广东省屠宰场猪群PRRSV感染状况调查及基因测序分析

发布时间：2021-01-07 03:32

　　为了解广东省育肥猪群猪繁殖与呼吸综合征病毒（porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV）携带情况,2019年在广东省43个生猪屠宰场,采集临床健康生猪淋巴结样品840份,运用商品化荧光定量RT-PCR试剂盒进行PRRSV核酸检测。设计PRRSV ORF5基因引物,选取部分阳性样品进行RT-PCR,测序后进行基因序列分析。结果显示:840份样品的PRRSV阳性率为17.02%,其中美洲型为14.29%,欧洲型为2.73%;成功获得15份样品的ORF5基因序列,其中12株为美洲型,3株为欧洲型;美洲型毒株中包含:JXA1-like毒株5株,GM2-like毒株3株,NADC30-like和VR2332毒株各2株;美洲型毒株基因相似度为87.5%～99.6%,欧洲型为90.2%～90.4%。对美洲型毒株的ORF5基因编码的氨基酸进行分析,发现检测到的不同亚群毒株各个功能区存在广泛的、显著的变异。结果表明,广东省屠宰场猪群的PRRSV隐性带毒率较高,且毒株复杂多样,以美洲型毒株为主,且已存在欧洲型毒株。建议落实并强化规模化... 

【文章来源】：中国动物检疫. 2020,37(09)

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

PRRSV ORF5基因遗传进化分析结果

以VR2332为标准毒株，对检测到的12株美洲型PRRSV的GP5蛋白信号肽、诱导表位、第一高变区、中和表位、第二高变区、跨膜区及细胞表位进行氨基酸位点变异分析。由图3可以看出，大部分检测毒株信号肽区发生第3位（由E突变为G）、第11位（由Y突变为C）、第16位（由S突变为F）等氨基酸位点变异；诱导表位中，有3株毒株发生1个氨基酸位点变异，1株发生2个氨基酸位点变异；高变区中，氨基酸变异位点较多，但也有1株毒株没有发生变异；中和表位中，第38位氨基酸有3株毒株由H突变为Y，第39位有5株毒株由L突变为I、2株突变为S、1株突变为T；跨膜区主要发生第66位（由S突变为T/C）、第101位（由F突变为Y）、第102位（由V突变为Y/H/R）等氨基酸位点变异；细胞表位的变异主要有第121、127、161、185、189、200位等氨基酸位点的变异。第13位和151位氨基酸是与毒力相关的位点，其中：第13位点中，有3株为Q,9株由Q突变为R；第151位点中，有8株为R,4株由R突变为K。图3 PRRSV GP5氨基酸位点变异分析结果

PRRSV GP5氨基酸位点变异分析结果

【参考文献】：
期刊论文
[1]高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其分子流行病学分析[J]. 童光志,周艳君,郝晓芳,田志军,仇华吉,彭金美,安同庆.  中国预防兽医学报. 2007(05)



本文编号：2961821