高粱转录因子基因SbSBP15的克隆及表达分析
发布时间:2021-02-14 01:42
SQUA启动子结合蛋白-box (SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box, SBP-box)基因家族编码一类植物特有的SBP转录因子,在植物界分布广泛,参与植物生长、发育、繁衍等多方面调控,包括胚胎发生、次生产物合成、胁迫应答等,在作物改良方面具有价值。本研究主要通过生物信息学以及实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)方法,对高粱(Sorghum bicolor) SbSBP15基因进行克隆和表达分析。研究结果显示,该基因CDS全长1 227 bp (GenBank No. MT634207),编码408个氨基酸。SbSBP15蛋白含有1个典型SBP结构域,相对分子质量为42.19 kD,等电点为8.87;与玉米(Zea mays)相应的同源基因亲缘关系最近;亚细胞定位主要在细胞核;具较强的亲水性;蛋白互作网络分析表明,SbSBP15可与蛋白激酶相互作用。qRT-PCR分析表明,SbSBP15在高粱茎中表达量最高,受干旱和盐胁迫诱导表达;植物激素吲哚乙酸(indole-3-acetic acid...
【文章来源】:农业生物技术学报. 2020,28(09)北大核心
【文章页数】:13 页
【部分图文】:
SbSBP15基因的组织特异性表达
SbSBP15基因在模拟干旱及盐胁迫条件下的表达分析
利用Plantcare网站预测顺势作用元件显示,SbSBP15不仅存在较丰富的CAT框、CAAT框及TATA框、种子特异性表达元件A-box、分生组织特异性表达元件CCGTCC-motif,还存在丰富的生物或非生物抗性的顺势作用元件,包括胁迫响应元件(stress response element,STRE)、伤害响应元件as-1及WRE3 (Wnt response element 3)、光响应元件G-box、脱落酸响应元件(ABA response element,ABRE)、MYB蛋白结合位点的CCAAT框和Myb-binding、低温响应因子Unnamed_4、干旱响应元件MYB、参与茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)反应的顺式作用调控元件CGTCA-motif及TGACG-motif。上述结果提示,SbSBP15基因可能参与高粱应对胁迫的反应。2.3.2 SbSBP15基因组织表达分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于PCR的两步法丝状真菌基因敲除方法[J]. 谢鑫,蒋君梅,王勇,任明见. 种子. 2019(04)
[2]酿酒高粱研究刍议[J]. 季树太,王佐民,郭书刚. 酿酒. 2019(02)
[3]影响植物叶片衰老因素的研究进展[J]. 初梦圆,于延冲. 生命科学. 2019(02)
[4]SbSBP5基因参与高粱对干旱胁迫的响应[J]. 常建忠,董春林,张正,杨睿,蒋丹,张一中,张彦琴,杨丽莉,闫凤霞. 植物遗传资源学报. 2019(05)
[5]小麦SBP基因家族生物信息学分析[J]. 吕亮杰,陈希勇,胡梦芸,刘玉平,孙丽静,马乐,李辉. 华北农学报. 2018(06)
[6]桃ERF转录因子家族生物信息学分析及芽萌发相关基因筛选[J]. 赵雪惠,王庆杰,李晨,陈修德,肖伟,高东升,付喜玲. 植物学报. 2018(05)
[7]菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析[J]. 胡利宗,王俊生,刘红占,赵锦慧,王秋霞,纪秀娥. 分子植物育种. 2018(14)
[8]葡萄SBP-box转录因子家族的生物信息学分析及其应答激素调控葡萄果实成熟的作用[J]. 崔梦杰,王晨,冷翔鹏,吴伟民,汤崴,张文颖,朱旭东,贾海锋,沈文飚,房经贵. 南京农业大学学报. 2018(03)
[9]毛竹SBP转录因子基因的全基因组鉴定和表达分析[J]. 孙化雨,杨意宏,娄永峰,李利超,赵韩生,王思宁,高志民. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[10]运用TMHMM软件对水稻水通道蛋白OsPIP2:6跨膜结构的分析[J]. 姚清国. 河南农业. 2017(29)
本文编号:3032914
【文章来源】:农业生物技术学报. 2020,28(09)北大核心
【文章页数】:13 页
【部分图文】:
SbSBP15基因的组织特异性表达
SbSBP15基因在模拟干旱及盐胁迫条件下的表达分析
利用Plantcare网站预测顺势作用元件显示,SbSBP15不仅存在较丰富的CAT框、CAAT框及TATA框、种子特异性表达元件A-box、分生组织特异性表达元件CCGTCC-motif,还存在丰富的生物或非生物抗性的顺势作用元件,包括胁迫响应元件(stress response element,STRE)、伤害响应元件as-1及WRE3 (Wnt response element 3)、光响应元件G-box、脱落酸响应元件(ABA response element,ABRE)、MYB蛋白结合位点的CCAAT框和Myb-binding、低温响应因子Unnamed_4、干旱响应元件MYB、参与茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)反应的顺式作用调控元件CGTCA-motif及TGACG-motif。上述结果提示,SbSBP15基因可能参与高粱应对胁迫的反应。2.3.2 SbSBP15基因组织表达分析
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于PCR的两步法丝状真菌基因敲除方法[J]. 谢鑫,蒋君梅,王勇,任明见. 种子. 2019(04)
[2]酿酒高粱研究刍议[J]. 季树太,王佐民,郭书刚. 酿酒. 2019(02)
[3]影响植物叶片衰老因素的研究进展[J]. 初梦圆,于延冲. 生命科学. 2019(02)
[4]SbSBP5基因参与高粱对干旱胁迫的响应[J]. 常建忠,董春林,张正,杨睿,蒋丹,张一中,张彦琴,杨丽莉,闫凤霞. 植物遗传资源学报. 2019(05)
[5]小麦SBP基因家族生物信息学分析[J]. 吕亮杰,陈希勇,胡梦芸,刘玉平,孙丽静,马乐,李辉. 华北农学报. 2018(06)
[6]桃ERF转录因子家族生物信息学分析及芽萌发相关基因筛选[J]. 赵雪惠,王庆杰,李晨,陈修德,肖伟,高东升,付喜玲. 植物学报. 2018(05)
[7]菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析[J]. 胡利宗,王俊生,刘红占,赵锦慧,王秋霞,纪秀娥. 分子植物育种. 2018(14)
[8]葡萄SBP-box转录因子家族的生物信息学分析及其应答激素调控葡萄果实成熟的作用[J]. 崔梦杰,王晨,冷翔鹏,吴伟民,汤崴,张文颖,朱旭东,贾海锋,沈文飚,房经贵. 南京农业大学学报. 2018(03)
[9]毛竹SBP转录因子基因的全基因组鉴定和表达分析[J]. 孙化雨,杨意宏,娄永峰,李利超,赵韩生,王思宁,高志民. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[10]运用TMHMM软件对水稻水通道蛋白OsPIP2:6跨膜结构的分析[J]. 姚清国. 河南农业. 2017(29)
本文编号:3032914
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3032914.html
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