甜菜磷脂酰肌醇转运蛋白基因SbSEC14的克隆及低温胁迫下的表达分析

发布时间：2021-01-10 13:08

　　磷脂酰肌醇转运蛋白（PITPs）广泛存在于真核生物细胞中,能够在体外膜脂质双层之间调控磷脂酰肌醇（PtdIns）或者磷脂酰胆碱（PtdCho）单体的独立转运。参与磷酸肌醇代谢、膜运输、极性生长、信号转导、逆境胁迫、胞浆运动和细胞周期调节等多种重要的生命过程,在植物的逆境响应以及发育调节中具有重要的作用。为了研究甜菜磷脂酰肌醇转运蛋白基因及其在低温胁迫下的表达情况。本研究以甜菜基因组数据库中一条预测的磷脂酰肌醇转运蛋白基因CRS1为模板,用基因克隆的方法得到一条全长765 bp,开放阅读框596 bp,编码198个氨基酸的甜菜SEC14基因,命名为SbSEC14。理化性质分析表明,该蛋白质为不稳定亲水蛋白;蛋白质二、三级结构分析表明,该蛋白质α-螺旋所占的比例最高,为47.47%,β-转角所占比例最低,为5.56%;蛋白质保守结构分析表明,该蛋白质有典型的SEC14结构域;蛋白质系统进化树分析表明,甜菜SbSEC14基因与菠菜、藜麦的磷脂酰肌醇运转蛋白基因亲缘关系最近;实时荧光定量结果表明,SbSEC14基因在甜菜中组成型表达,在甜菜叶中的表达量最高,在甜菜根中的表达量最低,在叶中表达量... 

【文章来源】：中国农学通报. 2020,36(32)

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

甜菜幼苗RNA电泳检测

甜菜Sb SEC14蛋白信号肽预测表明（图4）该蛋白序列是信号肽的可能为0.0016，是其他序列的可能为0.9984，因此判定该蛋白没有信号肽；疏水性/亲水性预测表明（图5）该蛋白氨基酸位点疏水性在第122位疏水性最强，分值为2.089；在第76位亲水性最强，分值为-2.389。分值大于0的氨基酸数为77个，分值小于0的氨基酸数为113，推测甜菜Sb SEC14蛋白是一种亲水蛋白。2.3.2 甜菜Sb SEC14基因编码蛋白的一级和二级结构预测

甜菜Sb SEC14基因编码蛋白的一级结构预测显示，该蛋白分子式为C1050H1622N264O293S9，分子量为22920.56，编码198个氨基酸，等电点(PI)为5.97，有27个带负电荷的氨基酸残基(Asp+Glu),25个带正电荷的氨基酸残基(Arg+Lys)，不稳定系数为43.91，数值大于40，表明该蛋白不稳定，推测该蛋白为不稳定酸性蛋白质。脂肪族指数为86.62，亲水性平均系数值为-0.154。二级结构预测显示（图6），甜菜Sb SEC14蛋白中α-螺旋所占的比例最高，为47.47%(94)，β转角所占比例最低，为5.56%(11)，β折叠所占15.66%(31)，无规则卷曲结构占31.31%(61)。图4 甜菜Sb SEC14蛋白序列的信号肽预测

【参考文献】：
期刊论文
[1]甘蔗磷脂酰肌醇转运蛋白基因ScSEC14响应干旱和盐胁迫[J]. 毛花英,刘峰,苏炜华,黄宁,凌辉,张旭,王文举,李聪娜,汤翰臣,苏亚春,阙友雄.  作物学报. 2018(06)
[2]普通小麦TaSEC14p-5基因的克隆及表达分析[J]. 苏世超,唐益苗,徐磊,王伟伟,高世庆,马锦绣,孙辉,王永波,乔亚科,赵昌平.  农业生物技术学报. 2016(08)



本文编号：2968762