNA1.PCR product of DNA;2.PCR product of cDNA;M.DNAMarker D2000以芸薹生链格孢基因组 DNA 及 cDNA 为模板，Ab06986-F 和 Ab06986-R 为引物扩增并进行电泳检测，结果如图 1 所示。将目的条带进行 PCR 产物回收，并交由生工生物工程(上海)股份有限公司进行测序。经过分析发现芸薹生链格孢中 Ab06986 基因大小为 1240 bp，RNA 为 1140 bp，其中内含子 2 个，分别位于基因的 58-108 处和 346-397处，编码 379 个氨基酸。3.1.3Ab06986 基因的保守区分析将 Ab06986 基因预测蛋白进行保守区序列分析，在 NCBI 上将基因 Ab06986 blast，显示在 50bp-150 bp 之间存在 Zn2+结合域，如图 2 所示：
图 3 芸薹生链格孢 Ab06986 基因与其他真菌同源基因相似性比对结果Fig.3 Comparison of genetic similarity between Alternaria alternataAb06986 gene and other fungi3.1.4Ab06986 基因的相似性比对利用 NCBI BLAST-protein 程序将测序得到的 Ab06986 氨基酸序列与数据库中其它真菌同源基因氨基酸序列进行同源分析，并建立真菌系统进化树如图 4 所示。
【参考文献】：
期刊论文
[1]NAC转录因子在水稻抗逆基因工程中的应用进展[J]. 段俊枝,李莹,赵明忠,魏小春,任银铃. 中国稻米. 2017(06)
[2]转录因子研究方法进展[J]. 刘相莲,乔芳,黄德玉,袁宗辉,王旭. 生理科学进展. 2017(01)
[3]植物逆境相关C2H2型锌指蛋白的研究进展[J]. 赵丽娟,易小娅,曾幼玲. 分子植物育种. 2016(03)
[4]Ste12基因对玉米大斑病菌渗透胁迫的调控作用[J]. 张运峰,张淑红,范永山,董金皋. 河北农业大学学报. 2016(02)
[5]烟草C2H2锌指蛋白转录因子家族成员的鉴定与表达分析[J]. 杨明磊,晁江涛,王大伟,胡军华,吴华,龚达平,刘贯山. 遗传. 2016(04)
[6]Involvement of C2H2 zinc finger proteins in the regulation of epidermal cell fate determination in Arabidopsis[J]. An Yan,Minjie Wu,Yongqin Zhao,Aidong Zhang,Bohan Liu,John Schiefelbein,Yinbo Gan. Journal of Integrative Plant Biology. 2014(12)
[7]白菜黑斑病抗性鉴定及QTL定位[J]. 陈莹,柳李旺,谢学文,孟霖,刘博,王晓武,李宝聚,武剑. 中国农业科学. 2013(24)
[8]植物病原链格孢属真菌的致病机制研究进展[J]. 康子腾,姜黎明,罗义勇,柳陈坚,李晓然. 生命科学. 2013(09)
[9]茉莉酸和真菌病原诱导的水稻WRKY30转录因子基因的分离及表达特征[J]. 彭喜旭,胡耀军,唐新科,周平兰,邓小波,王海华. 中国农业科学. 2011(12)
[10]植物C2H2型锌指蛋白的研究进展[J]. 宋冰,洪洋,王武,王贺,付永平,丁孝营. 基因组学与应用生物学. 2010(06)
博士论文
[1]拟南芥锌指蛋白ZAT18参与响应干旱胁迫机制的研究[D]. 殷明珠.中国科学院武汉植物园 2017
[2]梨树腐烂病菌的转录组分析及两个转录因子的功能研究[D]. 何锋.南京农业大学 2015
[3]稻瘟病菌Zn2Cys6和bHLH家族转录因子功能分析[D]. 曹慧娟.浙江大学 2015
[4]大豆C2H2型锌指蛋白基因SCTF-1、STF-2、STF-3的克隆及功能分析[D]. 宋冰.吉林农业大学 2012
[5]大豆疫霉MAP kinase PsSAK1信号途径及MYB转录因子基因家族的功能分析[D]. 张萌.南京农业大学 2012
[6]锌指转录因子ZNF580相互作用蛋白的筛选与鉴定[D]. 罗玉玉.天津医科大学 2011
[7]大豆疫霉转录因子PsCZF1、PsHSF1和PsMAD1的功能研究[D]. 王永林.南京农业大学 2009
[8]水稻锌指蛋白基因RZF5和RZF71的克隆与功能分析[D]. 郭书巧.南京农业大学 2006
硕士论文
[1]转录因子和染色质特征的分布特点及其关联[D]. 刘艳玲.内蒙古大学 2017
[2]芸薹生链格孢转录因子ZnCys_Ab0012基因功能研究[D]. 刘伟阳.山东农业大学 2017
[3]转录因子和组蛋白修饰的分布特征以及高低表达基因的识别[D]. 薛高高.内蒙古大学 2016
[4]芸薹生链格孢AbPbs2基因功能及下游MAPK锚定作用位点的研究[D]. 祝春晓.山东农业大学 2015
[5]BjC-P启动子真菌诱导核心元件的互作转录因子筛选及鉴定[D]. 贾双伟.中国农业科学院 2014
[6]294个稻瘟病菌转录因子基因的敲除和功能分析[D]. 张莉林.浙江大学 2013
[7]稻瘟病菌转录因子Moswi6的功能研究[D]. 王琦.南京农业大学 2010
[8]大豆C2H2型锌指蛋白转录因子基因的克隆与鉴定[D]. 刘萌萌.中国农业科学院 2007
本文编号：2904580
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/2904580.html
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