金钱鱼Sox3基因cDNA克隆及组织表达
发布时间:2021-01-12 00:39
金钱鱼是中国重要经济型鱼类,但其人工繁殖难以取得成功。本研究利用cDNA末端快速扩增法(rapid-amplification of cDNA ends, RACE)克隆了金钱鱼(Scatophagus argus) Sox3基因cDNA全长序列,分析该基因序列在不同物种间的差异,并用RT-PCR半定量方法分析其在雌、雄组织中的表达差异。结果表明:金钱鱼Sox3 c DNA全长1 270 bp,包括5’非翻译区(5’-UTR) 217 bp、3’非翻译区(3’-UTR) 150 bp和开放阅读框(open reading frame, ORF) 903 bp,编码300个氨基酸,该氨基酸序列34104位为HMG保守盒。金钱鱼Sox3氨基酸序列与大黄鱼(Larimichthys crocea)的同源性最高,为99.3%,其次是金头鲷(Sparus aurata),为98.7%。Sox3前体蛋白的系统进化树显示,金钱鱼与大黄鱼亲缘关系最近。金钱鱼Sox3基因的组织表达有明显的组织特异性及性别差异,在性腺中表达量最高,雄性个体脑和垂体次之,肌肉、肾脏、心脏和肠有低量的表...
【文章来源】:基因组学与应用生物学. 2020,39(07)北大核心
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
金钱鱼Sox3 cDNA序列及其推导的氨基酸序列
本研究发现Sox3基因在金钱鱼不同组织中存在表达差异,且不同性别个体的组织表达也存在差异,表明Sox3基因在多种组织中表达,并存在多种生理功能。金钱鱼体内Sox3基因的表达与其他鱼类存在相似性也存在差异性。相似性是在多种鱼类的脑组织中均检测到Sox3基因具有较高的表达量,与斜带石斑鱼(姚波等,2003)、许氏平鲉(马丽曼,2014)、斑马鱼(Dee et al,2008)和泥鳅(张林霞,2015)等鱼类相似,表明Sox3基因对神经系统的正常生长发育及组织分化有着重要作用(Wang et al.,2006;许可等,2017,中国卫生检验杂志,27(8):1214-1216)。在金钱鱼的卵巢和精巢中均能检测到Sox3基因较高的表达量,这点与泥鳅(张林霞,2015)和青岛文昌鱼(曹慧慧,2011)相似,而斜带石斑鱼(姚波等,2003)和许氏平鲉(马丽曼,2014)的Sox3基因在卵巢中的表达水平显著高于精巢,表明Sox3基因对性别决定及分化有着重要作用(Weiss et al.,2003;许可等,2017,中国卫生检验杂志,27(8):1214-1216)。在雌性金钱鱼的鳃中检测到Sox3基因较高的表达量,而雄性金钱鱼鳃中无Sox3基因表达,但在许氏平鲉(马丽曼,2014)和青岛文昌鱼(曹慧慧,2011)雄雌鱼的鳃组织中均检测到了较高水平的Sox3基因转录本。在金钱鱼中,Sox3基因无性别差异地高表达于脑、垂体和性腺中,说明Sox3对于金钱鱼神经系统和性腺的生长发育具有重要意思,而鳃中存在Sox3性别表达差异,其差异原因及其在鳃中表达的意思仍需探讨。图5 不同脊椎动物Sox3的系统进化树分析
不同脊椎动物Sox3的系统进化树分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]金钱鱼繁殖生物学及诱导产卵试验[J]. 蔡泽平,王毅,胡家玮,张俊彬,林岳光. 热带海洋学报. 2010(05)
[2]金钱鱼生物学研究及回顾[J]. 兰国宝,阎冰,廖思明,罗砚,谢若痴. 水产科学. 2005(07)
[3]斜带石斑鱼sox3基因cDNA的克隆及其时空表达特征分析[J]. 姚波,周莉,桂建芳. 高技术通讯. 2003(05)
[4]东北虎Sox3和Sox4基因的保守区序列分析[J]. 杜启艳,常重杰,牛红星. 河南师范大学学报(自然科学版). 2003(01)
[5]Sox基因家族研究的新进展[J]. 常重杰,杜启艳,邵红伟. 遗传. 2002(04)
[6]SOX基因家族的研究现状[J]. 常重杰,周荣家,余其兴. 遗传. 2000(01)
[7]金钱鱼的生长特性与咸水池塘驯养[J]. 张邦杰,梁仁杰,毛大宁,张邦豪. 现代渔业信息. 1999(10)
博士论文
[1]许氏平鲉性别相关基因Sox3、Sox9和Dmrt1的研究[D]. 马丽曼.中国海洋大学 2014
硕士论文
[1]中国大鲵Sox3、Sox5基因cDNA序列的克隆及组织表达分析[D]. 张向伟.四川农业大学 2017
[2]两种泥鳅SOX3基因的克隆、表达和功能分析[D]. 张林霞.河南师范大学 2015
[3]青岛文昌鱼Sox1/2/3-like基因的扩增与表达研究[D]. 曹慧慧.鲁东大学 2011
本文编号:2971787
【文章来源】:基因组学与应用生物学. 2020,39(07)北大核心
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
金钱鱼Sox3 cDNA序列及其推导的氨基酸序列
本研究发现Sox3基因在金钱鱼不同组织中存在表达差异,且不同性别个体的组织表达也存在差异,表明Sox3基因在多种组织中表达,并存在多种生理功能。金钱鱼体内Sox3基因的表达与其他鱼类存在相似性也存在差异性。相似性是在多种鱼类的脑组织中均检测到Sox3基因具有较高的表达量,与斜带石斑鱼(姚波等,2003)、许氏平鲉(马丽曼,2014)、斑马鱼(Dee et al,2008)和泥鳅(张林霞,2015)等鱼类相似,表明Sox3基因对神经系统的正常生长发育及组织分化有着重要作用(Wang et al.,2006;许可等,2017,中国卫生检验杂志,27(8):1214-1216)。在金钱鱼的卵巢和精巢中均能检测到Sox3基因较高的表达量,这点与泥鳅(张林霞,2015)和青岛文昌鱼(曹慧慧,2011)相似,而斜带石斑鱼(姚波等,2003)和许氏平鲉(马丽曼,2014)的Sox3基因在卵巢中的表达水平显著高于精巢,表明Sox3基因对性别决定及分化有着重要作用(Weiss et al.,2003;许可等,2017,中国卫生检验杂志,27(8):1214-1216)。在雌性金钱鱼的鳃中检测到Sox3基因较高的表达量,而雄性金钱鱼鳃中无Sox3基因表达,但在许氏平鲉(马丽曼,2014)和青岛文昌鱼(曹慧慧,2011)雄雌鱼的鳃组织中均检测到了较高水平的Sox3基因转录本。在金钱鱼中,Sox3基因无性别差异地高表达于脑、垂体和性腺中,说明Sox3对于金钱鱼神经系统和性腺的生长发育具有重要意思,而鳃中存在Sox3性别表达差异,其差异原因及其在鳃中表达的意思仍需探讨。图5 不同脊椎动物Sox3的系统进化树分析
不同脊椎动物Sox3的系统进化树分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]金钱鱼繁殖生物学及诱导产卵试验[J]. 蔡泽平,王毅,胡家玮,张俊彬,林岳光. 热带海洋学报. 2010(05)
[2]金钱鱼生物学研究及回顾[J]. 兰国宝,阎冰,廖思明,罗砚,谢若痴. 水产科学. 2005(07)
[3]斜带石斑鱼sox3基因cDNA的克隆及其时空表达特征分析[J]. 姚波,周莉,桂建芳. 高技术通讯. 2003(05)
[4]东北虎Sox3和Sox4基因的保守区序列分析[J]. 杜启艳,常重杰,牛红星. 河南师范大学学报(自然科学版). 2003(01)
[5]Sox基因家族研究的新进展[J]. 常重杰,杜启艳,邵红伟. 遗传. 2002(04)
[6]SOX基因家族的研究现状[J]. 常重杰,周荣家,余其兴. 遗传. 2000(01)
[7]金钱鱼的生长特性与咸水池塘驯养[J]. 张邦杰,梁仁杰,毛大宁,张邦豪. 现代渔业信息. 1999(10)
博士论文
[1]许氏平鲉性别相关基因Sox3、Sox9和Dmrt1的研究[D]. 马丽曼.中国海洋大学 2014
硕士论文
[1]中国大鲵Sox3、Sox5基因cDNA序列的克隆及组织表达分析[D]. 张向伟.四川农业大学 2017
[2]两种泥鳅SOX3基因的克隆、表达和功能分析[D]. 张林霞.河南师范大学 2015
[3]青岛文昌鱼Sox1/2/3-like基因的扩增与表达研究[D]. 曹慧慧.鲁东大学 2011
本文编号:2971787
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