水貂FGF5基因多态性及其与毛长性状的关联分析
发布时间：2021-03-11 08:12
本研究旨在检测水貂成纤维细胞生长因子5（fibroblast growth factor 5, FGF5）基因多态性,解析该基因变异位点与水貂毛长性状的相关性。首先对30只美国短毛黑水貂的FGF5基因部分序列进行了扩增和测序;使用DNAMAN软件分析发现,FGF5基因内含子1中T376C位点存在多态性位点;通过在线酶切软件NEBcutter V2.0分析表明,Taq I内切酶可用于该SNP位点基因分型。以美国短毛黑水貂和丹麦咖啡水貂共计252个血液样本的基因组DNA作为模板,采用PCR-RFLP技术对252只美国短毛黑水貂和丹麦咖啡水貂FGF5基因T376C位点进行了基因分型,并将该位点与水貂毛长性状进行关联分析。结果表明:PCR扩增片段在376位点存在突变,该位点存在2个等位基因T和C,形成TT、TC和CC 3种基因型,该变异位点在美国短毛黑水貂群体中为中度多态（0.25 <PIC <0.05）,而在丹麦咖啡水貂群体中表现为高度多态（PIC> 0.25）;X2检验结果显示,T376C位点在美国短毛黑水貂群体处于Hardy-Weinberg平衡状...
【文章来源】：特产研究. 2020,42(05)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
CC、TC和TT基因型的测序峰图
芍??FGF5基因T376C位点存在3种基因型，分别为TT（621bp）、TC（621、376和245bp）和CC（376和245bp）。123456M7891011621bp376bp245bp注：M.DNAMarker(8000、5000、3000、2000、1000、750、500、250、100bp)；1、2、6、7均为CC基因型；3、4、5、8、10、11均为TC基因型；9为TT基因型。Note:M.DNAMarker(8000,5000,3000,2000,1000,750,500,250,100bp);1,2,6,7wereCCgenotype;3,4,5,8,10,11wereCCgenotype;9.TTgenotype.图2FGF5基因T376C位点的酶切分析结果Fig.2ResultsofFGF5T376ClocusdigestedwithⅠenzyme2.3FGF5基因型频率和等位基因频率分布由表1可知，美国短毛黑水貂群体中检测到3种基因型，以CC型居多，TC型次之，TT型最少，而C等位基因频率高于T等位基因频率；咖啡水貂群体中以TC型居多，CC型次之，TT型最少，而C等位基因频率与T等位基因频率相差不大。表1FGF5基因T376C位点的基因型频率和等位基因频率Table1GenotypefrequencyandallelefrequencyofFGF5T376Clocus群体Population基因型频率Genotypefrequency等位基因频率AllelefrequencyTTTCCCTCDH0.0080.0780.9140.0480.952KF0.0150.8170.1680.4230.577注：DH为美国短毛黑水貂群体，KF为丹麦咖啡水貂群体。Note:DHrepresentsAmericanshort-hairedblackmink,KFrepresentsDen-markcoffeemink.2.4不同水貂品种FGF5基因T376C位点的遗传多样性分析由表2可知，T376C多态位点在美国短毛黑水貂群体中为中度多态（0.25＜PIC＜0.05），而在丹麦咖啡水貂群体中表现为高度多态（PIC＞
【参考文献】：
期刊论文
[1]水貂阿片黑皮质素前体POMC基因SNPs检测及其与生长性状的关联分析[J]. 刘琳玲,宋姗姗,丛波,刘宗岳,宋兴超,杨福合,彭英华,邱宏坤. 特产研究. 2019(04)
[2]美国短毛黑水貂快速生长过程中转录组差异表达分析[J]. 荣敏,张然然,涂剑峰,王天娇,孙丽敏,杨颖,徐佳萍,邢秀梅. 畜牧兽医学报. 2019(09)
[3]绵羊FGF5基因Exon 3多态性对毛用性状的影响[J]. 张立春,尹峰,柳俭强,李梦姝,王春昕,曹阳,朴庆林,金海国,张明新. 中国草食动物科学. 2018(06)
[4]水貂TYR基因T138A位点多态性及其与毛色性状的关联分析[J]. 宋兴超,徐超,刘宗岳,杨童奥,岳志刚,刘琳玲,丛波,杨福合. 中国畜牧兽医. 2017(10)
[5]水貂种类和配种方案与产仔数的关系[J]. 张秀玲,刘春杨,李兰会,王立泽,周荣艳,李祥龙. 家畜生态学报. 2015(08)
[6]不同品种水貂毛皮品质比较[J]. 丛波,刘琳玲,宋兴超,王雷,杨福合. 黑龙江畜牧兽医. 2015(06)
[7]獭兔KAP和FGF5基因的多态性与经济性状的关系[J]. 宦霞娟,陈玉林. 西北农业学报. 2009(06)
[8]不同绵羊品种FGF5基因的多态性分析[J]. 高爱琴,李宁,赵兴波,李金泉. 畜牧兽医学报. 2006(04)
硕士论文
[1]FGF5基因敲除辽宁绒山羊胎儿成纤维细胞系的构建[D]. 曾晓晨.吉林农业大学 2017
本文编号：3076162
【文章来源】：特产研究. 2020,42(05)
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
CC、TC和TT基因型的测序峰图
芍??FGF5基因T376C位点存在3种基因型，分别为TT（621bp）、TC（621、376和245bp）和CC（376和245bp）。123456M7891011621bp376bp245bp注：M.DNAMarker(8000、5000、3000、2000、1000、750、500、250、100bp)；1、2、6、7均为CC基因型；3、4、5、8、10、11均为TC基因型；9为TT基因型。Note:M.DNAMarker(8000,5000,3000,2000,1000,750,500,250,100bp);1,2,6,7wereCCgenotype;3,4,5,8,10,11wereCCgenotype;9.TTgenotype.图2FGF5基因T376C位点的酶切分析结果Fig.2ResultsofFGF5T376ClocusdigestedwithⅠenzyme2.3FGF5基因型频率和等位基因频率分布由表1可知，美国短毛黑水貂群体中检测到3种基因型，以CC型居多，TC型次之，TT型最少，而C等位基因频率高于T等位基因频率；咖啡水貂群体中以TC型居多，CC型次之，TT型最少，而C等位基因频率与T等位基因频率相差不大。表1FGF5基因T376C位点的基因型频率和等位基因频率Table1GenotypefrequencyandallelefrequencyofFGF5T376Clocus群体Population基因型频率Genotypefrequency等位基因频率AllelefrequencyTTTCCCTCDH0.0080.0780.9140.0480.952KF0.0150.8170.1680.4230.577注：DH为美国短毛黑水貂群体，KF为丹麦咖啡水貂群体。Note:DHrepresentsAmericanshort-hairedblackmink,KFrepresentsDen-markcoffeemink.2.4不同水貂品种FGF5基因T376C位点的遗传多样性分析由表2可知，T376C多态位点在美国短毛黑水貂群体中为中度多态（0.25＜PIC＜0.05），而在丹麦咖啡水貂群体中表现为高度多态（PIC＞
【参考文献】：
期刊论文
[1]水貂阿片黑皮质素前体POMC基因SNPs检测及其与生长性状的关联分析[J]. 刘琳玲,宋姗姗,丛波,刘宗岳,宋兴超,杨福合,彭英华,邱宏坤. 特产研究. 2019(04)
[2]美国短毛黑水貂快速生长过程中转录组差异表达分析[J]. 荣敏,张然然,涂剑峰,王天娇,孙丽敏,杨颖,徐佳萍,邢秀梅. 畜牧兽医学报. 2019(09)
[3]绵羊FGF5基因Exon 3多态性对毛用性状的影响[J]. 张立春,尹峰,柳俭强,李梦姝,王春昕,曹阳,朴庆林,金海国,张明新. 中国草食动物科学. 2018(06)
[4]水貂TYR基因T138A位点多态性及其与毛色性状的关联分析[J]. 宋兴超,徐超,刘宗岳,杨童奥,岳志刚,刘琳玲,丛波,杨福合. 中国畜牧兽医. 2017(10)
[5]水貂种类和配种方案与产仔数的关系[J]. 张秀玲,刘春杨,李兰会,王立泽,周荣艳,李祥龙. 家畜生态学报. 2015(08)
[6]不同品种水貂毛皮品质比较[J]. 丛波,刘琳玲,宋兴超,王雷,杨福合. 黑龙江畜牧兽医. 2015(06)
[7]獭兔KAP和FGF5基因的多态性与经济性状的关系[J]. 宦霞娟,陈玉林. 西北农业学报. 2009(06)
[8]不同绵羊品种FGF5基因的多态性分析[J]. 高爱琴,李宁,赵兴波,李金泉. 畜牧兽医学报. 2006(04)
硕士论文
[1]FGF5基因敲除辽宁绒山羊胎儿成纤维细胞系的构建[D]. 曾晓晨.吉林农业大学 2017
本文编号：3076162
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3076162.html
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