罗氏沼虾生长性状候选基因的克隆及mRNA表达规律研究

发布时间：2021-01-10 14:11

　　罗氏沼虾（Macrobrachium rosenbergii）是国内主要的淡水虾养殖品。当前,我国罗氏沼虾种苗繁育和养殖技术达到国际先进水平,但仍存在规格不均、个体小型化、产量低下等问题,严重制约着我国罗氏沼虾养殖业优质、高效地发展。因此,开展罗氏沼虾生长性状候选基因的研究,明确其表达规律,可为进一步探究候选基因在生长发育过程中的调控机制提供依据。以孟加拉群体为基础群,构建20个全同胞家系,比较其生长性状,筛选出生长快速家系（fast-growing group,FG）和生长慢速家系（slow-growing group,SG）;选取胰蛋白酶（Trypsin,TRY）、淀粉酶（Amylase,AMY）、组织蛋白酶L（Cathepsin,CaTL）、肌肉生长抑制素（Myostatin,MSTN）、维甲酸X受体（Retinoid X receptor,RXR）、Ras相关蛋白（Ras-related nuclear protein,Ran）、热休克蛋白 90（Heat shock protein 90,HSP90）和蜕皮激素受体（Ecdysone receptor,EcR）8个与生长性状相... 

【文章来源】：广西大学广西壮族自治区 211工程院校

【文章页数】：110 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
缩略词中英文对照表
引言
第一章 文献综述
    1.1 罗氏沼虾的生长发育过程
    1.2 罗氏沼虾养殖现状
        1.2.1 罗氏沼虾的分布及现状
        1.2.2 目前养殖过程中存在的问题
        1.2.3 常规育种现状
    1.3 生长性状候选基因的研究进展
        1.3.1 TRY基因研究进展
        1.3.2 AMY基因研究进展
        1.3.3 CaTL基因研究进展
        1.3.4 MSTN基因研究进展
        1.3.5 RXR基因研究进展
        1.3.6 Ran基因研究进展
        1.3.7 HSP90基因研究进展
        1.3.8 EcR基因研究进展
    1.4 研究目的及意义
第二章 罗氏沼虾家系构建及不同家系间生长性状比较
    2.1 实验材料
    2.2 实验方法
        2.2.1 亲虾交配
        2.2.2 家系幼体的标准化培育
        2.2.3 性状测量
        2.2.4 数据统计
    2.3 结果
        2.3.1 20个家系生长性状的表型数据统计
        2.3.2 罗氏沼虾不同家系的生长性状比较
        2.3.3 不同生长速度家系的生长性状比较
    2.4 讨论
        2.4.1 罗氏沼虾家系构建
        2.4.2 不同家系生长性状比较
        2.4.3 生长快慢家系的性状比较
    2.5 小结
第三章 罗氏沼虾生长性状候选基因的克隆和生物信息学分析
    3.1 实验材料
        3.1.1 实验样品
        3.1.2 主要实验试剂和配置方法
        3.1.3 实验主要仪器设备
    3.2 实验方法
        3.2.1 罗氏沼虾肝胰腺组织总RNA的提取
        3.2.2 cDNA的合成
        3.2.3 克隆引物的设计与合成
        3.2.4 PCR扩增
        3.2.5 目的片段与pMD18-T载体连接
        3.2.6 pMD18-T重组质粒的转化
        3.2.7 重组质粒的PCR鉴定和测序鉴定
        3.2.8 罗氏沼虾候选基因的生物信息学分析
    3.3 结果
        3.3.1 肝胰腺总RNA提取结果
        3.3.2 TRY基因结果
        3.3.3 AMY基因结果
        3.3.4 CaTL基因结果
        3.3.5 MSTN基因结果
        3.3.6 RXR基因结果
        3.3.7 Ran基因结果
        3.3.8 HSP90基因结果
        3.3.9 EcR基因结果
    3.4 讨论
    3.5 小结
第四章 罗氏沼虾生长性状候选基因组织表达谱分析
    4.1 实验材料
        4.1.1 实验样品
        4.1.2 主要实验试剂
        4.1.3 主要仪器和设备
    4.2 实验方法
        4.2.1 罗氏沼虾各组织RNA的提取
        4.2.2 罗氏沼虾各组织cDNA的合成
        4.2.3 定量引物的设计与合成
        4.2.4 实时荧光定量PCR
    4.3 结果
        4.3.1 罗氏沼虾各组织RNA电泳图
        4.3.2 罗氏沼虾TRY基因的组织表达
        4.3.3 罗氏沼虾AMY基因的组织表达
        4.3.4 罗氏沼虾CaTL基因的组织表达
        4.3.5 罗氏沼虾MSTN基因的组织表达
        4.3.6 罗氏沼虾RXR基因的组织表达
        4.3.7 罗氏沼虾Ran基因的组织表达
        4.3.8 罗氏沼虾HSP90基因的组织表达
        4.3.9 罗氏沼虾EcR基因的组织表达
    4.4 讨论
        4.4.1 TRY、AMY、CaTL和HSP90基因的表达分析
        4.4.2 MSTN、RXR、Ran和ECR基因的表达分析
    4.5 小结
第五章 候选基因在罗氏沼虾不同生长速度家系中的表达分析
    5.1 实验材料
        5.1.1 实验样品
        5.1.2 主要实验试剂
        5.1.3 主要仪器
    5.2 实验方法
        5.2.1 肌肉组织总RNA的提取
        5.2.2 罗氏沼虾肌肉组织cDNA的合成
        5.2.3 引物的设计与合成
        5.2.4 罗氏沼虾候选基因荧光定量表达
    5.3 结果
        5.3.1 罗氏沼虾肌肉组织RNA电泳图
        5.3.2 罗氏沼虾不同生长速度
        5.3.3 基因在不同生长速度家系个体中的表达
    5.4 讨论
        5.4.1 TRY、AMY、CaTL和HSP90基因在不同生长速度家系个体中的表达分析
        5.4.2 MSTN、RXR、Ran和ECR基因在不同生长速度家系个体中的表达分析
    5.5 小结
结论
参考文献
附录
致谢
硕士期间发表论文情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]离体猪肝胆道内射频消融时毗邻胆道热休克蛋白70表达情况[J]. 杨超,卢伟,马军朋,杨剑,蒋富强,杜鹏,张嘉诚,解鹏,张哲.  转化医学杂志. 2018(03)
[2]淇河鲫不同家系生长性能的比较[J]. 王磊,施文瑞,宋东蓥,马晓,吴利敏,李学军,陈军平,张世杰,孙亚威,许莎诺.  淡水渔业. 2018(03)
[3]中华绒螯蟹MSTN基因SNPs多态性及与生长性状的关联分析[J]. 陈义培,吴廉,陈晓雯,岳武成,黄姝,王军,王成辉.  水生生物学报. 2018(02)
[4]淇河鲫家系早期生长性能的比较[J]. 陈军平,王娅,王磊,樊云鹏,张世杰,许沙诺,齐如意,张红,高兴磊.  河南水产. 2018(01)
[5]斑节对虾α-淀粉酶基因的克隆及其表达分析[J]. 杨其彬,李运东,江世贵,黄建华,姜松,邱丽华,朱彩艳,周发林.  水生生物学报. 2017(06)
[6]青虾Ran基因的克隆、表达及其在卵巢发育中的功能[J]. 卜宗元,傅洪拓,孙盛明,乔慧,金舒博,张文宜,龚永生,蒋速飞,熊贻伟,吴滟.  中国水产科学. 2017(03)
[7]脊尾白虾MSTN基因组织及不同蜕皮后时间点的表达特征[J]. 薛蓓,张培,李志辉,赵莲,邰小飞,徐晔,赖晓芳,高焕,阎斌伦.  淮海工学院学报(自然科学版). 2016(04)
[8]中华绒螯蟹蜕壳生长及其与相关基因表达的关联分析[J]. 陈娇,岳武成,陈晓雯,慈元吉,黄姝,王军,王成辉.  动物学杂志. 2016(06)
[9]甲壳类生长相关基因研究进展[J]. 阎斌伦,薛蓓,赵莲,高焕.  海洋湖沼通报. 2016(04)
[10]断肢再生对中华绒螯蟹蜕壳、生长及相关基因表达的影响[J]. 岳武成,陈娇,慈元吉,黄姝,王军,王成辉.  浙江大学学报(农业与生命科学版). 2016(04)

博士论文
[1]凡纳滨对虾生长性能相关候选基因的分离鉴定、表达规律及调控功能研究[D]. 钱昭英.西北农林科技大学 2014
[2]草鱼、鳡和翘嘴鲌胰蛋白酶和淀粉酶的早期发育[D]. 阮国良.华中农业大学 2010

硕士论文
[1]白藜芦醇通过脂联素信号通路调控肌纤维类型转化的研究[D]. 程晓芳.广西大学 2017
[2]抑制热休克蛋白90（HSP90）功能对斑马鱼发育的影响[D]. 罗军涛.上海海洋大学 2017
[3]斑节对虾生长性状相关基因克隆及其SNP位点的筛选与验证[D]. 李运东.上海海洋大学 2016
[4]糖化酵母葡萄糖淀粉酶基因在酿酒酵母中克隆与表达[D]. 郭彦言.长春工业大学 2015
[5]克氏原螯虾α-淀粉酶基因的克隆与功能分析[D]. 彭涛.安徽农业大学 2015
[6]三疣梭子蟹RXR基因在蜕皮和卵巢发育过程中的表达分析[D]. 汤洁.宁波大学 2014
[7]三疣梭子蟹EcR基因在蜕皮和卵巢发育过程中的表达分析[D]. 崔晓雨.宁波大学 2014
[8]养殖密度、盐度和温度对罗氏沼虾性别分化和早期性腺发育的影响[D]. 周梦颖.上海海洋大学 2014
[9]杂色鲍维甲酸X受体转录激活系统的构建与配体筛选[D]. 钟恩惠.集美大学 2014
[10]合浦珠母贝α-淀粉酶基因结构、SNP筛选、生长关联与生态响应研究[D]. 李璐.上海海洋大学 2013



本文编号：2968850