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七鳃鳗pdcd基因家族分子进化和L-PDCD5介导细胞凋亡的研究

发布时间:2021-01-24 11:06
  程序性细胞死亡(Programmed cell death,PDCD)基因在细胞存活、凋亡和死亡的调节中起着重要作用。为了深入了解PDCD家族的进化和分子功能,本文对东北七鳃鳗(Lampetra morii Berg)三代测序文库和 ESTs(Expressed Sequence tags)进行筛查,首次在七鳃鳗中发现了类似程序性细胞死亡的基因,进而为PDCD家族在进化过程中结构和功能的演变提供研究基础。研究分析表明,L-pdcd基因家族的核苷酸序列及其表达蛋白质的氨基酸序列分别与人的pdcd基因家族序列具有高度的相似性,本文将这些基因分别命名为 L-pdcd2、L-pdcd4、L-pdcd5、L-pdcd6 和 L-pdcd10。本文对来自脊椎动物的PDCD家族进行了包括基因的直系同源物、保守的同线性、功能结构域和系统发育树等方面的分析,发现L-PDCD蛋白家族之间含有不同的结构域和三级结构,但与其它物种对应的亚型却没有明显差异。在pdcd基因家族的进化上,七鳃鳗与其它物种都有很强的保守性。此外,本文还进行了无颌脊椎动物和颌骨脊椎动物之间的遗传图谱比较,以观察L-pdcd基因家族的同... 

【文章来源】:辽宁师范大学辽宁省

【文章页数】:82 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

七鳃鳗pdcd基因家族分子进化和L-PDCD5介导细胞凋亡的研究


图1.2?PDCD4在疾病中作用的示意图丨39]??Fig.?1.2?The?schematic?outline?of?PDCD4-related?role?in?diseases1391??

系统发育树,基序,蛋白,七鳃鳗


序(基序4、8、10、11、12、13和14),PDCD5蛋白含有3个基序(基序1、2、??13)?,?PDCD6蛋白含有4个基序(基序3、5、6和13),PDCD10蛋白含有4个??基序(基序3、4、6和13)(图2.2)。同时,人和其它物种PDCD家族包含的Motif??在七鳃鳗中都存在

氨基酸序列,基序,辽宁师范大学,硕士学位论文


辽宁师范大学硕士学位论文表2.4运用MEME在线软件分析脊椎动物氨基酸序列中的保守基序??Tab.?2.4?Conserved?motifs?discovered?in?vertebrates?using?the?MEME?system??Motif?Width?Best?possible?match??^j?4\?NYLIQMARYGQLPGKVSEOGLIEILEKVSQQTEKKTTVKFN??2?50?HGDPGDAA〇〇EAKHREAEMRNSILAQVLD〇SARARLSNLALVKPDKA??3?41?YVKSFSDMFKTYFKDGKNFNVFTSVWKYIHQWNNIFRTYKT??4?41?MRAGKQILDNIWGEINGQVRFKHTIKEIAMAIKEYLDSGNN??5?50?DR〇GRG〇VAFDDFI〇CCIVL〇RLTDVFRRYDTDQDGWIQVSYE〇YLSM??6?41?LPD〇〇FLWNVF〇RVDKDNPGVISDTIMQQALSNGTWTPFNP??7?50?EKDIPDCSCGAKRIFEFOVMPQLLNHLKVDSLGESIDWGTLVVYTCAES??8?50?WKSGVITLDQMNRGYERVYGEIPDINLDVPHAYSVLERFVEECFOAGII??9?45?LKCGAHLCRVCGCLGPKACSRCHKAHYCCKEHQTMDWKLGHKHSC??10?50?KGKLLDRRSRSGKGRGLPKKGGAGGKGVWGTPG〇VYDVEEVDIKDPN??11?50?EYFEHGDTNEVAEMLKDLNLGHMKYGVPVLAVSLALEGK

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:2997136

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