药西瓜UDP-糖基转移酶基因克隆与原核表达分析
发布时间:2020-12-10 03:52
葫芦素是药西瓜中重要的药用活性成分,具有抗炎、保肝、抗癌、提高机体免疫力等多种生物活性功能。植物体内葫芦素配糖体与葫芦素的含量相当,已有研究表明葫芦素E配糖体(CuE-Glu)是决定药西瓜苦味的主要因素。UDP-糖基转移酶是催化葫芦素形成葫芦素配糖体的关键酶。本研究以药西瓜“WM9”品种叶片为材料,成功克隆了两个UDP-糖基转移酶基因的cDNA序列,并对其进行了原核表达分析。本实验采用RT-PCR法,成功获得1,546 bp和1,559 bp的基因全长序列,分别命名为UDP-E1和UDP-E2。对扩增获得的编码序列进行生物学信息分析,确定UDP-E1基因的完整开放阅读框(ORF)为1314bp,可编码氨基酸437个,蛋白质命名为:UDP-E1,理论分子量为49.02kDa,等电点为5.99,属于稳定蛋白质。UDP-E2基因的ORF为846bp,可编码氨基酸281个,蛋白质命名为:UDP-E2,理论分子量为32.78 kDa,等电点为5.23,属不稳定蛋白质,这两个基因属于糖基转移酶超家族。通过分析发现这两个基因的氨基酸序列均不具有跨膜结构,不具有信号肽结构。蛋白质二级结构表明,蛋白UD...
【文章来源】:延边大学吉林省 211工程院校
【文章页数】:63 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
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延边大学硕士毕业论文??.?2.?4.?3蛋白的亲水性预测结果??使用ProtScale软件对蛋白质亲水性进行分析,结果显示蛋白UDP-E1的疏水性为2.067,位于第238位点;最小值是-2.344,位于第74位点,总平水性指数为-0.009,依据氨基酸分值越低亲水性越强反之亦然的规律可预测UDP-E1整体表现为亲水性(见图2.6)?〇??蛋白UDP-E2的最大疏水性为2.156,位于第16位点;最小值是-2.867,第180位点,总平均亲水性指数为-0.280,依据氨基酸分值越低亲水性越强亦然的规律可预测蛋白UDP-E2整体表现为亲水性(见图2.7)。??ProtScale?output?for?user_sequence??
【参考文献】:
期刊论文
[1]发菜中糖基转移酶基因的克隆及原核表达[J]. 陈雪峰,蔡国强,范华,刘欢. 陕西科技大学学报. 2018(01)
[2]葫芦素B对脂多糖诱导小鼠肺泡巨噬细胞炎症反应的影响[J]. 周康,张永为,陆新建,马春芳. 预防医学. 2017(07)
[3]烟草糖基转移酶基因NtGT3的克隆与生物信息学分析[J]. 任学良,李立芹,许力,郭玉双,鲁黎明. 浙江农业学报. 2017(01)
[4]发现蔬果的“苦味”秘密[J]. 吴佩. 农药市场信息. 2017(02)
[5]苦荞糖基转移酶基因的克隆及活性鉴定[J]. 李茂菲,周婧,姚攀锋,赵学荣,李成磊,吴琦. 西北植物学报. 2016(12)
[6]基于ITS2条形码鉴定维药药西瓜及其误用品[J]. 何江,程波,徐元,姚松伯,杨伟俊. 中国现代中药. 2016(10)
[7]葫芦素E抑制多发性骨髓瘤细胞增殖及与阿霉素的协同效应[J]. 杨玛丽,肖翠,魏榕,伍忠军,曹小华,王莎莎,阳泰,李敏惠,刘进. 成都医学院学报. 2016(02)
[8]葫芦素E诱导肝癌细胞凋亡及其机制[J]. 沈杭,陈宗科,钱叶本. 临床与实验病理学杂志. 2015(12)
[9]葫芦素E诱导结肠癌细胞凋亡[J]. 随何欢,李丽,王虎,周运江,黄家君. 第三军医大学学报. 2016(05)
[10]葫芦素B抑制神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞增殖机制的初步研究[J]. 郑倩,宋冠华,张斌. 实用药物与临床. 2015(07)
博士论文
[1]葫芦科蔬菜苦味物质的代谢研究[D]. 周渊.中国农业科学院 2016
[2]葫芦素E抑制人白血病和肝癌细胞增殖作用及机制研究[D]. 李艳春.沈阳药科大学 2010
[3]葫芦素B治疗喉鳞状细胞癌的实验研究[D]. 刘亭彦.中国医科大学 2008
[4]葫芦素B的保肝作用及其机制的研究[D]. 昌友权.吉林大学 2006
硕士论文
[1]药西瓜蔓中葫芦素B提取及其固体脂质纳米粒制备与功能特性研究[D]. 刘钰莹.沈阳农业大学 2017
[2]葫芦素E通过PI3K/Akt/NF-κB信号通路抑制TNF-α诱导的MH7A细胞炎症因子的分泌[D]. 贾庆运.山东中医药大学 2015
[3]葫芦素E诱导HeLa细胞发生自噬的分子机制研究[D]. 张晓钰.暨南大学 2015
[4]葫芦素B对食管鳞癌细胞放射敏感性影响的相关研究[D]. 潘丁龙.福建医科大学 2015
[5]葫芦素B对于结肠癌细胞生长与增殖抑制作用的研究[D]. 黄琛.河北医科大学 2015
[6]葫芦素E对脂多糖诱导的小鼠巨噬细胞RAW264.7炎症反应的抑制作用及其机制研究[D]. 乔静.暨南大学 2013
[7]苦瓜提取物及其抗虫抑菌效果[D]. 罗宏.华中农业大学 2005
本文编号:2908036
【文章来源】:延边大学吉林省 211工程院校
【文章页数】:63 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.1?pcr扩增udp-糖基转移酶基因??
?SKXXrCTG-CXXCAJ*ak_KKTOCTCGT?TXTTXXTOCXTXC.aCJWXTTtiCTX.CCJCrraJvXTOGiXOGrraCi^T?XAJCTTJ^TGC?X:TXCrr*J4jkC??G?TT?AjOT?JtUTCCC?JkTCCC?AC?CTX?TT?CTTACTii?TC??图2.3:药西瓜基因的编码区核酸序列及推导氨基酸序列??Fig?2.3?Encoding?nucleic?acid?sequence?and?deduced?amino?acid?sequence?of?Medicine??watermelon?UDP?-?E2?gene??2.?2.4.?2蛋白保守区预测结果??在NCBI网站上利用Conserved?Domain工具中的CD-search进行功能域分??析
延边大学硕士毕业论文??.?2.?4.?3蛋白的亲水性预测结果??使用ProtScale软件对蛋白质亲水性进行分析,结果显示蛋白UDP-E1的疏水性为2.067,位于第238位点;最小值是-2.344,位于第74位点,总平水性指数为-0.009,依据氨基酸分值越低亲水性越强反之亦然的规律可预测UDP-E1整体表现为亲水性(见图2.6)?〇??蛋白UDP-E2的最大疏水性为2.156,位于第16位点;最小值是-2.867,第180位点,总平均亲水性指数为-0.280,依据氨基酸分值越低亲水性越强亦然的规律可预测蛋白UDP-E2整体表现为亲水性(见图2.7)。??ProtScale?output?for?user_sequence??
【参考文献】:
期刊论文
[1]发菜中糖基转移酶基因的克隆及原核表达[J]. 陈雪峰,蔡国强,范华,刘欢. 陕西科技大学学报. 2018(01)
[2]葫芦素B对脂多糖诱导小鼠肺泡巨噬细胞炎症反应的影响[J]. 周康,张永为,陆新建,马春芳. 预防医学. 2017(07)
[3]烟草糖基转移酶基因NtGT3的克隆与生物信息学分析[J]. 任学良,李立芹,许力,郭玉双,鲁黎明. 浙江农业学报. 2017(01)
[4]发现蔬果的“苦味”秘密[J]. 吴佩. 农药市场信息. 2017(02)
[5]苦荞糖基转移酶基因的克隆及活性鉴定[J]. 李茂菲,周婧,姚攀锋,赵学荣,李成磊,吴琦. 西北植物学报. 2016(12)
[6]基于ITS2条形码鉴定维药药西瓜及其误用品[J]. 何江,程波,徐元,姚松伯,杨伟俊. 中国现代中药. 2016(10)
[7]葫芦素E抑制多发性骨髓瘤细胞增殖及与阿霉素的协同效应[J]. 杨玛丽,肖翠,魏榕,伍忠军,曹小华,王莎莎,阳泰,李敏惠,刘进. 成都医学院学报. 2016(02)
[8]葫芦素E诱导肝癌细胞凋亡及其机制[J]. 沈杭,陈宗科,钱叶本. 临床与实验病理学杂志. 2015(12)
[9]葫芦素E诱导结肠癌细胞凋亡[J]. 随何欢,李丽,王虎,周运江,黄家君. 第三军医大学学报. 2016(05)
[10]葫芦素B抑制神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞增殖机制的初步研究[J]. 郑倩,宋冠华,张斌. 实用药物与临床. 2015(07)
博士论文
[1]葫芦科蔬菜苦味物质的代谢研究[D]. 周渊.中国农业科学院 2016
[2]葫芦素E抑制人白血病和肝癌细胞增殖作用及机制研究[D]. 李艳春.沈阳药科大学 2010
[3]葫芦素B治疗喉鳞状细胞癌的实验研究[D]. 刘亭彦.中国医科大学 2008
[4]葫芦素B的保肝作用及其机制的研究[D]. 昌友权.吉林大学 2006
硕士论文
[1]药西瓜蔓中葫芦素B提取及其固体脂质纳米粒制备与功能特性研究[D]. 刘钰莹.沈阳农业大学 2017
[2]葫芦素E通过PI3K/Akt/NF-κB信号通路抑制TNF-α诱导的MH7A细胞炎症因子的分泌[D]. 贾庆运.山东中医药大学 2015
[3]葫芦素E诱导HeLa细胞发生自噬的分子机制研究[D]. 张晓钰.暨南大学 2015
[4]葫芦素B对食管鳞癌细胞放射敏感性影响的相关研究[D]. 潘丁龙.福建医科大学 2015
[5]葫芦素B对于结肠癌细胞生长与增殖抑制作用的研究[D]. 黄琛.河北医科大学 2015
[6]葫芦素E对脂多糖诱导的小鼠巨噬细胞RAW264.7炎症反应的抑制作用及其机制研究[D]. 乔静.暨南大学 2013
[7]苦瓜提取物及其抗虫抑菌效果[D]. 罗宏.华中农业大学 2005
本文编号:2908036
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