6个中国小型猪种SLA-DQB基因外显子2多态性分析

发布时间：2020-12-13 03:00

　　采用PCR-RFLP法对甘孜藏猪、合作猪、滇南小耳猪、荷包猪、五指山猪和巴马小型猪SLA-DQB基因外显子2多态性进行分析。结果表明:经RsaⅠ酶切检测到5种等位基因,14种RFLP带型,遗传杂合度（He）在0.538⁰.729,多态信息含量（PIC）在0.488⁰.728,该位点表现为高度多态;χ²适合性检验显示,甘孜藏猪、巴马小型猪和五指山猪3个群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。经HinfⅠ酶切检测到3种等位基因,6种RFLP带型,He在0.315⁰.524,PIC在0.291⁰.461,在该位点表现为中度多态。χ²适合性检验显示,甘孜藏猪、滇南小耳猪、巴马小型猪、荷包猪4个群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。因此,6个小型猪种的SLA-DQB基因外显子2多态性丰富且存在明显差异。 

【文章来源】：中国畜牧杂志. 2017年08期 北大核心

【文章页数】：4 页

【部分图文】：

SLA-DQB基因HinfI-RFLP酶切图谱

平衡（P＜0.05）。而SLA-DQB经HinfⅠ酶切后有3个等位基因和6种RFLP带型，HH带型出现的频率最高。χ2适合性检验表明，甘孜藏猪、滇南小耳猪、巴马小型猪、荷包猪4个群体在该酶切位点处于Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05）；而合作猪、五指山猪2个群体在该位点偏离基因平衡（P＜0.05）。甘孜藏猪和巴马小型猪在RsaI和HinfI2个酶切位点上均处于Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05）。123456789101112131415750bp500bp250bp100bp123456789101112131415750bp500bp250bp100bp图1SLA-DQB基因HinfI-RFLP酶切图谱图2SLA-DQB基因RsaI-RFLP酶切图谱1为Marker，2、8、11、14为HH，3为HI，4、9为II，5、12、15为HJ，6、7为IJ；10、13为JJ1为Marker，2为CC，3为DD，5、11、14、15为CD，4、6为GF，7为DF，8、12为CF，9为DG，10、13为EF带型甘孜臧猪n=25合作猪n=30滇南小耳猪n=30巴马小型猪n=34五指山猪n=33荷包猪n=34CC---0.2650.1210.059DD-----0.029GG0.055-0.167-0.061-FF-----0.147CD0.4000.7000.1000.1170.3330.029CG0.0400.1000.0670.0590.091-CE--0.3000.4710.0910.088CF0.0400.1000.1000.0880.03-DG0.2800.0340.133-0.121-DE0.040----0.500DF0.0400.0330.067--0.030表16个小型猪种SLA-DQB基因RsaI酶切PCR-RFLP带型及基因频率注：χ2值为对各品种内不同RFLP带型分布的Hardy-Weinberg平衡检验值，同列肩标ns表示没有达到显著水平（P>0.05）。下表同


本文编号：2913769