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高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析

发布时间:2021-02-14 01:42
  SQUA启动子结合蛋白-box (SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box, SBP-box)基因家族编码一类植物特有的SBP转录因子,在植物界分布广泛,参与植物生长、发育、繁衍等多方面调控,包括胚胎发生、次生产物合成、胁迫应答等,在作物改良方面具有价值。本研究主要通过生物信息学以及实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)方法,对高粱(Sorghum bicolor) SbSBP15基因进行克隆和表达分析。研究结果显示,该基因CDS全长1 227 bp (GenBank No. MT634207),编码408个氨基酸。SbSBP15蛋白含有1个典型SBP结构域,相对分子质量为42.19 kD,等电点为8.87;与玉米(Zea mays)相应的同源基因亲缘关系最近;亚细胞定位主要在细胞核;具较强的亲水性;蛋白互作网络分析表明,SbSBP15可与蛋白激酶相互作用。qRT-PCR分析表明,SbSBP15在高粱茎中表达量最高,受干旱和盐胁迫诱导表达;植物激素吲哚乙酸(indole-3-acetic acid... 

【文章来源】:农业生物技术学报. 2020,28(09)北大核心

【文章页数】:13 页

【部分图文】:

高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析


SbSBP15基因的组织特异性表达

基因,盐胁迫,组织特异性,激素


SbSBP15基因在模拟干旱及盐胁迫条件下的表达分析

元件,基因,质粒,茉莉


利用Plantcare网站预测顺势作用元件显示,SbSBP15不仅存在较丰富的CAT框、CAAT框及TATA框、种子特异性表达元件A-box、分生组织特异性表达元件CCGTCC-motif,还存在丰富的生物或非生物抗性的顺势作用元件,包括胁迫响应元件(stress response element,STRE)、伤害响应元件as-1及WRE3 (Wnt response element 3)、光响应元件G-box、脱落酸响应元件(ABA response element,ABRE)、MYB蛋白结合位点的CCAAT框和Myb-binding、低温响应因子Unnamed_4、干旱响应元件MYB、参与茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)反应的顺式作用调控元件CGTCA-motif及TGACG-motif。上述结果提示,SbSBP15基因可能参与高粱应对胁迫的反应。2.3.2 SbSBP15基因组织表达分析

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3032914

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