罗非鱼nkef基因（On-NKEF）的克隆及其在NCC活性调控中的作用

发布时间：2021-01-29 23:15

　　NKEF（Natural Killer Enhancing Factor,自然杀伤增强因子）-A/B是一类Peroxiredoxin（Prxs）家族抗氧化蛋白,最初在酵母中发现,因其能提高NK细胞杀伤毒性而得名。此外,NKEF还参与了炎症调节,癌症发生与发展以及氧化还原反应等过程。NCC（Nonspecific Cytotoxic Cell,非特异性细胞毒性细胞）是哺乳类NK细胞的前体细胞,在鱼类先天性免疫中发挥重要作用。然而NKEF在罗非鱼NCC活性调控中的作用尚不清楚。本研究对罗非鱼nkef基因进行了鉴定与功能分析,并取得以下结果:1、通过RACE技术得到罗非鱼nkef（On-NKEF）基因全长共1274 bp,其中5’-UTR为57 bp,3’-UTR为620 bp,ORF为597 bp,编码198个氨基酸。经网站预测,该蛋白分子量大小为22.085 kDa,理论等电点大小为6.51,包含一个Typical 2-Cys Prx家族结构域,在第51和172位分别是两个有活性的半胱氨酸位点。该蛋白在哺乳类、鸟类、两栖类及鱼类中十分保守,同源性在80%以上。系统进化分析可知与斑马拟丽鱼... 

【文章来源】：广东海洋大学广东省

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

On-NKEF基因核酸及氨基酸序列

罗非鱼 nkef 基因(On-NKEF)的克隆及其在 NCC 活性调控中的作用2.3.4 同源性及进化树预测氨基酸多序列比对发现，该基因在所选物种中具有很高同源性，蛋白序列保守。罗非鱼 NKEF 与裸盖鱼 NKEF-A 氨基酸序列相似度最高，为 92%，与非洲爪蟾NKEF-A 的氨基酸序列相似度最低，为 80%，如图 2-3。

17图 2-4 On-NKEF 的进化分析Fig. 2-4 Phylogenetic analysis of On-NKEF with other reported NKEF2.4 讨论本研究通过 NCBI 数据库预测尼罗罗非鱼基因组信息，设计相关引物克隆得到罗非鱼 nkef 基因序列，并通过 RACE 技术获得该基因全长。该基因 ORF 与 NCBI 数据库记录序列一致，两端非编码区有所不同。通过序列分析发现，该基因翻译得到的蛋白平均亲水指数为负值，说明该蛋白为亲水性蛋白。On-NKEF 基因总共编码 198 个氨基酸残基，其中第 8 位至第 180 位是 Peroxiredoxin 家族的保守结构域，该结构域

【参考文献】：
期刊论文
[1]Poly（I:C）模拟RNA病毒在气道炎症研究中的应用[J]. 陈瑶,李云珠,俞善昌,邵洁.  临床儿科杂志. 2009(08)
[2]中国大陆罗非鱼养殖业发展对策[J]. 李思发.  中国渔业经济研究. 1999(01)
[3]鱼类免疫学研究的进展[J]. 杨先乐.  水产学报. 1989(03)

硕士论文
[1]人抗氧化蛋白Peroxiredoxin 1和2的表达、纯化及功能研究[D]. 颜晟.华南理工大学 2012
[2]红笛鲷非特异性细胞毒性细胞活性及其受体表达的研究[D]. 周晴.广东海洋大学 2012



本文编号：3007779