从江香猪LPL基因克
发布时间：2021-01-30 11:56
脂蛋白脂酶（lipoprotein lipase,LPL）具有调控动物机体脂肪沉积的功能,但在小型地方猪种中LPL基因分子遗传机制研究鲜有报道。为探究LPL基因调控功能,揭示其对从江香猪（Sus scrofa）肉质性状的影响,本研究以从江香猪为实验动物,利用RT-PCR技术克隆从江香猪LPL基因CDS区（Gen Bank No.1994531）,生物信息学软件预测蛋白理化性质及结构特征,通过限制性片段长度多态性聚合酶链反应（polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP）技术对从江香猪LPL基因第5内含子AfaⅠ位点进行遗传效应分析,运用q RT-PCR技术分析不同月龄阶段从江香猪背最长肌组织中LPL mRNA表达发育规律,并研究其与肌内脂肪（intramuscular fat,IMF）含量相关性。结果表明,从江香猪LPL基因CDS区全序列长1 437 bp,共编码478个氨基酸,构成具有PLAT/LH2结构域的稳定亲水性蛋白。不同品种猪间氨基酸序列的同源性很高,其中从江香猪与挪威长...
【文章来源】：农业生物技术学报. 2017,25(04)北大核心
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
Smartv6.0程序对从江香猪LPL蛋白结构域分析
699.299.699.899.899.6298.799.299.499.499.6398.798.998.998.7499.499.499.2599.699.4699.47表2不同品种猪种间LPL蛋白氨基酸同源相似度(%)分析Table2AminoacidhomologyanalysisofLPLproteinfordifferentswinebreeds1：从江香猪；2：杜洛克；3：贵州白香猪；4：大白猪；5：陆川猪；6：挪威长白猪；7：清平猪1:Congjiangxiang;2:DurocAY559454.1;3:Guizhoubaixi-angHQ699490.1;4:LargewhiteAY686761.1;5:Luchuan;6:NorwegianLandraceX62984.1;7:QingpingAY559452.1图3不同品种猪LPL氨基酸系统进化树Figure3TheaminoacidphylogenetictreeofLPLofdifferentswinebreeds从江香猪LPL基因克垄多态及时序表达图谱构建Cloning,PolymorphismsandTissueExpressionProfileofLPLGeneinCongjiangPigs(Susscrofa)603
臣〕?度)存在极显著相关，已将其作为调控猪胴体性能的重要候选位点(Leietal.,2004)。为探究LPL基因内含子5中AfaⅠ位点是否可作为肉质性状的分子遗传标记来利用，本实验通过对从江香猪AfaⅠ位点遗传效应分析发现，该群体中G等位基因频率为0.6495，高于C等位基因频率，该结果与王刚等(2007)报道国内脂肪型莱芜猪LPL基因内含子5中AfaⅠ位点A型等位基因频率较高，而国外瘦肉型大白猪B型等位基因频率较高相一致。关联性分析显示，从江香猪群体中CC基因型皮厚显著高于CG型，且CC型个体间背膘厚、眼肌面积和肌内脂图4LPL基因PCR产物电泳(A)和内含子5扩增产物AfaⅠ酶切结果(B)Figure4ImageofPCRproductsofLPLgene(A)andbandpatternsofintron5ofLPLgenedigestedwithAfaⅠ(B)M：DL2000DNA分子量标准；2：CC型；3、4和6：CG型；1和5：GG型M:DL2000DNAmarker;2:CC;3,4and6:CG;1and5:GGM12345620001000750500250100bp336bpbpM123456bp20001000750500250100336232104AB图5PCR产物测序验证结果Figure5ThesequencingoftheverificationresultsofPCRproductsGTACTGAGTACTGAGTAGTGACCCGGG基因型GenotypeCCCGGG皮厚(ST)/mmSkinthickness4.60±0.37a3.74±0.69b4.11±0.59ab背膘厚(BFT)/mmBackfatthickness24.34±5.1521.99±5.3122.49±5.52眼肌面积(LMA)/cm2Lioneyearea17.67±1.4217.29±3.7616.43±2.45眼肌深度(LMD)/mmLioneyedepth36.35±2.4237.07±5.0236.97±4.54肌内脂肪(IMF)/%Intramuscularfat3.27±0.923.18±1.032.97±0.77表4AfaⅠ位点与肉质指标关联性分析Table4AssociationbetweendifferentgenotypeandmeatqualitytraitsofAfaⅠl
【参考文献】：
期刊论文
[1]牦牛CYGB基因CDS区克隆与生物信息学分析[J]. 孙雪婧,杜晓华,杨孝朴,罗玉柱,刘霞. 中国农业科学. 2014(13)
[2]陆川猪脂蛋白脂酶基因的克隆与序列分析[J]. 黄艳娜,李莉,何少婧,韦玲静,梁明振,兰干球,蒋钦杨. 南方农业学报. 2014(06)
[3]猪肌肉组织MDH和LPL基因表达与肌内脂肪含量和脂肪酸组成关系的研究[J]. 祝仁铸,尹逊河,王元虎,李少青,武道留,王倩. 畜牧兽医学报. 2013(08)
[4]贵州白香猪脂蛋白酯酶基因cDNA的克隆与序列分析[J]. 赵佳福,许厚强,乜玉丽,张勇,陈祥,龚婷. 江苏农业学报. 2012(01)
[5]贵州白香猪母系与父系遗传检测[J]. 王兆龙,刘若余,田甜. 山地农业生物学报. 2009(03)
[6]猪生长肥育期背最长肌LPL基因表达与肌内脂肪含量相关研究[J]. 廉红霞,卢德勋,高民. 畜牧与兽医. 2007(12)
[7]猪肌肉组织LPL基因表达的发育性变化及其与肌内脂肪沉积关系的研究[J]. 王刚,曾勇庆,武英,魏述东,包新见,刘婵娟,孙延晓. 畜牧兽医学报. 2007(03)
[8]莱芜猪脂肪代谢酶活性的发育性变化及其对肌内脂肪沉积的影响[J]. 杨海玲,曾勇庆,魏述东,武英,曹洪防,刘婵娟,王刚,包新见. 畜牧兽医学报. 2005(11)
[9]二花脸猪与大约克猪生长期肌内脂肪合成与水解基因表达特征的比较研究[J]. 高勤学,李俊,刘红林,王林云,徐银学. 遗传学报. 2004(11)
博士论文
[1]猪脂蛋白脂酶（LPL）和激素敏感脂肪酶（HSL）基因的序列和多态性分析及体外表达的研究[D]. 张振波.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]猪LPL基因cDNA的克隆、多态性和表达谱分析[D]. 王研.东北农业大学 2009
[2]野猪、野家杂交猪及家猪LPL基因表达规律及定量比较研究[D]. 丁琳琳.东北农业大学 2008
本文编号：3008856
【文章来源】：农业生物技术学报. 2017,25(04)北大核心
【文章页数】：8 页
【部分图文】：
Smartv6.0程序对从江香猪LPL蛋白结构域分析
699.299.699.899.899.6298.799.299.499.499.6398.798.998.998.7499.499.499.2599.699.4699.47表2不同品种猪种间LPL蛋白氨基酸同源相似度(%)分析Table2AminoacidhomologyanalysisofLPLproteinfordifferentswinebreeds1：从江香猪；2：杜洛克；3：贵州白香猪；4：大白猪；5：陆川猪；6：挪威长白猪；7：清平猪1:Congjiangxiang;2:DurocAY559454.1;3:Guizhoubaixi-angHQ699490.1;4:LargewhiteAY686761.1;5:Luchuan;6:NorwegianLandraceX62984.1;7:QingpingAY559452.1图3不同品种猪LPL氨基酸系统进化树Figure3TheaminoacidphylogenetictreeofLPLofdifferentswinebreeds从江香猪LPL基因克垄多态及时序表达图谱构建Cloning,PolymorphismsandTissueExpressionProfileofLPLGeneinCongjiangPigs(Susscrofa)603
臣〕?度)存在极显著相关，已将其作为调控猪胴体性能的重要候选位点(Leietal.,2004)。为探究LPL基因内含子5中AfaⅠ位点是否可作为肉质性状的分子遗传标记来利用，本实验通过对从江香猪AfaⅠ位点遗传效应分析发现，该群体中G等位基因频率为0.6495，高于C等位基因频率，该结果与王刚等(2007)报道国内脂肪型莱芜猪LPL基因内含子5中AfaⅠ位点A型等位基因频率较高，而国外瘦肉型大白猪B型等位基因频率较高相一致。关联性分析显示，从江香猪群体中CC基因型皮厚显著高于CG型，且CC型个体间背膘厚、眼肌面积和肌内脂图4LPL基因PCR产物电泳(A)和内含子5扩增产物AfaⅠ酶切结果(B)Figure4ImageofPCRproductsofLPLgene(A)andbandpatternsofintron5ofLPLgenedigestedwithAfaⅠ(B)M：DL2000DNA分子量标准；2：CC型；3、4和6：CG型；1和5：GG型M:DL2000DNAmarker;2:CC;3,4and6:CG;1and5:GGM12345620001000750500250100bp336bpbpM123456bp20001000750500250100336232104AB图5PCR产物测序验证结果Figure5ThesequencingoftheverificationresultsofPCRproductsGTACTGAGTACTGAGTAGTGACCCGGG基因型GenotypeCCCGGG皮厚(ST)/mmSkinthickness4.60±0.37a3.74±0.69b4.11±0.59ab背膘厚(BFT)/mmBackfatthickness24.34±5.1521.99±5.3122.49±5.52眼肌面积(LMA)/cm2Lioneyearea17.67±1.4217.29±3.7616.43±2.45眼肌深度(LMD)/mmLioneyedepth36.35±2.4237.07±5.0236.97±4.54肌内脂肪(IMF)/%Intramuscularfat3.27±0.923.18±1.032.97±0.77表4AfaⅠ位点与肉质指标关联性分析Table4AssociationbetweendifferentgenotypeandmeatqualitytraitsofAfaⅠl
【参考文献】：
期刊论文
[1]牦牛CYGB基因CDS区克隆与生物信息学分析[J]. 孙雪婧,杜晓华,杨孝朴,罗玉柱,刘霞. 中国农业科学. 2014(13)
[2]陆川猪脂蛋白脂酶基因的克隆与序列分析[J]. 黄艳娜,李莉,何少婧,韦玲静,梁明振,兰干球,蒋钦杨. 南方农业学报. 2014(06)
[3]猪肌肉组织MDH和LPL基因表达与肌内脂肪含量和脂肪酸组成关系的研究[J]. 祝仁铸,尹逊河,王元虎,李少青,武道留,王倩. 畜牧兽医学报. 2013(08)
[4]贵州白香猪脂蛋白酯酶基因cDNA的克隆与序列分析[J]. 赵佳福,许厚强,乜玉丽,张勇,陈祥,龚婷. 江苏农业学报. 2012(01)
[5]贵州白香猪母系与父系遗传检测[J]. 王兆龙,刘若余,田甜. 山地农业生物学报. 2009(03)
[6]猪生长肥育期背最长肌LPL基因表达与肌内脂肪含量相关研究[J]. 廉红霞,卢德勋,高民. 畜牧与兽医. 2007(12)
[7]猪肌肉组织LPL基因表达的发育性变化及其与肌内脂肪沉积关系的研究[J]. 王刚,曾勇庆,武英,魏述东,包新见,刘婵娟,孙延晓. 畜牧兽医学报. 2007(03)
[8]莱芜猪脂肪代谢酶活性的发育性变化及其对肌内脂肪沉积的影响[J]. 杨海玲,曾勇庆,魏述东,武英,曹洪防,刘婵娟,王刚,包新见. 畜牧兽医学报. 2005(11)
[9]二花脸猪与大约克猪生长期肌内脂肪合成与水解基因表达特征的比较研究[J]. 高勤学,李俊,刘红林,王林云,徐银学. 遗传学报. 2004(11)
博士论文
[1]猪脂蛋白脂酶（LPL）和激素敏感脂肪酶（HSL）基因的序列和多态性分析及体外表达的研究[D]. 张振波.华中农业大学 2005
硕士论文
[1]猪LPL基因cDNA的克隆、多态性和表达谱分析[D]. 王研.东北农业大学 2009
[2]野猪、野家杂交猪及家猪LPL基因表达规律及定量比较研究[D]. 丁琳琳.东北农业大学 2008
本文编号：3008856
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